[發明專利]一種檢測DGAT1基因突變的引物及其在牦牛乳品質預測和鑒別方法中的應用有效
| 申請號: | 201710648270.7 | 申請日: | 2017-08-01 |
| 公開(公告)號: | CN107447003B | 公開(公告)日: | 2021-02-26 |
| 發明(設計)人: | 胡江;高小莉;劉秀;石斌剛;李少斌 | 申請(專利權)人: | 甘肅農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京中恒高博知識產權代理有限公司 11249 | 代理人: | 姜司晨 |
| 地址: | 730000 *** | 國省代碼: | 甘肅;62 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 dgat1 基因突變 引物 及其 牦牛 乳品 預測 鑒別方法 中的 應用 | ||
1.檢測DGAT1基因的試劑盒在牦牛乳品質預測和鑒別中的應用,所述試劑盒中包括有PCR-SSCP引物對的正向引物、反向引物、牦牛DGAT1*A的DNA標準樣、牦牛DGAT1*B的標準樣和牦牛DGAT1*C的標準樣,所述PCR-SSCP引物對的正向引物的核苷酸序列為序列表中的SEQID NO.1,反向引物的核苷酸序列為序列表中的SEQ ID NO.2;所述牦牛DGAT1*A的DNA標準樣的核苷酸序列為序列表中的SEQ ID NO.3,所述牦牛DGAT1*B的DNA標準樣的核苷酸序列為序列表中的SEQ ID NO.4,所述DGAT1*C的DNA標準樣的核苷酸序列為序列表中的SEQ IDNO.5。
2.一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)采集樣品和提取DNA;
2)待測樣本DNA的PCR擴增,PCR引物對的正向引物的核苷酸序列為序列表中的SEQ IDNO. 1,反向引物的核苷酸序列為序列表中的SEQ ID NO. 2;
3)SSCP電泳檢測,將步驟2)得到的PCR產物進行SSCP電泳,電泳結束后銀染判定基因型,再進行等位基因序列測定;
4)以測定后的等位基因序列進行結果分析,計算等位基因頻率、基因型頻率、純合度、遺傳雜合度和有效等位基因數,同時計算多態信息含量,分析基因突變與胴體及肉品質性狀的相關性。
3.根據權利要求2所述的一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,所述步驟2)中的PCR擴增體系如下:總體積20μL,其中DNA模板0.8μL,正、反向引物各0.8μL,TaKaRa PremixTaq聚合酶10μL,滅菌超純水7.6μL。
4.根據權利要求2所述的一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,所述步驟2)中,PCR擴增時的反應條件為:94℃預變性5min;94℃變性30s,62℃退火30s,72℃延伸30s,共35個循環;最后72℃延伸5min。
5.根據權利要求2所述的一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,所述步驟3)中PCR產物的SSCP電泳檢測過程為:取PCR擴增產物 2μL于滅菌離心管中,加入8μL變性上樣緩沖液,98℃變性10min,迅速冰浴5min后,上樣到12%非變性聚丙烯酰胺凝膠,290V電壓、電泳室溫度19~25℃、電泳槽水循環溫度22℃,進行電泳20h,銀染法顯色后判定基因型。
6.根據權利要求5所述的一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,所述變性上樣緩沖液的組成為:98%的去離子甲酰胺、0.025%的二甲苯氰、0.025 %的溴酚藍、10 mmol/L的EDTA,變性上樣緩沖液的pH值為8.0。
7.根據權利要求5所述的一種牦牛乳品質的鑒別方法,其特征在于,所述的12%非變性聚丙烯酰胺凝膠中,Acr:Bis為37.5:1。
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