[發明專利]與甘油三酯水平相關的基因功能性遺傳變異及相關應用

有效

• 申請號: 201710866217.4
• 申請日: 2017-09-22
• 公開（公告）號: CN107447037B
• 公開（公告）日: 2020-02-07
• 發明（設計）人: 魯向鋒;林旭;鄔堂春;顧東風;黎懷星
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院阜外醫院;中國科學院上海生命科學研究院;華中科技大學
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;G01N33/68
• 代理公司: 11127 北京三友知識產權代理有限公司
• 代理人: 韓蕾;姚亮

本發明提供了與甘油三酯水平相關的基因功能性遺傳變異及相關應用；具體而言，本發明提供了檢測來自待測個體的樣品中以下蛋白氨基酸位點和/或其對應的基因位點的試劑材料和/或儀器設備在制備用于評估血脂水平、血脂異常和/或冠心病發病風險的檢測系統中的應用：ACACB基因rs2075260和/或PPARA基因rs1800234遺傳變異分別造成ACACB蛋白第2141位氨基酸和/或PPARA蛋白第227位氨基酸編碼改變。出現ACACBVal2141Ile(rs2075260為A，氨基酸變為Ile)變異的待測個體具有較高的甘油三酯水平和/或較高的血脂異常和/或冠心病發病風險。出現PPARAVal227Ala(rs1800234為C，氨基酸變為Ala)變異的待測個體具有較低的甘油三酯水平和/或較低的血脂異常發病風險。

技術領域

本發明是關于與甘油三酯水平相關的基因功能性遺傳變異及相關應用，具體而言，本發明是關于檢測來自待測個體的樣品中ACACB的Val2141Ile和/或PPARAVal227Ala變異情況的試劑材料和/或儀器設備在制備用于評估血脂水平、血脂異常和/或冠心病發病風險的檢測系統中的應用，還涉及一種評估血脂水平、血脂異常和/或冠心病發病風險的檢測系統。

背景技術

大量研究資料表明，血脂異常是冠心病、心肌梗死、心臟性猝死和缺血性腦卒中的獨立危險因素。它通過加速全身動脈粥樣硬化，對身體造成隱匿、逐漸、進行性、全身性和器質性的損害。研究顯示，人群血膽固醇水平每升高1％，冠心病(CAD)發病增加2％～3％。我國血脂異常患者總數上升呈顯著趨勢，2007～2008年中國國家糖尿病和代謝紊亂研究結果提示，我國20歲以上人群膽固醇水平與2002年相比增加了23.9％，血脂異常已經成為我國居民的重要公共衛生問題。2011年度北京市衛生與人群健康狀況報告數據顯示，北京市常住居民中超半數市民血脂異常，其中18～30歲男性的血脂異常患病率已經達到58.5％。

血漿總膽固醇(TC)、甘油三酯(LDL-C)、高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)和甘油三酯(TG)濃度是心血管疾病最重要的危險因素和治療干預的靶點和目標。世界衛生組織最新資料提示心血管疾病防控獲益中，血脂異常危險因素控制所帶來的貢獻最大。美國1980～2000年期間冠心病死亡下降一半，完全歸功于開展國民膽固醇教育所作出的貢獻。

大多數血脂異常具有復雜的病因機制，是多個基因之間或多個基因與環境因長期相互作用的結果。全基因組關聯研究成功地確定了多個與血脂相關的遺傳位點，然而，幾乎所有這些位點最初都是在歐洲血統的人群中確定的，缺乏亞洲人群中的研究數據。此外，已知基因區域的功能位點往往是少見低頻位點，具有重要的功能意義和臨床意義，研究結果顯示絕大多數功能少見變異(80％)存在著種族特異性。鑒于亞洲人群和歐洲人之間的環境暴露和遺傳背景的差異巨大，因此亟需鑒定亞洲人群特別是中國人群中系統篩查血脂相關的功能變異和少見變異，將有助于對國人高脂血癥預防、新藥開發、診斷和個體化治療。

發明內容

本發明的主要目的在于確定亞洲人群特別是東亞人群特異性的與血脂水平相關的基因功能性遺傳變異，提供通過檢測相關遺傳位點評估血脂水平和/或血脂異常發病風險的方法，并提供評估血脂水平和/或血脂異常發病風險的檢測系統及相關應用。

本案發明人以東亞人群包括中國人、菲律賓人、美籍華人、新加坡籍華裔、新加坡籍馬來西亞人等為研究對象，分析研究了11萬多個遺傳變異與血脂水平的關聯關系，確定了與甘油三酯(TG)水平相關的基因功能性遺傳變異。所述的基因功能性遺傳變異包括以下蛋白氨基酸位點和/或其對應的基因位點的變異：ACACB蛋白第2141位氨基酸和/或PPARA蛋白第227位氨基酸。其中，蛋白氨基酸位點對應的基因位點是指編碼所述蛋白的基因的核苷酸序列中對應所述氨基酸位點的核苷酸位點。優選地，ACACB蛋白第2141位氨基酸對應的基因位點包括ACACB基因rs2075260；PPARA蛋白第227位氨基酸對應的基因位點包括PPARA基因rs1800234。