[發明專利]用于檢測突變體的熒光實時檢測試劑及方法在審
| 申請號: | 201710527428.5 | 申請日: | 2017-06-30 |
| 公開(公告)號: | CN109207568A | 公開(公告)日: | 2019-01-15 |
| 發明(設計)人: | 張馳宇;張夢玲 | 申請(專利權)人: | 中國科學院上海巴斯德研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 上海一平知識產權代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;馬思敏 |
| 地址: | 200025 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 突變體 檢測 熒光 高保真DNA聚合酶 實時檢測 點突變 單核苷酸多態性 聚合酶活性 準確度 缺失突變 校正功能 熒光引物 靈敏性 外切酶 錯配 突變 | ||
1.一種檢測突變體的試劑,其特征在于,所述的試劑包括以下組分:
(a)第一引物,所述第一引物結構如下式I所示:
Z1-Z2-Z3-F1 (I)
式中,
F1為熒光基團或淬滅基團;
Z1為無或附加功能區,長度為L1個核苷酸;
Z2為互補結合區,長度為L2個核苷酸;
其中,Z1和Z2中至少一個與F2相連,其中F2為熒光基團或淬滅基團;并且F1和F2兩者中一個為熒光基團,另一個為淬滅基團;
Z3為3’端的位點識別區,所述識別區的長度為L3個核苷酸,并且所述的識別區中≥60%的核苷酸與待檢測的模板檢測區序列是非匹配的,并且L3為1-5;
(b)第二引物,所述第二引物為正常引物或與第一引物結構相同;
(c)高保真DNA聚合酶,所述高保真DNA聚合酶為具有外切活性的DNA聚合酶;和
(d)非高保真DNA聚合酶,所述非高保真DNA聚合酶不具有外切活性的DNA聚合酶。
2.如權利要求1所述的試劑,其特征在于,所述高保真DNA聚合酶與非高保真DNA聚合酶的比例為(0.01-0.5):1,較佳地為(0.03-0.2):1;更佳地為(0.04-0.08):1。
3.如權利要求1所述的試劑,其特征在于,所述F1為熒光基團,所述F2為淬滅基團。
4.如權利要求1所述的試劑,其特征在于,在核酸擴增反應體系中,添加Mg2+終濃度為2-8mM,較佳地,3-7mM,更佳地,4mM-6mM。
5.一種核酸擴增體系,其特征在于,所述的體系包括:用于擴增的緩沖體系和位于所述體系中的權利要求1所述的試劑。
6.一種核酸擴增方法,其特征在于,所述方法包括步驟:利用如權利要求1所述的試劑、權利要求5所述的擴增體系,對待測樣品進行核酸擴增。
7.如權利要求6所述的核酸擴增方法,其特征在于,利用不同熒光和淬滅基團標記針對不同待測位點的熒光引物。
8.一種非治療性和非診斷性檢測突變體的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
(a)利用如權利要求1所述的試劑、權利要求5所述的體系或權利要求6所述的核酸擴增方法,對待測樣品進行實時熒光核酸擴增;和(b)分析實時熒光核酸擴增反應擴增曲線,從而判定所述待測樣品是否存在突變。
9.一種如權利要求1所述的試劑、權利要求5所述的體系或權利要求6所述的核酸擴增方法的用途,其特征在于,用于點突變、單核苷酸多態性、插入和缺失突變的單重或多重檢測。
10.一種試劑盒,其特征在于,所述試劑盒中包括:(a)如權利要求1所述的試劑;(b)容器。
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