[發(fā)明專利]用于檢測肝癌的基因標(biāo)志物及其用途

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710461410.X
• 申請日: 2017-06-16
• 公開（公告）號: CN107142320B
• 公開（公告）日: 2021-03-09
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 陸星宇;宋艷群;彭萊
• 申請（專利權(quán)）人: 上海易畢恩基因科技有限公司;上海易畢恩生物技術(shù)有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 北京市金杜律師事務(wù)所 11256
• 代理人: 孟凡宏;王月

1.用于測定針對乙肝患者的肝癌檢測基因標(biāo)志物的試劑在制備用于針對乙肝患者的用于檢測肝癌的方法中的試劑盒中的用途，其中所述基因標(biāo)志物包括一個或多個選自以下的基因：骨形成蛋白3(BMP3)、包含布羅莫結(jié)構(gòu)域和PHD指的蛋白3(BRPF3)、頂蓋蛋白1(CPNE1)、Fc受體樣3(FCRL3)、白細(xì)胞介素1受體類型2(IL1R2)、N-脫乙酰基酶和N-磺基轉(zhuǎn)移酶4(NDST4)、蛋白磷酸酶2支架亞基α(PPP2R1A)、絲氨酸/蘇氨酸激酶35(STK35)、酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(TYRP1)、尿苷-胞苷激酶2(UCK2)和鋅指蛋白254(ZNF254)。

2.權(quán)利要求1所述的用途，其中所述基因標(biāo)志物包括BPM3、BRPF3、CPNE1、FCRL3、IL1R2、NDST4、PPP2R1A、STK35、TYRP1、UCK2和ZNF254。

3.權(quán)利要求1所述的用途，其中所述針對乙肝患者的用于檢測肝癌的方法包括以下步驟：

(a)測定乙肝樣品和帶有乙肝的受試者樣品中的基因標(biāo)志物的5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)的含量，其中所述基因標(biāo)志物包括一個或多個選自以下的基因：骨形成蛋白3(BMP3)、包含布羅莫結(jié)構(gòu)域和PHD指的蛋白3(BRPF3)、頂蓋蛋白1(CPNE1)、Fc受體樣3(FCRL3)、白細(xì)胞介素1受體類型2(IL1R2)、N-脫乙酰基酶和N-磺基轉(zhuǎn)移酶4(NDST4)、蛋白磷酸酶2支架亞基α(PPP2R1A)、絲氨酸/蘇氨酸激酶35(STK35)、酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(TYRP1)、尿苷-胞苷激酶2(UCK2)和鋅指蛋白254(ZNF254)；

(b)用乙肝樣品中所述基因標(biāo)志物的5-hmC含量作為參照，將帶有乙肝的受試者樣品中對應(yīng)的基因標(biāo)志物的5-hmC含量標(biāo)準(zhǔn)化；

(c)對步驟(b)中經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的所述基因標(biāo)志物的5-hmC含量進(jìn)行數(shù)學(xué)關(guān)聯(lián)，并獲得評分P；和

(d)根據(jù)所述評分P獲得檢測結(jié)果，評分P大于0.5表明所述帶有乙肝的受試者樣品患有肝癌。

4.權(quán)利要求3所述的用途，其中所述基因標(biāo)志物包括BPM3、BRPF3、CPNE1、FCRL3、IL1R2、NDST4、PPP2R1A、STK35、TYRP1、UCK2和ZNF254。

5.權(quán)利要求3所述的用途，其中步驟(a)是測定所述基因標(biāo)志物全長或其片段上的5-hmC的含量。

6.權(quán)利要求3所述的用途，其中所述樣品是來自受試者體液中游離的DNA片段，或來源于細(xì)胞器、細(xì)胞以及組織中的完整基因組DNA。

7.權(quán)利要求6所述的用途，其中所述體液是血液、尿液、汗液、痰液、糞便、腦脊液、腹水、胸水、膽汁或胰腺液。

8.用于測定基因標(biāo)志物的5-hmC含量的試劑在制備針對乙肝患者的用于檢測肝癌的試劑盒中的用途，其中所述基因標(biāo)志物包括一個或多個選自以下的基因：骨形成蛋白3(BMP3)、包含布羅莫結(jié)構(gòu)域和PHD指的蛋白3(BRPF3)、頂蓋蛋白1(CPNE1)、Fc受體樣3(FCRL3)、白細(xì)胞介素1受體類型2(IL1R2)、N-脫乙酰基酶和N-磺基轉(zhuǎn)移酶4(NDST4)、蛋白磷酸酶2支架亞基α(PPP2R1A)、絲氨酸/蘇氨酸激酶35(STK35)、酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(TYRP1)、尿苷-胞苷激酶2(UCK2)和鋅指蛋白254(ZNF254)。

9.權(quán)利要求8所述的用途，其中所述基因標(biāo)志物包括BPM3、BRPF3、CPNE1、FCRL3、IL1R2、NDST4、PPP2R1A、STK35、TYRP1、UCK2和ZNF254。