[發(fā)明專利]一種基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710091509.5 | 申請日: | 2017-02-21 |
| 公開(公告)號: | CN108410963B | 公開(公告)日: | 2021-06-11 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 朱挺兵;陳亮;楊德國;朱永久;何勇鳳;吳興兵 | 申請(專利權(quán))人: | 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 武漢宇晨專利事務(wù)所 42001 | 代理人: | 王敏鋒 |
| 地址: | 430223 湖北省武*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 衛(wèi)星 熒光 多重 pcr 長鰭吻鮈 親子鑒定 方法 | ||
1.用于長鰭吻鮈親子鑒定的微衛(wèi)星熒光多重PCR引物組合,包括引物組合B、引物組合C、引物組合D,其特征在于:引物組合B包括RVE-23、RVE-24、REN16,引物組合C包括RV-9、RV-7、REN10,引物組合D包括RV-8、REN30、REN34,各引物的序列及退火溫度、每對引物的正向引物5′端標(biāo)記的熒光物質(zhì)如下所示:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于長鰭吻鮈親子鑒定的微衛(wèi)星熒光多重PCR引物組合,其特征在于,還包括引物組合A或/和引物組合E,所述的引物組合A包括REN17、REN32、RVE-09,所述的引物組合E包括RVE-13、RVE-01、REN02,各引物的序列及退火溫度、每對引物的正向引物5′端標(biāo)記的熒光物質(zhì)如下所示:
3.一種基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法,其步驟是:
A.提取待檢測樣本的基因組DNA;
B.利用權(quán)利要求1或2所述的引物組合進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增反應(yīng),通過測序儀進(jìn)行等位基因分型;
C.通過似然率檢測待測個體與親本基因型之間的相關(guān)性,確定親子關(guān)系。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法,其特征在于,多重PCR的反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序如下:
多重PCR組合A的PCR體系為總體積25μL,包括基因組DNA150ng,10×PCR Buffer 3μL,Mg2+1.8mM,dNTPs 0.4mM,rTaq DNA聚合酶2U,REN17、REN32、RVE-09正反引物各0.2μM,補充滅菌雙蒸水至25μL;PCR擴(kuò)增程序為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性45s,53.8℃退火45s,72℃延伸1min,進(jìn)行33個循環(huán);最后72℃再延伸10min,4℃保存;
多重PCR組合B的PCR體系中RVE-23、RVE-24、REN16正反引物各0.2μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為59.2℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;
多重PCR組合C的PCR體系中RV-9、REN10正反引物各0.2μM,RV-7正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為56.1℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;
多重PCR組合D的PCR體系中RV-8、REN30正反引物各0.2μM,REN34正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為56.1℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;
多重PCR組合E的PCR體系中RVE-13、REN02正反引物各0.2μM,RVE-01正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為51.9℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同。
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