[發明專利]與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel?Ts3分子標記及其應用

在審

• 申請號: 201710860785.3
• 申請日: 2017-09-21
• 公開（公告）號: CN107586869A
• 公開（公告）日: 2018-01-16
• 發明（設計）人: 蔡潤;潘俊松;王剛;何歡樂;郭春立;肖婷婷;孫敬賢;朱文瑩;張琪
• 申請（專利權）人: 上海交通大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海科盛知識產權代理有限公司31225
• 代理人: 褚明偉

1.一種與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記，其特征在于，該分子標記具有序列表SEQ ID NO.1所示的244個核苷酸序列，以及序列表SEQ ID NO.2所示的234個核苷酸序列，其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列與軟刺基因共分離，SEQ ID NO.2中的核苷酸序列與硬刺基因共分離。

2.根據權利要求1所述的一種與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記，其特征在于，所述分子標記由ME7所示的上游引物和EM8所示的下游引物擴增得到，

所述引物ME7序列，具體為：ME7：5’-ATAACTGATTTGGTCCTCTCTA-3’，

所述引物EM8序列，具體為：EM8：5’-TAACATTTGTAGACCAAGCAT-3’。

3.一種與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記的獲得方法，其特征在于，所述分子標記由ME7所示的上游引物和EM8所示的下游引物擴增得到，

所述引物ME7序列，具體為：ME7：5’-ATAACTGATTTGGTCCTCTCTA-3’，

所述引物EM8序列，具體為：EM8：5’-TAACATTTGTAGACCAAGCAT-3’。

4.根據權利要求3所述一種與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記的獲得方法，其特征在于，反應體系為基因組DNA 30ng，引物0.5μmol/L，200μmol/L dNTPs，2mmol/L MgCl₂，1μl 10×PCR reactions buffer，0.6U TaqDNA聚合酶，總反應體系為10μl，引物為ME7所示上游引物及EM8所示下游引物。

5.根據權利要求3所述一種與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記的獲得方法，其特征在于，PCR擴增程序為：94℃5min，94℃30s，55℃30s，72℃30s，32個循環，擴增產物用8％非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離，電泳緩沖液為0.5×TBE，160W恒功率，電泳3h。

6.如權利要求1所述與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記的應用，其特征在于，所述分子標記用于各種黃瓜硬刺/軟刺類型的篩選。

7.根據權利要求6所述與黃瓜果實軟刺基因Ts共分離的InDel-Ts3分子標記的應用，其特征在于，所述分子標記用于在植物種子期間或子葉長出的早期階段進行鑒定。