[發明專利]膀胱癌組織T細胞圖譜模型及其構建方法和構建系統

在審

• 申請號: 201710576974.8
• 申請日: 2017-07-14
• 公開（公告）號: CN109251980A
• 公開（公告）日: 2019-01-22
• 發明（設計）人: 眭維國;戴勇;馬井生;薛雯
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍第一八一醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/10
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 何平

一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型及其構建方法和構建系統，其中構建方法包括如下步驟：設置疾病組與對照組，其中，疾病組取膀胱癌患者膀胱癌組織的標本待用，對照組取膀胱癌患者膀胱癌旁組織的標本待用；提取各標本的全基因組DNA；擴增出TCR的CDR3區，分別得到疾病組文庫和對照組文庫；采用高通量測序技術，對所述疾病組文庫和所述對照組文庫進行測序；對測序結果進行分析，構建膀胱癌組織T細胞圖譜模型。上述膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法，通過膀胱癌組織和癌旁組織免疫組庫測序分析TCR數量的變化，能發現那些高克隆擴增TCR CDR3序列，可間接獲知這些高克隆擴增T細胞亞家族的分布特點，從而有利于進一步研究膀胱癌發生發展機制。

技術領域

本發明涉及生物醫學技術領域，特別是涉及一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型的及其構建方法及和構建系統。

背景技術

膀胱癌(Bladder cancer)是指膀胱內細胞惡性過度生長。轉移性膀胱癌患者及晚期膀胱癌患者的中位存活時間僅約14個月，而能獲得無腫瘤進展生存的患者僅占15％。這不僅嚴重危害著人類健康，而且給家庭、社會、國家帶來嚴重的經濟負擔，已經成為一個需要迫切解決的社會公共衛生問題。

近年來，腫瘤微環境中各種細胞間復雜的相互作用逐漸被人們認識，其中T淋巴細胞在其中發揮著重要作用。T淋巴細胞(T-lymphocytes)是來源于骨髓的多能干細胞，具有多種生物學功能，如直接殺傷靶細胞、抑制B淋巴細胞產生抗體，對特異性抗原產生應答反應和產生細胞因子等。T淋巴細胞對于膀胱癌細胞具有一定的殺死作用，作為細胞免疫的主力軍，其對膀胱癌的治療和抑制具有非常重要的作用。然而，在膀胱癌患者中，腫瘤微環境內的T淋巴細胞通常處于被抑制或者不識別狀態。其中，T細胞抗原受體(T cell receptor，TCR)為存在于T淋巴細胞膜表面能夠識別蛋白質抗原的受體，為所有T細胞的特有標志，是T細胞識別不同的抗原及被激活的中心環節。

因此，需要更深層次的了解與腫瘤抗原結合的T細胞受體的基因序列信息和多樣性變化，因為這能更深層次的揭開T淋巴細胞參與腫瘤免疫的機理，客觀準確地評估膀胱癌免疫狀態，為進一步闡明膀胱癌的病因學及發病機制提供理論基礎。

發明內容

基于此，有必要提供一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型及其構建方法和構建系統。

一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法，包括如下步驟：設置疾病組與對照組，其中，疾病組取離體的膀胱癌患者膀胱癌組織的標本待用，對照組取離體的膀胱癌患者膀胱癌旁組織的標本待用；提取各標本的全基因組DNA；擴增出TCR的CDR3區，分別得到疾病組文庫和對照組文庫；采用高通量測序技術，對所述疾病組文庫和所述對照組文庫進行測序；對測序結果進行分析，構建膀胱癌組織T細胞圖譜模型。

一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型，由如上任一實施例中所述的構建方法制備得到。

一種膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建系統，采用如上任一實施例中所述的構建方法實現。

上述膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法，通過膀胱癌組織和癌旁組織免疫組庫測序分析TCR數量的變化，能發現那些高克隆擴增TCR CDR3序列，可間接獲知這些高克隆擴增T細胞亞家族的分布特點，從而有利于進一步研究膀胱癌發生發展機制。對這些信息進一步進行驗證分析和研究將有助于揭開T淋巴細胞參與腫瘤免疫的機理，客觀準確地評估膀胱癌免疫狀態，進一步闡明膀胱癌的病因學及發病機制。

附圖說明

圖1為本發明一實施方式的膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法的步驟流程圖；

圖2為本發明另一實施方式的膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法的步驟流程圖；

圖3為本發明又一實施方式的膀胱癌組織T細胞圖譜模型的構建方法中的CDR3氨基酸序列長度分布圖。

具體實施方式