[發明專利]趨化因子家族基因SNP位點的應用及檢測引物與試劑盒

有效

• 申請號: 201710145898.5
• 申請日: 2017-03-13
• 公開（公告）號: CN107119109B
• 公開（公告）日: 2021-03-02
• 發明（設計）人: 黃志剛;丁元林;于海兵;李戈楠;杜進林;潘海燕;陳婷婷;林博德;何榮威
• 申請（專利權）人: 廣東醫科大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 趙青朵

本申請涉及生物技術領域，提供了一種食管癌患者術后預后標志物以及用于輔助評估食管癌患者術后的預后情況的試劑盒。趨化因子家族的CCL26基因的SNP位點、CX3CL1基因的SNP位點和CXCL9基因的SNP位點中至少一種的遺傳變異與食管癌患者的預后有關聯，可以作為食管癌患者術后的預后標志物，用于輔助評估食管癌患者術后的預后情況。本發明所述輔助判斷食管癌患者術后的預后情況的試劑盒可以快速、靈敏、特異的用于臨床輔助對食管癌的個體化預后進行評估，為臨床醫生快速評價治療效果奠定基礎。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體涉及趨化因子家族基因SNP位點的應用及檢測引物與試劑盒。

背景技術

我國是世界上食管癌發病率和死亡率最高的國家，據《中國衛生統計年鑒》報道，近40年來食管癌的死亡率穩居惡性腫瘤死因譜的前五位。食管癌預后極差，中晚期食管癌患者5年生存率僅10％左右。目前認為，影響食管癌預后的主要因素是腫瘤TNM分期和治療方式，然而具有相同臨床特征的食管癌患者，即使處于相同的臨床分期、接受相同的治療方案，其病情進展和預后卻可能存在較大差異，提示除臨床特征外，個體遺傳易感因素亦可能是影響患者預后的重要因素。因此，尋找包括單核苷酸多態性(Single NucleotidePolymorphism，SNP)在內的遺傳分子標志，研究遺傳變異與食管癌預后的關聯，對于提高食管癌臨床預后的預測價值，乃至建立我國食管癌個體化預后評價模型具有重要意義。

惡性腫瘤的不良預后主要與腫瘤的轉移有關，而腫瘤轉移是一個具有高度組織性和器官選擇性的復雜過程，不同組織來源的腫瘤細胞遷移、侵襲到特定部位的分子機制尚未明確。新近，在腫瘤特異性轉移的研究中出現了新的概念：“歸巢”理論(The HomingTheory)，該理論認為，腫瘤細胞轉移到特定器官是由于不同器官通過趨化作用捕獲或吸引特定類型腫瘤細胞而使腫瘤細胞“歸巢”的結果。近年來，趨化因子受體--配體信號軸的研究，為“歸巢”理論提供了有利的證據。

趨化因子是一種具有趨化活性的小分子細胞因子(相對分子量為8-14KD)，這類細胞因子都含有4個保守的半胱氨酸，分為CXC、CC、CX3C、C共4個亞族。趨化因子受體是一類介導趨化因子行使功能的GTP蛋白耦聯的跨膜受體(G protein-coupled receptors，GPCR)，通常表達于免疫細胞、內皮 細胞等細胞膜上。趨化因子受體根據其結合的配體不同也分為4個亞族：CXC趨化因子受體(CXCR)、CC趨化因子受體(CCR)、CX3C趨化因子受體(CX3CR)和C趨化因子受體(XCR)。趨化因子主要通過與其特定的G蛋白耦聯受體結合，參與包括造血細胞的生成、白細胞的遷移與歸巢、胚胎的發育等許多正常生命活動，同時也參與炎性疾病、病毒感染、移植排斥、惡性腫瘤等眾多病理過程。

研究發現，腫瘤相關趨化因子不僅可促進腫瘤細胞增殖、抑制其凋亡，還可參與腫瘤細胞遷移、調節腫瘤血管生成、趨化淋巴細胞浸潤腫瘤組織及參與腫瘤細胞器官選擇性轉移等過程。例如，CC和CXC家族中的關鍵因子CCL2、CCL5、CCL8、CCL20、CCL22、CXCL1、CXCL6、CXCL9和CXCL12等參與調節腫瘤血管的生成，并且可促進包括乳腺癌、前列腺癌、惡性黑色素瘤及肺癌等多種腫瘤細胞的侵襲和組織特異性轉移。此外，已有多項研究發現，CXC(α)和CC(β)等趨化因子的表達失調可影響包括食管癌在內的多種腫瘤的發生、進展及預后。例如，CXCL12和其受體CXCR4的高表達與食管癌的侵襲、轉移有關；經術前放化療治療后，CXCR4的持續表達與食管癌早期復發和預后不良有關。可見，腫瘤相關趨化因子在腫瘤的惡性進展中發揮重要作用，那么位于腫瘤相關趨化因子家族基因序列中的功能性遺傳變異，亦可能導致相關基因的表達異常及功能改變，進而與腫瘤的惡性進展有關。因此，研究趨化因子家族的功能性遺傳變異與食管癌預后的關聯，篩選出具有預后意義的遺傳易感標志，將對食管癌的合理臨床決策、個體化治療及預后評估具有重要的參考價值。

發明內容

有鑒于此，本發明的目的在于提供趨化因子家族基因SNP位點的應用及擴增引物與試劑盒，研究趨化因子家族的功能性遺傳變異與食管癌預后的關聯，為食管癌患者的個體化預后評估提供參考依據。