[發明專利]一種輔助檢測豬100kg背膘厚的方法

有效

• 申請號: 201711292115.2
• 申請日: 2017-12-08
• 公開（公告）號: CN108359733B
• 公開（公告）日: 2021-04-02
• 發明（設計）人: 張龍超;王立賢;蒲蕾;王立剛
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京鼎佳達知識產權代理事務所(普通合伙) 11348
• 代理人: 侯蔚寰

本發明公開一種一種輔助檢測豬100kg背膘厚的方法。本發明公開的方法可對待選豬進行早期篩選，有效地緩解實際生產中的選取優良種豬時間長的問題，降低了育種花費，有效降低或提高實際生產中的豬100kg背膘厚，該方法準確度高，檢測費用低，并可實現自動化檢測，在豬的育種方面具有很高的實踐應用價值。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，涉及一種輔助檢測豬100kg背膘厚的方法。

背景技術

鑒于豬100kg背膘厚性狀是影響豬生長速度、瘦肉率及胴體分級的重要因素之一，一直以來，100kg背膘厚性狀是世界范圍內種豬育種的重點經濟性狀之一。因此，針對這種性狀，研究者們開展了大量的分子研究工作。其中，QTL定位研究表明，豬7號染色體上存在一個豬100kg背膘厚性狀QTL區間，次區間的范圍為50.3-120.7Mb(Malek M,Dekkers JC,Lee HK,Baas TJ,Rothschild MF.A molecular genome scan analysis to identifychromosomal regions influencing economic traits in the pig.I.Growth and bodycomposition.Mamm Genome 2001,12(8):630-636.)。因此，研究此區間內影響100kg背膘厚性狀的分子標記單倍型成為了研究重點工作之一。

發明內容

本發明的第一個目的是提供一種與豬100kg背膘厚相關的方法及其應用。

本發明所提供的應用具體可為如下：豬基因組中由如下3個SNP位點組成的單倍型多態性在輔助檢測待測豬的100kg背膘厚中的應用。

本發明所提供的應用具體可為如下中的任一種：(1)豬基因組中如下SNP位點的單核苷酸多態性在鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚中的應用；(2)用于檢測豬基因組中如下SNP位點的單核苷酸多態性的物質在鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚中的應用。

所述SNP位點為：以豬基因組DNA為模板，采用由序列表中序列1所示的單鏈DNA和序列表中序列2所示的單鏈DNA組成的引物對進行PCR擴增所得擴增產物的自5’末端起第214位核苷酸；所述SNP位點處的核苷酸為A或G。

該SNP位點位于GPX2基因內的國際豬基因組10.2版本參考序列7號染色體上第95392358個核苷酸位點AG突變(記為g.95392358AG)。

本發明的第二個目的是提供一種用于鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚的試劑。

本發明所提供的用于鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚的試劑，是用于檢測豬基因組中SNP位點(g.95392358AG)的單核苷酸多態性的物質；

所述“用于檢測豬基因組中如下SNP位點的單核苷酸多態性的物質”可以能夠鑒定SNP位點(g.95392358AG)的單核苷酸多態性的任何物質，如為如下(a)或(b)所示的引物對：

(a)由序列表中序列1所示的單鏈DNA和序列表中序列2所示的單鏈DNA組成的引物對；

(b)由將序列表中序列1和序列2經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所

示的兩條單鏈DNA分子組成的，且與(a)中所述引物對功能相同的引物對。

本發明的第三個目的是提供一種用于鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚的試劑盒。

本發明所提供的用于鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚的試劑盒，含有所述試劑。

所述試劑或所述試劑盒在鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚中的應用也屬于本發明的保護范圍。

本發明的第四個目的是提供一種鑒定或輔助鑒定待測豬的100kg背膘厚的方法。