[發(fā)明專利]一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201711314308.3 | 申請日: | 2017-12-12 |
| 公開(公告)號: | CN108171683B | 公開(公告)日: | 2021-12-14 |
| 發(fā)明(設計)人: | 何加銘 | 申請(專利權)人: | 杭州鍵一生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/66;G06T5/00;G06T5/40 |
| 代理公司: | 寧波甬致專利代理有限公司 33228 | 代理人: | 潘李亮 |
| 地址: | 311225 浙江省杭州市大*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 采用 軟件 自動識別 細胞 計數(shù) 方法 | ||
1.一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于,它包括以下步驟:
S1、采集圖像;
S2、對采集到的圖像進行圖像增強;
S3、將增強后的圖像進行均值偏移分割,然后進行漫水填充;
S4、將填充后的圖像使用并查集算法進行統(tǒng)計,得到每個連通塊的坐標,然后篩選出內部像素點數(shù)量大于X的連通塊,將篩選出來的連通塊的坐標映射到步驟S2中增強后的圖像上;
S5、將映射完后的圖像進行graph-based算法進行處理,并再次用并查集算法進行統(tǒng)計得到每個連通塊的坐標;
S6、計算每個連通塊的自身尺寸,然后根據(jù)細胞的實際大小進行初步篩選;
S7、對初步篩選完的圖像中每一個連通塊求Hu不變矩7個特征,然后組成n*7向量作為數(shù)據(jù),進行k-means聚類,然后得到支持向量機模型;
S8、將步驟S6初步篩選完后得到的圖像通過步驟S7得到的支持向量機模型進行訓練;
S9、將步驟S8得到的圖像剔除干擾顏色區(qū)域,然后再進行二次篩選;
S10、求出二次篩選后圖像中剩余的連通塊數(shù)量,然后即得到圖像中細胞的數(shù)量。
2.根據(jù)權利要求1所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于:步驟S2圖像增強主要采用平滑加拉普拉斯算子方法與直方圖均衡化方法。
3.根據(jù)權利要求1所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于,步驟S6主要包括以下步驟:
S61、去除連通塊中尺寸較大或者較小的連通塊;
S62、去除連通塊周長與尺寸比例不符合預設條件的連通塊。
4.根據(jù)權利要求3所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于,步驟S6還包括以下步驟:
S63、去除連通塊尺寸與外接矩形框比例不符合預設條件的連通塊;S64、去除連通塊外接矩形框長和寬比例不符合預設條件的連通塊。
5.根據(jù)權利要求1所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于:步驟S9中的二次篩選是指去除連通塊周長與尺寸比例不符合預設條件的區(qū)域。
6.根據(jù)權利要求1所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于,步驟S10具體包括以下步驟:
S101、求出二次篩選后圖像中剩余的連通塊的質心;
S102、計算質心之間的相互距離,然后去除質心距離小于Y的兩個質心的其中一個;
S103、計算剩余質心的數(shù)量,即得到圖像中細胞的數(shù)量。
7.根據(jù)權利要求6所述的一種采用軟件自動識別的細胞計數(shù)方法,其特征在于,步驟S102具體包括以下步驟:
S1021、將所有質心設置成一個質心合集,然后選擇其中一個質心作為基礎質心,然后將其余質心均作為比對質心;
S1022、選擇其中一個比對質心,然后計算基礎質心與選擇的比對質心之間的距離;
S1023、若計算出來的質心距離小于Y,則將這個比對質心從質心合集中刪除,然后繼續(xù)選擇其他比對質心,重復步驟S1023,直到所有的比對質心均已經(jīng)選擇完畢,則跳轉到下一步;若計算出來的質心距離大于Y,則繼續(xù)選擇其他比對質心,重復步驟S1023,直到所有的比對質心均已經(jīng)選擇完畢,則跳轉到下一步;
S1024、從質心合集中再選擇一個質心作為基礎質心,將質心合集內的其余質心均作為比對質心,然后重步驟S1022到步驟S1023,直到質心合集內剩余的質心均已經(jīng)做過基礎質心了。
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