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[發(fā)明專利]接頭封閉序列、文庫構(gòu)建試劑盒及測序文庫的構(gòu)建方法在審

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 201711209208.4 申請(qǐng)日: 2017-11-27
公開(公告)號(hào): CN108456713A 公開(公告)日: 2018-08-28
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 李萍;梁永;單光宇;高連菊;臧晚春 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 天津諾禾致源生物信息科技有限公司
主分類號(hào): C12Q1/6806 分類號(hào): C12Q1/6806;C40B50/06;C12N15/11
代理公司: 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11240 代理人: 韓建偉;謝湘寧
地址: 301700 天津市*** 國省代碼: 天津;12
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 封閉 修飾 測序文庫 文庫構(gòu)建 試劑盒 構(gòu)建 捕獲 非目標(biāo)區(qū)域 磷酸化修飾 接頭連接 胞苷酸 間壁 脫氧
【權(quán)利要求書】:

1.一種接頭封閉序列,其特征在于,所述接頭封閉序列包括:P5接頭封閉序列,所述P5接頭封閉序列具有SEQ ID NO:1所示序列:AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATC,且所述SEQ ID NO:1所示序列的3’末端存在反向dT修飾、間壁修飾、雙脫氧胞苷酸修飾及磷酸化修飾中的任一種。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的接頭封閉序列,其特征在于,所述接頭封閉序列還包括:P7接頭封閉序列,所述P7接頭封閉序列具有SEQ ID NO:2所示序列:CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATNGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATC,其中N代表index的反向互補(bǔ)序列,且所述SEQ ID NO:2所示序列的3’末端存在反向dT修飾、間壁修飾、雙脫氧胞苷酸修飾及磷酸化修飾中的任一種。

3.一種文庫構(gòu)建試劑盒,包括接頭封閉劑,其特征在于,所述接頭封閉劑中含有權(quán)利要求1或2所述的接頭封閉序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述接頭封閉試劑中,所述接頭封閉序列的工作濃度為0.1.~0.25nM。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括插入片段中重復(fù)序列封閉劑;優(yōu)選所述插入片段中重復(fù)序列封閉劑為Cot-1 DNA。

6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括雜交捕獲試劑。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述雜交捕獲試劑為DNA雜交捕獲試劑,優(yōu)選所述DNA雜交捕獲試劑為IDT公司的DNA雜交捕獲試劑。

8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述雜交捕獲試劑為RNA雜交捕獲試劑,優(yōu)選所述RNA雜交捕獲試劑為Agilent公司的RNA雜交捕獲試劑。

9.一種測序文庫的構(gòu)建方法,所述構(gòu)建方法包括預(yù)擴(kuò)增文庫的構(gòu)建、接頭封閉、液相雜交捕獲以及捕獲文庫擴(kuò)增的步驟,其特征在于,所述接頭封閉的步驟中采用權(quán)利要求1或2所述的接頭封閉序列進(jìn)行封閉,或者采用權(quán)利要求3至9中任一項(xiàng)所述的試劑盒中的封閉試劑進(jìn)行封閉。

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說明:

1、專利原文基于中國國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局專利說明書;

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