[發明專利]一種鑒定烏蘇里擬鲿雌、雄個體的微衛星標記與特異性引物及應用有效
| 申請號: | 201710174183.2 | 申請日: | 2017-03-22 |
| 公開(公告)號: | CN106811540B | 公開(公告)日: | 2020-06-23 |
| 發明(設計)人: | 朱傳坤;潘正軍;王輝;常國亮;丁懷宇;聶孝燕;余祥勝;吳楠 | 申請(專利權)人: | 淮陰師范學院 |
| 主分類號: | C12Q1/6879 | 分類號: | C12Q1/6879;C12N15/11 |
| 代理公司: | 淮安市科文知識產權事務所 32223 | 代理人: | 謝觀素 |
| 地址: | 223300 江蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 鑒定 烏蘇 里擬鲿雌 個體 衛星 標記 特異性 引物 應用 | ||
1.一種鑒定烏蘇里擬鲿雌、雄個體的微衛星標記,其特征在于:該微衛星標記的核苷酸序列為SEQ ID NO:1-2中的任一個。
2.一種特異性擴增如SEQ ID NO:1-2中任一所示微衛星標記序列的引物對。
3.根據權利要求2所述的引物對,其特征在于:所述引物對上下游引物的序列如SEQ IDNO:3-4所示。
4.一種用于烏蘇里擬鲿雌、雄個體鑒定的試劑盒,其特征在于:該試劑盒包含權利要求2或3所述的引物對。
5.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征在于:所述的試劑盒還可以包括PCR技術常用的試劑。
6.權利要求1所述的微衛星標記、權利要求2或3所述的引物對、權利要求4或5所述的試劑盒在烏蘇里擬鲿雌、雄個體鑒定中的應用。
7.一種鑒定烏蘇里擬鲿雌、雄個體的方法,其特征在于:包括如下步驟:
1)基因組總DNA抽提:抽提目標個體的基因組DNA;
2)微衛星標記PCR 擴增:采用權利要求3所述的引物對,以步驟1)獲得的目標個體基因組DNA為模板進行PCR擴增,獲得目標個體微衛星PCR擴增產物;
3)擴增產物電泳檢測:采用聚丙烯酰胺凝膠電泳及GoldView染色法檢測步驟2)獲得的微衛星PCR擴增產物;
4)基因型分析:根據每個個體微衛星PCR擴增產物的分子量大小確定基因型,若某一個體在該微衛星標記表現為雌性等位基因型,則該個體為雌性;若某一個體在該位點表現為雄性等位基因型,則該個體為雄性。
8.根據權利要求7所述的方法,其特征在于:步驟4)中,若某一個體只在130 bp處有擴增條帶,則該個體為雌性;若某一個體在130 bp和118 bp處均有擴增條帶,則該個體為雄性。
9.根據權利要求7所述的方法,其特征在于:所述PCR擴增的反應體系:以總體積13 μL為例,包含30-50 ng的模板DNA,0 .5 U Taq DNA聚合酶,1 .3 μL 10× PCR Buffer,0 .5μL 2.5 mM dNTP,0.5 μL正反向混合引物,正反向混合引物各2.5 μM,9.6 μL滅菌超純水;所述PCR擴增的程序為:95°C預變性5分鐘;以94°C變性40秒、54°C退火40秒、72°C延伸40秒為一個循環,共循環36個;最后72°C終延伸7分鐘,PCR產物于4°C保存。
10.根據權利要求7所述的方法,其特征在于:步驟3)的詳細過程為:將微衛星PCR擴增產物在10%的非變性聚丙烯酰胺凝膠,30 W 恒功率電泳2小時10分鐘進行分離;將膠板通過1 .5%的GoldView溶液顯色5-8分鐘,即可得到目標個體在該微衛星座位的基因分型。
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