[發明專利]MTHFR?A1298C基因多態性快速檢測引物、分子信標、試劑盒及檢測方法在審
| 申請號: | 201710615435.0 | 申請日: | 2017-07-25 |
| 公開(公告)號: | CN107299140A | 公開(公告)日: | 2017-10-27 |
| 發明(設計)人: | 黎幫勇;賀庭禎;向·霄;熊偉 | 申請(專利權)人: | 重慶京因生物科技有限責任公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 重慶強大凱創專利代理事務所(普通合伙)50217 | 代理人: | 成艷 |
| 地址: | 400051 重慶市九龍坡*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | mthfr a1298c 基因 多態性 快速 檢測 引物 分子 信標 試劑盒 方法 | ||
1.MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的試劑盒,其特征在于,包括PCR反應液,PCR反應液的原料及終濃度為,
DNA聚合酶 2.05 U/μL;
dNTPs 0.1-0.5mM;
5X PCR緩沖液 0.5-1.5 X;
MgCl2 1-2.5mM;
十二烷基硫酸鈉 0.0005-0.015%(w/v);
聚乙二醇辛基苯基醚 0.001-0.03%(w/v);
上游引物 0.2-0.7μM;
下游引物 0.2-0.7μM;
突變型分子信標 0.2-0.7μM;
野生型分子信標 0.2-0.7μM;
且其用于檢測細胞樣品。
2.根據權利要求2所述的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的試劑盒,其特征在于:所述的PCR反應液的原料終濃度為:
DNA聚合酶 2.05 U/μL;
dNTPs 0.2mM;
5X PCR緩沖液 1.1X;
MgCl2 2.5mM;
十二烷基硫酸鈉 0.005%(w/v);
聚乙二醇辛基苯基醚 0.01%(w/v);
上游引物 0.7μM
下游引物 0.7μM;
突變型分子信標 0.7μM;
野生型分子信標 0.6μM。
3.根據權利要求3所述的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的試劑盒,其特征在于:所述的細胞樣品為口腔黏膜脫落細胞。
4.根據權利要求4所述的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的試劑盒,其特征在于:還包括有提純的人類基因組DNA基因序列。
5.根據權利要求1~4任意一項所述的試劑盒中的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的引物,其特征在于,
上游引物5’-3’的基因序列為:CTTCTACCTGAAGAGCAAGTCC;
下游引物5’-3’的基因序列為:CAGCATCACTCACTTTGTGACC。
6.利用與權利要求5所述的試劑盒中引物檢測的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的分子信標,其特征在于:
野生型分子信標的5’-3’的基因序列為:
CGCCAGTCAAAGA+CA+CTT+T+CTTCACTCTGGCG;
突變型分子信標的5’-3’的基因序列為:
CGCCAGTTCAAAGACACT+T+G+CTTCACCTGGCG;
且野生型分子信標和突變型分子信標基因序列的5’端和3’端分別設有熒光基團和與熒光基團配合的淬滅基團;+為鎖核酸修飾的堿基。
7.根據權利要求6所述的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測的分子信標,其特征在于:所述的熒光基團為6-Fam標記基團,所述的淬滅基團為BHQ1標記基團;
或者熒光基團為Alexa Fluor 594標記基團,所述的淬滅基團為BHQ2標記基團。
8.利用權利要求6或7所述的引物、分子信標和試劑盒進行的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測方法,其特征在于:操作方法為,
(1)取樣前用水漱口2次,每次大于5秒,漱口后吞咽2-3次;
(2)取取樣裝置的取樣部近90°接觸口腔內腮壁,均勻刮拭5次,上、下為1次;
(3)取樣后將取樣裝置的取樣部插入PCR反應液中,混勻;
(4)取1μL提純的DNA基因序列加入到另一支PCR反應液中,混勻;
(5)將完成加樣的PCR反應液放入定量PCR儀中,運行反應程序。
9.利用權利要求8所述的引物、分子信標和試劑盒進行的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測方法,其特征在于:定量PCR儀的反應程序為:
A、預變性:溫度95℃,5min,1個循環;
B、變性:95℃,8s;
C、退火及延伸:55℃,35s;
D、B及C程序操作50個循環。
10.如權利要求9所述的MTHFR-A1298C、RS1801131基因多態性快速檢測方法,其特征在于:所述的定量PCR儀為雙通道,激發波長分別為450-500nm和550-600nm。
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