[發(fā)明專利]接頭封閉序列、文庫構(gòu)建試劑盒及測序文庫的構(gòu)建方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201711209208.4 | 申請(qǐng)日: | 2017-11-27 |
| 公開(公告)號(hào): | CN108456713A | 公開(公告)日: | 2018-08-28 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李萍;梁永;單光宇;高連菊;臧晚春 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 天津諾禾致源生物信息科技有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6806 | 分類號(hào): | C12Q1/6806;C40B50/06;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11240 | 代理人: | 韓建偉;謝湘寧 |
| 地址: | 301700 天津市*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 封閉 修飾 測序文庫 文庫構(gòu)建 試劑盒 構(gòu)建 捕獲 非目標(biāo)區(qū)域 磷酸化修飾 接頭連接 胞苷酸 間壁 脫氧 | ||
1.一種接頭封閉序列,其特征在于,所述接頭封閉序列包括:P5接頭封閉序列,所述P5接頭封閉序列具有SEQ ID NO:1所示序列:AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATC,且所述SEQ ID NO:1所示序列的3’末端存在反向dT修飾、間壁修飾、雙脫氧胞苷酸修飾及磷酸化修飾中的任一種。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的接頭封閉序列,其特征在于,所述接頭封閉序列還包括:P7接頭封閉序列,所述P7接頭封閉序列具有SEQ ID NO:2所示序列:CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATNGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATC,其中N代表index的反向互補(bǔ)序列,且所述SEQ ID NO:2所示序列的3’末端存在反向dT修飾、間壁修飾、雙脫氧胞苷酸修飾及磷酸化修飾中的任一種。
3.一種文庫構(gòu)建試劑盒,包括接頭封閉劑,其特征在于,所述接頭封閉劑中含有權(quán)利要求1或2所述的接頭封閉序列。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述接頭封閉試劑中,所述接頭封閉序列的工作濃度為0.1.~0.25nM。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括插入片段中重復(fù)序列封閉劑;優(yōu)選所述插入片段中重復(fù)序列封閉劑為Cot-1 DNA。
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括雜交捕獲試劑。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述雜交捕獲試劑為DNA雜交捕獲試劑,優(yōu)選所述DNA雜交捕獲試劑為IDT公司的DNA雜交捕獲試劑。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述雜交捕獲試劑為RNA雜交捕獲試劑,優(yōu)選所述RNA雜交捕獲試劑為Agilent公司的RNA雜交捕獲試劑。
9.一種測序文庫的構(gòu)建方法,所述構(gòu)建方法包括預(yù)擴(kuò)增文庫的構(gòu)建、接頭封閉、液相雜交捕獲以及捕獲文庫擴(kuò)增的步驟,其特征在于,所述接頭封閉的步驟中采用權(quán)利要求1或2所述的接頭封閉序列進(jìn)行封閉,或者采用權(quán)利要求3至9中任一項(xiàng)所述的試劑盒中的封閉試劑進(jìn)行封閉。
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