[發(fā)明專利]利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710313582.2 | 申請日: | 2017-05-05 |
| 公開(公告)號: | CN107092801A | 公開(公告)日: | 2017-08-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 王文軍;陳顯揚;薩日娜;馬占青;任素玲;段曉波 | 申請(專利權(quán))人: | 北京騏驥生物技術(shù)有限公司 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 北京遠(yuǎn)大卓悅知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙)11369 | 代理人: | 史霞 |
| 地址: | 100000 北京市海淀*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 利用 生物 標(biāo)志 預(yù)測 乳腺癌 方法 | ||
1.一種利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法,其特征在于,主要包括以下步驟:
步驟1、篩選出正常人組群和乳腺癌組群之間VIP值大于5的排名前9位的差異性化合物R1-R9,分別為表1所示:
表1
步驟2、利用邏輯回歸模型2進行計算,得到TC值,所述邏輯回歸模型2的計算公式為:
TC=3.564+6.135*R6+5.375*R7-1.814*R8-2.943*R9+1.151*R10;
步驟3、根據(jù)所得TC值進行判斷,TC=0為否;TC=1為是。
2.如權(quán)利要求1所述的利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法,其特征在于,步驟1中利用OPLS-DA模型對差異性化合物進行篩選,篩選條件VIP>1。
3.如權(quán)利要求2所述的利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法,其特征在于,步驟1中篩選的具體方法為:
步驟1.1將樣品進行超高效液相色譜和質(zhì)譜分析,得到脂質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù),將正常人組群和乳腺癌組群分別計為CK及RC;
步驟1.2對脂質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)進行標(biāo)準(zhǔn)化操作,利用OPLS-DA模型對CK及RC進行S-plot分布得到S形曲線,并進行強制分組,計算影響CK及RC分組的變量重要性,即得VIP值;
步驟1.3按照VIP值大于1的標(biāo)準(zhǔn)得到10個化合物,并將該10個化合物作為與乳腺癌相關(guān)度最高的差異性化合物;
步驟1.4將所得10個化合物按照VIP值大小從高到低排列,取前9位,即得步驟1中所述差異性化合物R1-R9。
4.如權(quán)利要求1所述的利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法,其特征在于,步驟2中TC值或者用邏輯回歸模型1進行計算,所述邏輯回歸模型1的計算公式為:
TC=-8.673-32.803*R1+19.399*R2+8.738*R3-20.88*R8+2.217*R9+1.607*R10。
5.如權(quán)利要求1所述的利用脂質(zhì)生物標(biāo)志物預(yù)測乳腺癌的方法,其特征在于,步驟2中TC值或者用邏輯回歸模型3進行計算,所述邏輯回歸模型3的計算公式為:
TC=0.7564-2.6459*R8+2.524*R9+1.5554*R10。
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G06F19-16 ..用于分子結(jié)構(gòu)的,例如:結(jié)構(gòu)排序,結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系,蛋白質(zhì)折疊,結(jié)構(gòu)域拓?fù)洌媒Y(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的藥靶,涉及二維或三維結(jié)構(gòu)的
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