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[發明專利]CRISPR/CAS9介導藥物轉運體靶向性敲除的caco?2細胞模型及其方法在審

專利信息
申請號: 201710911586.0 申請日: 2017-09-29
公開(公告)號: CN107760652A 公開(公告)日: 2018-03-06
發明(設計)人: 黃黎珍;鐘國瑞;謝水林;龐土慧;姜二崗;鄒淑香;李浩健;戴仁科 申請(專利權)人: 華南理工大學
主分類號: C12N5/10 分類號: C12N5/10;C12N15/85
代理公司: 廣州粵高專利商標代理有限公司44102 代理人: 何淑珍
地址: 510006 廣東省*** 國省代碼: 廣東;44
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: crispr cas9 藥物 轉運 靶向 caco 細胞 模型 及其 方法
【說明書】:

技術領域

發明涉及基因工程領域,具體涉及CRISPR/CAS9介導藥物轉運體靶向性敲除的caco-2細胞模型及其方法。

背景技術

藥物轉運研究是新藥研發過程的重要內容。轉運體,通過轉運體進行繼發性主動轉運,即依靠存在于細胞外高濃度鈉離子的勢能(該勢能由原發性主動轉運提供)轉運,即相當于間接消耗ATP的能量。例如小腸粘膜上皮細胞主動吸收葡萄糖的過程中,轉運能量并不直接來自于ATP的分解,而是依靠上皮細胞(低)與腸腔液(高)之間的鈉離子濃度梯度,在鈉離子順濃度梯度進入上皮細胞的同時,葡萄糖逆濃度梯度一同被轉運進細胞。ATP結合轉運體家族主要成員P-gp、BCRP及MRP2參與大量化合物轉運,是目前常用候選轉運體。然而三者底物及抑制劑的交叉反應嚴重影響結果分析。

CRISPR-Cas9具有更快速、簡便、高效、多位點、特異性靶向敲除基因的優勢。CRISPR-Cas9的工作原理是crRNA(CRISPR-derived RNA)通過堿基配對與tracrRNA(trans-activating RNA)結合形成tracrRNA/crRNA復合物,此復合物引導核酸酶Cas9蛋白在與crRNA配對的序列靶位點剪切雙鏈DNA。而通過人工設計這兩種RNA,可以改造形成具有引導作用的sgRNA(singleguide RNA),足以引導Cas9對DNA的定點切割。作為一種RNA導向的dsDNA結合蛋白,Cas9效應物核酸酶是已知的第一個統一因子(unifying factor),能夠共定位RNA、DNA和蛋白,從而擁有巨大的改造潛力。將蛋白與無核酸酶的Cas9(Cas9 nuclease-null)融合,并表達適當的sgRNA,可靶定任何dsDNA序列,而sgRNA的末端可連接到目標DNA,不影響Cas9的結合。因此,Cas9能在任何dsDNA序列處帶來任何融合蛋白及RNA,這為生物體的研究和改造帶來巨大潛力。也為解決上述問題提供了一種可能的選擇。

發明內容

本發明的目的在于提供CRISPR/CAS9介導藥物轉運體靶向性敲除caco-2細胞模型及其方法,以解決上述背景技術中提出的問題。

為實現上述目的,本發明提供如下技術方案。

CRISPR/CAS9介導藥物轉運體靶向性敲除caco-2細胞模型的方法,該方法用于非診斷或治療目的,包括如下步驟:

1)對P-gp、BCRP及MRP2轉運體設計靶點特異性的sgRNA,設計的sgRNA序列如序列表中SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:6所示,構建sgRNA表達載體;

2)利用CRISPR/CAS9分別設計P-gp、BCRP及MRP基因單敲除及兩兩組合雙敲除,與hCas9質粒共轉染caco-2細胞,進行單克隆化擴大培養,即得轉運體基因靶向性的caco-2細胞模型。

優選的,步驟1)中,以U6啟動子表達sgRNA,將設計的sgRNA序列合成Oligo,構建sgRNA表達載體。

本發明還提供由以上方法得到的caco-2細胞模型。

與現有技術相比,本發明的有益效果是:

本發明通過CRISPR/CAS9結合細胞單克隆技術,對ABC家族P-gp、BCRP及MRP進行了系列單敲除或雙敲除,獲得一系列基因敲除的caco-2細胞模型。該caco-2細胞模型將有效排除不同轉運體之間相互干擾,為藥物轉運研究提供更特異、更靈敏的細胞模型。

附圖說明

圖1是靶位點PCR產物T7EI酶切后電泳結果圖;

圖2a是caco-2細胞單克隆(2A10)的示意圖;

圖2b是caco-2細胞單克隆(B14)的示意圖;

圖2c是caco-2細胞單克隆(2M1)的示意圖;

圖3是2A10單克隆敲除純合子鑒定結果圖;

圖4是B14單克隆敲除純合子鑒定結果圖;

圖5是2M1單克隆為2種基因型的敲除純合子鑒定結果圖;

圖6是AM17單克隆的MRP2位點2種基因型的敲除純合子鑒定結果圖;

圖7是AB16單克隆的BCRP位點敲除純合子鑒定結果圖;

圖8是MB11單克隆的BCRP位點2種基因型敲除純合子鑒定結果圖;

圖9a、圖9b是單克隆細胞P-gp和MRP2轉運體蛋白表達檢測結果圖;

圖10是AB5和2A10單克隆的P-gp轉運功能分析結果圖。

具體實施方式

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