[發(fā)明專利]檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的成套引物及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710590585.0 | 申請日: | 2017-07-19 |
| 公開(公告)號: | CN107619854B | 公開(公告)日: | 2020-05-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 郜培杰;張福杰;史亞倫;王旭東;馬鵬飛 | 申請(專利權(quán))人: | 北京安普生化科技有限公司;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京勁創(chuàng)知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11589 | 代理人: | 王闖 |
| 地址: | 100081 北京市*** | 國省代碼: | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測 hiv 耐藥 突變 成套 引物 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的成套引物,所述成套引物含有序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.5所示的核苷酸序列:
SEQ ID No.1:GAAATGATGACAGCATGTCAGGGAG;
SEQ ID No.2:GAAATGATGACAGCATGCCAGGGAG;
SEQ ID No.3:CAAACTCCCACTCAGGAATCCAGGT;
SEQ ID No.4:CAAACTCCCATTCAGGAATCCAGGT;
SEQ ID No.5:CAAATTCCCACTCAGGAATCCAGGT,其中:
所述成套引物用于擴(kuò)增HIV-1基因組的Pol基因蛋白酶和逆轉(zhuǎn)錄酶基因片段,所述基因片段包含蛋白酶基因區(qū)1-99位氨基酸的編碼子和逆轉(zhuǎn)錄酶基因區(qū)1-410位氨基酸的編碼子。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的成套引物,其特征在于:
所述耐藥突變位點(diǎn)為位于HIV-1基因組的Pol基因的核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑相關(guān)位點(diǎn)、非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑相關(guān)位點(diǎn)和蛋白酶抑制劑相關(guān)位點(diǎn)。
3.一種檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,所述試劑盒包括權(quán)利要求1或2所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的成套引物。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,其特征在于:
所述成套引物的量為:SEQ ID No.1所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)與SEQ ID No.3所示的核苷酸序列的引物、SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.5所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)為的比例為1:(1-2)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,其特征在于:所述成套引物的量為:SEQ ID No.1所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)與SEQ ID No.3所示的核苷酸序列的引物、SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.5所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)為的比例為1:(1.2-1.8)。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,其特征在于:所述成套引物的量為:SEQ ID No.1所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)與SEQ ID No.3所示的核苷酸序列的引物、SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.5所示的核苷酸序列的引物的總摩爾數(shù)為的比例為1:1.5。
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,其特征在于:
所述SEQ ID No.1所示的核苷酸序列的引物和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的引物的摩爾數(shù)比為1:1;
SEQ ID No.3所示的核苷酸序列的引物、SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物和SEQID No.5所示的核苷酸序列的引物的摩爾數(shù)比為1:1:1。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,其特征在于:
所述試劑盒中還含有RT-PCR擴(kuò)增試劑。
9.權(quán)利要求1或2所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的成套引物,或者權(quán)利要求3-8中任一項所述的檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的試劑盒,在制備檢測或者輔助檢測HIV-1耐藥突變位點(diǎn)的制劑中的應(yīng)用。
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