[發(fā)明專利]一種雙脫氧核苷封閉的寡核苷酸的制備方法及其應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201711049299.X | 申請日: | 2017-10-31 |
| 公開(公告)號: | CN109735607A | 公開(公告)日: | 2019-05-10 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張弛宇;張夢玲;胡軼紅 | 申請(專利權(quán))人: | 中國科學(xué)院上海巴斯德研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 上海一平知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;肖艷 |
| 地址: | 200025 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 引物 雙脫氧核苷酸 寡核苷酸 制備 脫氧核苷 封閉 末端轉(zhuǎn)移酶 催化脫氧 等位基因 核苷酸 脫氧 擴增 聯(lián)用 羥基 催化 修飾 突變 應(yīng)用 檢測 延伸 | ||
1.一種檢測突變體的試劑,其特征在于,所述的試劑包括以下組分:
(a)第一引物,所述第一引物結(jié)構(gòu)如下式I所示:
Z1-F1 (I)
式中,
F1為任選的熒光基團或淬滅基團;
Z1為互補結(jié)合區(qū),長度為L1個核苷酸;
其中,Z1任選的與F2相連,其中F2為任選的熒光基團或淬滅基團;并且F1和F2兩者中一個為熒光基團,另一個為淬滅基團;
(b)第二引物,所述第二引物為正常引物或與第一引物結(jié)構(gòu)相同;
(c)高保真DNA聚合酶,所述高保真DNA聚合酶為具有外切活性的DNA聚合酶;和
(d)非高保真DNA聚合酶,所述非高保真DNA聚合酶不具有外切活性的DNA聚合酶;
(e)末端轉(zhuǎn)移酶;和
(f)ddNTP。
2.如權(quán)利要求1所述的試劑,其特征在于,所述高保真DNA聚合酶選自下組:KODTMDNA聚合酶、HS DNA聚合酶、Q5TM超保真DNA聚合酶,pfu DNA聚合酶,Blend Taq DNA聚合酶、Phi9DNA聚合酶、Klenow酶、或其組合。
3.如權(quán)利要求1所述的試劑,其特征在于,所述非高保真DNA聚合酶選自下組:Taq DNA聚合酶、Tth DNA聚合酶、或其組合。
4.如權(quán)利要求1所述的試劑,其特征在于,所述高保真DNA聚合酶與非高保真DNA聚合酶的比例為(0.01-0.5):1,較佳地為(0.03-0.2):1;更佳地為(0.04-0.08):1。
5.如權(quán)利要求1所述的試劑,其特征在于,所述末端轉(zhuǎn)移酶的添加量為0.3-1U/μl,較佳地,0.6-0.95U/μl,更佳地,0.80-0.93U/μl。
6.一種核酸擴增體系,其特征在于,所述的體系包括:用于擴增的緩沖體系和位于所述體系中的權(quán)利要求1所述的試劑。
7.一種核酸擴增方法,其特征在于,所述方法包括步驟:利用如權(quán)利要求1所述的試劑或如權(quán)利要求6所述的擴增體系,對待測樣品進行核酸擴增。
8.一種非治療性和非診斷性檢測突變體的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
(a)利用如權(quán)利要求1所述的試劑、權(quán)利要求6所述的體系或權(quán)利要求7所述的方法,對待測樣品進行實時熒光核酸擴增;和(b)分析實時熒光核酸擴增反應(yīng)擴增曲線,從而判定所述待測樣品是否存在突變、和/或確定所述待測樣品的突變位點。
9.一種如權(quán)利要求1所述的試劑、權(quán)利要求6所述的體系或權(quán)利要求7所述的方法的用途,其特征在于,用于點突變、單核苷酸多態(tài)性、插入和缺失突變的單重或多重檢測。
10.一種試劑盒,其特征在于,所述試劑盒中包括:(a)如權(quán)利要求1所述的試劑;(b)容器。
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