[發明專利]灰霉病菌對QoIs殺菌劑抗性風險的快速評定方法在審
| 申請號: | 201710122876.7 | 申請日: | 2017-03-03 |
| 公開(公告)號: | CN106755538A | 公開(公告)日: | 2017-05-31 |
| 發明(設計)人: | 張傳清;胡小然;時浩杰;戴德江 | 申請(專利權)人: | 浙江農林大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州中成專利事務所有限公司33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 311300 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 病菌 qois 殺菌劑 抗性 風險 快速 評定 方法 | ||
1.用于檢測含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌的環介導等溫擴增引物,其特征在于:LAMP引物組合物由以下4條引物組成:
F3:CCTAATCAAATGGCTAAACGTATT;
TB3:CGTACAGTAACCATGGGATA;
FIP:TGAGAATCACCTAAGAGTGAACCATGCTTTTAAACGAATAGGACCG;
BIP:CCGATTACATGGAAACGGAACTCAAAAGTCATGCAGTCACAAT。
2.用于檢測含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌的環介導等溫擴增試劑盒,其特征在于:包含如權利要求1所述的LAMP引物組合物。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于:LAMP引物組合物的濃度為:1.6μM的正內向引物FIP,1.6μM的反向內引物BIP、0.2μM正向外引物F3、0.2μM反向外引物B3。
4.根據權利要求2或3所述的試劑盒,其特征在于:試劑盒還包含:10×ThermoPol Buffer、dNTPs、MgCl2、甜菜堿、羥基萘酚藍、8U/μL Bst DNA聚合酶、ddH2O。
5.用于檢測含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌的環介導等溫擴增方法,其特征在于:25μL反應體系由以下成分組成:8U/μL Bst DNA聚合酶0.5μL、10×ThermoPol Buffer 2.5μL、20μM FIP 2.0μL、20μM BIP 2.0μL、10μM F3 0.5μL、10μM B3 0.5μL、25mM MgCl2 5.0μL、10mM dNTPs 2.5μL、5M甜菜堿4.0μL、3.75mM羥基萘酚藍1μL、DNA模板1μL,ddH2O補足至25μL。
6.根據權利要求5所述的環介導等溫擴增方法,其特征在于:
利用所述25μL檢測反應體系進行LAMP擴增反應,擴增結果的分析和判定方法為選擇以下任一:
方法一、先在擴增前加入染料羥基萘酚藍作為反應指示劑,以羥基萘酚藍的顏色變化做為結果判定標準,然后進行LAMP擴增反應,反應結束后,顏色發生變化,即顯色結果為天藍色判斷為陽性,即顯示檢測到含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌;顏色沒有發生變化,顯色結果仍為藍紫色判斷為陰性,即顯示樣品無含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌,或所含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌含量未達檢測限;
方法二、取5μL擴增產物,用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,如果出現梯形條帶判斷為陽性,即顯示檢測到含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌;無擴增條帶則判斷為陰性,即顯示無含有BCbi143/144內含子的灰霉病菌,或所含的有BCbi143/144內含子的灰霉病菌未達檢測限。
7.根據權利要求6所述的環介導等溫擴增方法,其特征在于LAMP擴增反應程序為:65℃擴增60min;80℃滅活10min。
8.根據權利要求7所述的環介導等溫擴增方法,其特征在于:所述方法一、方法二中的檢測限DNA濃度為1pg/μL。
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