[發(fā)明專利]一種鑒定玉米籽粒性狀的方法及其專用試劑盒

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201710325090.5
• 申請(qǐng)日: 2017-05-10
• 公開（公告）號(hào): CN108866222B
• 公開（公告）日: 2021-09-03
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王天宇;陳林;李永祥;張登峰;李春輝;石云素;宋燕春;黎裕
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/686
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢;何葉喧

本發(fā)明公開了一種鑒定玉米籽粒性狀的方法及其專用試劑盒。該試劑盒包括檢測(cè)待測(cè)玉米的單倍型為單倍型HapI、單倍型HapII、單倍型HapⅢ還是單倍型HapⅣ的物質(zhì)；籽粒性狀為籽粒粒長(zhǎng)和/或籽粒粒寬和/或籽粒粒長(zhǎng)/籽粒粒寬。四個(gè)單倍型是基于SNP S?1830和Indel S?1558的基因型進(jìn)行分型的。SNP S?1830為玉米基因組中引物F和引物R組成的引物對(duì)的靶序列自5’末端起第189位核苷酸；引物F和物R的核苷酸序列依次見序列5和序列6。Indel S?1558為玉米基因組具有9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列、9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列的缺失型Ⅰ或9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列的缺失型Ⅱ。該試劑盒在玉米分子育種具有重要的應(yīng)用價(jià)值。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種鑒定玉米籽粒性狀的方法及其專用試劑盒。

背景技術(shù)

玉米(Zea mays L.)是世界上重要的糧食、飼料和工業(yè)原料作物。隨著世界人口的增加，對(duì)玉米等糧食的需求與日俱增，在可耕地面積的持續(xù)減少的情況下，培育單產(chǎn)突出的玉米新品種是穩(wěn)定和提高玉米總產(chǎn)量最經(jīng)濟(jì)有效的途徑。玉米產(chǎn)量受單位面積有效穗數(shù)、穗粒數(shù)和粒重三個(gè)因素的影響，三者關(guān)系的協(xié)調(diào)是取得玉米高產(chǎn)的關(guān)鍵。作為產(chǎn)量構(gòu)成因子之一的粒重相對(duì)最穩(wěn)定且受環(huán)境條件的影響相對(duì)較小，歷來(lái)被育種者所重視，因此提高玉米粒重是玉米高產(chǎn)育種的重要途徑之一。玉米籽粒性狀(如粒長(zhǎng)，粒寬)是決定粒重的重要因子。因此，挖掘控制玉米籽粒性狀的優(yōu)良等位變異，并且開發(fā)相應(yīng)等位變異的功能標(biāo)記對(duì)高產(chǎn)玉米品種的分子標(biāo)記輔助育種具有重要的意義。

單核甘酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism，SNP)是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸變異所引起的DNA序列的多態(tài)性。隨著技術(shù)的發(fā)展，SNP檢測(cè)方法經(jīng)濟(jì)快捷，使它成為繼SSR之后的新一代分子標(biāo)記，已被應(yīng)用于玉米遺傳圖譜的構(gòu)建、玉米重要農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的定位和基因組關(guān)聯(lián)分析等方面。

Indel標(biāo)記是指親本在全基因組中的差異，相對(duì)于一個(gè)材料而言，另一個(gè)材料的基因組中有一定數(shù)量的核苷酸插入或缺失，從而形成變異。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是如何鑒定玉米籽粒性狀。

為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明首先提供了鑒定玉米籽粒性狀的方法。

本發(fā)明所提供的方法，可為A1)或A2)或A3)：

A1)一種鑒定玉米籽粒粒長(zhǎng)的方法，可包括如下步驟：檢測(cè)待測(cè)玉米的單倍型為單倍型HapI、單倍型HapII、單倍型HapⅢ還是單倍型HapⅣ，單倍型HapII的玉米的籽粒粒長(zhǎng)單倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒長(zhǎng)單倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒長(zhǎng)單倍型HapI的玉米的籽粒粒長(zhǎng)；

A2)一種鑒定玉米籽粒粒寬的方法，可包括如下步驟：檢測(cè)待測(cè)玉米的單倍型為單倍型HapI、單倍型HapII、單倍型HapⅢ還是單倍型HapⅣ，單倍型HapI的玉米的籽粒粒寬單倍型HapII的玉米的籽粒粒寬單倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒寬單倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒寬；

A3)一種鑒定玉米籽粒粒形的方法，可包括如下步驟：檢測(cè)待測(cè)玉米的單倍型為單倍型HapI、單倍型HapII、單倍型HapⅢ還是單倍型HapⅣ，單倍型HapⅢ的玉米的籽粒粒形單倍型HapII的玉米的籽粒粒形單倍型HapⅣ的玉米的籽粒粒形單倍型HapI的玉米的籽粒粒形；所述籽粒粒形為籽粒粒長(zhǎng)/籽粒粒寬。

上述方法中，所述單倍型HapI的玉米可為基于SNP S-1830的基因型為AA純合型且具有“9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列的缺失型Ⅱ”的玉米。所述單倍型HapII的玉米可為基于SNPS-1830的基因型為GG純合型且具有“9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列”的玉米。所述單倍型HapⅢ的玉米可為基于SNP S-1830的基因型為GG純合型且具有“9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列的缺失型Ⅰ”的玉米。所述單倍型HapⅣ的玉米可為基于SNP S-1830的基因型為GG純合型且具有“9個(gè)串聯(lián)重復(fù)的2bp序列的缺失型Ⅱ”的玉米。