[發(fā)明專利]一種用于檢測(cè)α地中海貧血的基因芯片、擴(kuò)增試劑及試劑盒在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201710485206.1 | 申請(qǐng)日: | 2017-06-23 |
| 公開(公告)號(hào): | CN109112200A | 公開(公告)日: | 2019-01-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 陳治中;卿吉琳 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 陳治中 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6883 | 分類號(hào): | C12Q1/6883 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉誠知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11129 | 代理人: | 吳泳歷 |
| 地址: | 530012 廣西壯*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 地中海貧血 基因芯片 擴(kuò)增試劑 試劑盒 檢測(cè) 分子診斷技術(shù) 雜交 | ||
1.一種用于檢測(cè)α-地中海貧血的基因芯片,其特征在于,所述芯片上固定有:
用于檢測(cè)3種非缺失型α-地中海貧血基因αCSα、αQSα、αWSα所對(duì)應(yīng)的探針,其堿基序列如SEQ ID NO:11-16所示;和/或
用于檢測(cè)4種缺失型α-地中海貧血基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7的探針,其堿基序列如SEQ ID NO:17-20所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因芯片,其特征在于,所述芯片上還固定有
陰性對(duì)照探針(NC),其堿基序列如SEQIDNO:21,
陽性對(duì)照探針(AC),其堿基序列如SEQIDNO:22,
顯色體系控制探針(CC),其堿基序列如SEQIDNO:23。
3.一種用于PCR檢測(cè)非缺失α-地中海非貧血基因的擴(kuò)增試劑,其特征在于:包括如下核苷酸序列的引物組:
APF:SEQ ID NO.1,
APR:SEQ ID NO.2;
其擴(kuò)增的特征序列與權(quán)利要求1或2所述的基因芯片中的用于檢測(cè)三種非缺失型α-地中海貧血基因αCSα、αQSα、αWSα所對(duì)應(yīng)的探針特異性結(jié)合;
所述擴(kuò)增試劑中加入其它PCR擴(kuò)增組分,通過一次PCR反應(yīng)對(duì)待測(cè)樣品或提取自待測(cè)樣品的DNA直接進(jìn)行三種非缺失α-地中海貧基因QS、CS、WS;
所述待測(cè)樣品選自新鮮采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反復(fù)凍融的陳舊性抗凝外周血、培養(yǎng)羊水細(xì)胞、絨毛、羊水、臍帶血、末梢血、DBS樣本和/或類似DBS處理的樣本、唾液、胚胎的遺傳物質(zhì)包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞,即囊胚細(xì)胞、多個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞等。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的擴(kuò)增試劑,其特征在于,用于一個(gè)反應(yīng)的所述PCR擴(kuò)增試劑中,含有:
5.一種用于PCR檢測(cè)缺失型α-地中海非貧血基因的擴(kuò)增試劑,其特征在于:包含如下核苷酸序列的引物組:
SEAF:SEQ ID NO.3
SEAR:SEQ ID NO.4
THAIF:SEQ ID NO.5
THAIR:SEQ ID NO.6
4.2F:SEQ ID NO.7
4.2R:SEQ ID NO.8
3.7F:SEQ ID NO.9
3.7R:SEQ ID NO.10
其擴(kuò)增的特征序列與權(quán)利要求1或2所述的基因芯片中的用于檢測(cè)四種缺失型α-地中海貧血基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7所對(duì)應(yīng)的探針特異性結(jié)合;
所述擴(kuò)增試劑中加入其它PCR擴(kuò)增組分,通過一次PCR反應(yīng)對(duì)待測(cè)樣品或提取自待測(cè)樣品的DNA直接進(jìn)行4種缺失α-地中海貧基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7-地中海貧血基因的檢測(cè),所述待測(cè)樣品選自新鮮采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反復(fù)凍融的陳舊性抗凝外周血、培養(yǎng)羊水細(xì)胞、絨毛、羊水、臍帶血、末梢血、DBS樣本和/或類似DBS處理的樣本、唾液、胚胎的遺傳物質(zhì)包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞,即囊胚細(xì)胞、多個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞等。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的擴(kuò)增試劑,其特征在于,用于一個(gè)反應(yīng)的所述PCR擴(kuò)增試劑中,含有:
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的擴(kuò)增試劑,其特征在于,所述引物組各引物摩爾濃度比例如下:
優(yōu)選的,用于一個(gè)反應(yīng)的所述PCR擴(kuò)增試劑中,含有:
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