[發明專利]單核苷酸多態性位點在創傷膿毒癥風險評估中的應用有效
| 申請號: | 201710905554.X | 申請日: | 2017-09-29 |
| 公開(公告)號: | CN107841551B | 公開(公告)日: | 2021-04-13 |
| 發明(設計)人: | 張安強;蔣建新;陸紅祥;曾靈;文大林;孫劍會;杜娟 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第三軍醫大學第三附屬醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;G16B20/20;G16H50/30 |
| 代理公司: | 北京匯澤知識產權代理有限公司 11228 | 代理人: | 武君 |
| 地址: | 400042 重*** | 國省代碼: | 重慶;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 核苷酸 多態性 創傷 膿毒癥 風險 評估 中的 應用 | ||
1.一種創傷膿毒癥風險評估系統,其特征在于:所述創傷膿毒癥風險評估系統包括數據模塊和分析模塊;
數據模塊包括單核苷酸多態性位點攜帶的等位基因數目,患者傷情程度評分數據,傷后24小時內輸血情況以及傷后首次APACHEII評分;單核苷酸多態性位點包括rs5743551、rs4755453、rs1065489、rs2071746、rs1799983、rs2297518、rs740598和rs7851696;且rs5743551攜帶A等位基因、rs4755453攜帶C等位基因、rs1065489攜帶T等位基因、rs2071746攜帶T等位基因、rs1799983攜帶T等位基因、rs2297518攜帶G等位基因、rs740598攜帶G等位基因和rs7851696攜帶T等位基因;
首次APACHEII評分涉及的數據包括:體溫、平均動脈壓、心率、呼吸頻率、動脈血氣、電解質含量、肌酐、白細胞數量、紅細胞壓積和昏迷指數;
分析模塊用于對數據模塊中的數據進行分析處理,具體分析處理按如下步驟進行:
步驟1,
步驟2,按照步驟1中遺傳危險度評分值確定區間組,其中,第1組G1:0.34-2.35分、第2組G2:2.35-2.90分、第3組G3:2.90-3.75分、第4組G4:3.75-7.24分;
步驟3,根據步驟2中區間組對應的分值計算待測個體患膿毒癥的相對風險,待測個體患膿毒癥的相對風險=exp(-4.804+0.64*G2+0.66*G3+1.11*G4+0.10*ISS+0.23*首次APACHEII評分+1.16*輸血情況)/0.215;
若步驟2中確定為G1組,則G4=0、G2和G3=0,若步驟2中確定為G2組,則G2=1,G4和G3=0;若步驟2中確定為G3組,則G3=1,G4和G2=0;若步驟2中確定為G4組,則G4=1,G2和G3=0。
2.一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,其特征在于,該程序被處理器執行時實現以下步驟:
輸入單元,輸入待測個體臨床數據;
數據存儲單元,存儲多個數據段,包括是否輸血、傷情ISS評分數據、首次APACHEII評分數據、肌酐、白細胞數量、紅細胞壓積和昏迷指數GCS,創傷膿毒癥危險等位基因遺傳貢獻速查圖表數據,創傷膿毒癥遺傳危險度評分分組速查圖表數據;
顯示單元,顯示數據和圖像;
控制單元,執行時實現以下步驟:
步驟C1:輸入待測個體臨床情況,顯示單元顯示輸入的字符,確認,輸出待測個體的首次APACHEII評分值和傷情ISS評分值,確認,繼續步驟C2;
步驟C2:輸入待測個體的8個單核苷酸多態性位點的基因型,確認,輸出待測個體風險等位基因的數目,確認,執行步驟C3;
步驟C3:輸出待測個體遺傳危險度評分值,確認,執行步驟C4;
步驟C4:輸出待測個體遺傳危險度評分值分組,確認,執行步驟C5;若遺傳危險度評分為0.34-2.35,則輸出顯示G1組;若遺傳危險度評分為2.35-2.90,則輸出顯示G2組;若遺傳危險度評分為2.90-3.75,則輸出顯示G3組;若遺傳危險度評分為3.75-7.24,則輸出顯示G4組;
步驟C5:計算待測個體患膿毒癥的相對患病風險=exp(-4.804+0.64*G2+0.66*G3+1.11*G4+0.10*傷情ISS評分值+0.23*首次APACHEII評分+1.16*輸血)/0.215),若步驟C4中顯示G1組,則G4=0、G2和G3=0,若步驟C4中顯示G2組,則G2=1,G4和G3=0;若步驟C4中顯示G3組,則G3=1,G4和G2=0;若步驟C4中顯示G4組,則G4=1,G2和G3=0;輸出待測個體患膿毒癥的相對患病風險值,結束;
單核苷酸多態性位點包括rs5743551、rs4755453、rs1065489、rs2071746、rs1799983、rs2297518、rs740598、rs7851696;rs5743551攜帶A等位基因、rs4755453攜帶C等位基因、rs1065489攜帶T等位基因、rs2071746攜帶T等位基因、rs1799983攜帶T等位基因、rs2297518攜帶G等位基因、rs740598攜帶G等位基因和rs7851696攜帶T等位基因。
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