[發明專利]利用基因組測序診斷胎兒染色體非整倍性

在審

• 申請號: 201710198531.X
• 申請日: 2008-07-23
• 公開（公告）號: CN107083425A
• 公開（公告）日: 2017-08-22
• 發明（設計）人: 盧煜明;趙慧君;陳君賜
• 申請（專利權）人: 香港中文大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京北翔知識產權代理有限公司11285
• 代理人: 張廣育,姜建成

本申請是申請日為2008年7月23日，申請號為200880108377.1，發明名稱為“利用基因組測序診斷胎兒染色體非整倍性”的發明專利申請的分案申請。

優先權聲明

本申請要求2007年7月23日提交的題目為“DETERMINING A NUCLEIC ACID SEQUENCE IMBALANCE(確定核酸序列失衡)”的美國臨時申請第60/951438號(Attorney Docket No.016285-005200US)的優先權，并且是其正式申請，在此將該臨時申請的全部內容通過引用并入并用于各種目的。

相關申請的交叉引用

本申請還涉及同時提交的題目為“DETERMINING A NUCLEIC ACID SEQUENCE IMBALANCE(確定核酸序列失衡)”的正式申請(Attorney Docket No.016285-005210US)，在此將該申請內的全部內容通過引用并入并用于各種目的。

發明領域

本發明一般涉及通過確定不同核酸序列間的失衡來診斷檢測胎兒染色體非整倍性，更具體而言，涉及經由檢測母體樣品(如血液)來確定21三體性(trisomy 21)(唐氏綜合征)和其他染色體非整倍性。

發明背景

胎兒染色體非整倍性是由異常劑量的染色體或染色體區的存在導致的。異常劑量可以是異常地高，如在21三體性中存在額外的21號染色體或染色體區；或異常地低，如在特納綜合征中缺乏X染色體的拷貝。

胎兒染色體非整倍性如21三體性的常規產前診斷方法涉及，通過侵入性方法如羊膜穿刺或絨毛膜絨毛取樣對胎兒的材料進行取樣，但這造成胎兒流失(fetal loss)的有限風險。無創方法，如通過超聲波掃描術或生物化學標記物的篩查，已用于在確定的侵入性診斷方法前，將孕婦進行風險分級。然而，這些篩查方法通常測量與染色體非整倍性如21三體性有關的副現象，而不是核心染色體異常，因此診斷的準確性未達最佳標準，且具有諸如受孕齡(gestational age)過度影響等的其他缺點。

1997年，在母體血漿中發現了循環的無細胞胎兒DNA，這為無創產前診斷提供了新的可能性(Lo,YMD and Chiu,RWK 2007Nat Rev Genet 8,71-77)。盡管這種方法易于應用于伴性病癥(Costa,JM et al.2002N Engl J Med 346,1502)和某些單基因病癥(Lo,YMD et al.1998N Engl J Med 339,1734-1738)的產前診斷，但是，該方法的產前檢測胎兒染色體非整倍性的應用依然代表相當大的挑戰(Lo,YMD and Chiu,RWK 2007,同上)。首先，胎兒核酸和母體來源的高背景核酸共存于母體血漿中，而母體來源的高背景核酸經常干擾胎兒核酸的分析(Lo,YMD et al.1998Am J Hum Genet 62,768-775)。其次，胎兒核酸主要以無細胞的形式在母體血漿中循環，這使得難以獲得胎兒基因組的基因或染色體的劑量信息。

近年來，已取得了克服這些挑戰的顯著發展(Benachi,A&Costa,JM 2007Lancet 369,440-442)。一種方法是，檢測母體血漿中的胎兒特異性核酸，因而克服了母體背景干擾的問題(Lo,YMD and Chiu,RWK 2007,同上)。21號染色體的劑量由胎盤來源的DNA/RNA分子中多態性等位基因的比值來推斷。然而，當樣品中含有較低量的靶核酸時，這種方法的準確性較低，并且僅可適用于對靶多態性是雜合的胎兒，如果使用一種多態性，則該靶核酸僅是群體的一個亞群。