[發明專利]探針法qPCR進行獅物種特異性鑒定的方法在審
| 申請號: | 201710141318.5 | 申請日: | 2017-03-10 |
| 公開(公告)號: | CN108570493A | 公開(公告)日: | 2018-09-25 |
| 發明(設計)人: | 張宇;白素英;金煜;王震 | 申請(專利權)人: | 東北林業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 150040 黑龍*** | 國省代碼: | 黑龍江;23 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 樣品DNA 探針法 物種特異性鑒定 靈敏度實驗 特異性實驗 重復性實驗 測序檢測 擴增曲線 判定結果 上游引物 下游引物 靈敏度 獅制品 檢測 擴增 探針 真偽 物種 試驗 應用 分析 | ||
1.一種利用MGB探針法qPCR進行獅物種特異性鑒定的方法,其特征在于包括特異性引物和探針的序列如下:
獅上游引物 5’—CCCGCCAATCCTCTAAGCA—3’
獅下游引物 5’—GGAATAGATCGGAGGATTGCAT—3’
獅探針 5’—(VIC)TCCCCATATCAAACC(MGB)—3’。
2.根據權利1所述的利用MGB探針法qPCR進行獅物種特異性鑒定的方法,其特征在于構建20μl單熒光反應體系由以下組分組成:
3.一種采用如權利1、權利2所述的利用MGB探針法qPCR進行獅物種特異性鑒定的方法,其特征在于包括以下步驟:
A、提取樣品DNA
B、對步驟A中的樣品DNA進行qPCR擴增,其中反應體系由以下組分組成:
所述的引物和探針:
獅上游引物 5’—CCCGCCAATCCTCTAAGCA—3’
獅下游引物 5’—GGAATAGATCGGAGGATTGCAT—3’
獅探針 5’—(VIC)TCCCCATATCAAACC(MGB)—3’
C、對擴增后的曲線情況進行結果判定,按照以下判定原則:
Ct值小于等于30并有明顯擴增曲線判為陽性;Ct值大于等于35判為陰性;Ct值介于30~35之間判為可疑,重復實驗,如果實驗結果相同且擁有明顯擴增曲線判為陽性,否則判為陰性。
4.根據權利3所述的檢測方法,其特征在于步驟B和步驟D所述的qPCR擴增按照以下步驟進行:94℃2min;94℃10s,60℃30s 40個循環;60℃1min,循環在退火時收集熒光信號。
5.根據權利3所述的檢測方法,其特征在于步驟A所述的樣品DNA提取按照以下步驟進行:
取疑似獅子制品20mg放置于2ml離心管中,加入350μl PBS和0.9μl RNase A,用剪刀溫和的剪碎組織30s。加入150μl裂解液和20μl蛋白酶K,立即渦旋振蕩1min混合均勻。短暫離心后,將離心管至于56℃水浴中過夜消化處理。加入350μl蛋白去除液,渦旋振蕩30s均勻混合,12000r/min離心10min。將DNA制備管至于2ml離心管中,將離心后的混合液上清移至制備管中,12000r/min離心1min。棄掉濾液,加入500μl洗滌液,12000r/min離心1min。棄掉濾液,加入700μl去鹽液,12000r/min離心1min。棄濾液,重復一次去鹽過程。棄濾液后,離心一分鐘。將DNA制備管轉移到新的1.5ml離心管中,加入56℃預熱的Tris-HCl洗脫液100μl洗脫制備管中DNA,-20℃冷凍備用。
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