[發(fā)明專利]一種基于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710473065.1 | 申請日: | 2017-06-21 |
| 公開(公告)號: | CN107099612B | 公開(公告)日: | 2020-10-30 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李富榮;凌凱;李聰;蔣太峰;衛(wèi)志堅(jiān);戴蘡瓔 | 申請(專利權(quán))人: | 深圳市展行生物有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/682 | 分類號: | C12Q1/682;C12Q1/6834;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 北京科億知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 湯東鳳 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 核苷酸 連接 檢測 癌癥 患者 血清 mirna 方法 | ||
1.一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,方法包括以下步驟:
S1:提取miRNA,使用ProteinaseK消化血清中與miRNA結(jié)合的蛋白質(zhì),并通過Tween20表面活性劑破壞細(xì)胞外囊泡的脂質(zhì)雙層膜,使血清中的miRNA游離出來;
S2:提取核酸探針,將與目標(biāo)miRNA互補(bǔ)配對的長段核酸探針分為兩個部分,即兩個短核苷酸鏈探針,分別為核酸探針1和核酸探針2;
S3:在馬來酸酐化96孔酶標(biāo)板上通過酰胺反應(yīng)連接一段DNA捕獲序列,并加入處理后的血清樣品、核酸探針1和核酸探針2,使兩個短核苷酸鏈探針分別與目標(biāo)miRNA序列中的一半互補(bǔ)配對;
S4:通過核酸雜交將核酸探針1、血清中的目標(biāo)miRNA及核酸探針2固定在酶標(biāo)板上;S5:通過反復(fù)沖洗酶標(biāo)板,去除錯配和部分互補(bǔ)的miRNA,進(jìn)一步提高其檢測體系的特異性;
S6:將S5中沖洗后的酶標(biāo)板上的序列與Biotin標(biāo)記的信號放大序列雜交,用SA-HRP與信號放大序列上的Biotin標(biāo)記結(jié)合,并加入化學(xué)發(fā)光底物溶液;
S7:根據(jù)熒光強(qiáng)度確定血清中目標(biāo)miRNA的表達(dá)量,從而檢測出目標(biāo)miRNA。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,所述目標(biāo)miRNA序列為長度22個的堿基,其一半即11個堿基與一個短核苷酸鏈探針配對雜交出現(xiàn)錯配和部分互補(bǔ),產(chǎn)生較弱的結(jié)合方式。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,所述DNA捕獲序列和信號放大序列設(shè)計(jì)參照Luminex液相芯片的TAG序列設(shè)計(jì),其通過核酸雜交把核酸探針固定,并且序列與序列及序列與生物樣本中的核酸成分之間由BLAST程序比對驗(yàn)證,不會發(fā)生核酸雜交。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,所述miRNA分為miR-16和miR-21,miR-16為一種在血液中表達(dá)較為恒定的miRNA標(biāo)志物,其作為血清miRNA表達(dá)變化的內(nèi)參物質(zhì);miR-21為一種普遍在癌癥患者血液中高表達(dá)的miRNA標(biāo)志物,其作為非小細(xì)胞肺癌患者血清中的生物標(biāo)志物。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,所述方法檢測miRNA的線性范圍在10fM至50pM之間,最低能檢測1.248fM濃度的miRNA。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種用于短核苷酸鏈連接檢測癌癥患者血清miRNA的方法的裝置,其特征在于,所述S7中的熒光強(qiáng)度來源于化學(xué)發(fā)光底物溶液與結(jié)合到核酸探針上的辣根過氧化物酶產(chǎn)生的酶促反應(yīng),通過熒光強(qiáng)度進(jìn)一步放大檢測信號。
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