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[發(fā)明專利]一種基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201710091509.5 申請日: 2017-02-21
公開(公告)號: CN108410963B 公開(公告)日: 2021-06-11
發(fā)明(設(shè)計)人: 朱挺兵;陳亮;楊德國;朱永久;何勇鳳;吳興兵 申請(專利權(quán))人: 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所
主分類號: C12Q1/686 分類號: C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 武漢宇晨專利事務(wù)所 42001 代理人: 王敏鋒
地址: 430223 湖北省武*** 國省代碼: 湖北;42
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 基于 衛(wèi)星 熒光 多重 pcr 長鰭吻鮈 親子鑒定 方法
【權(quán)利要求書】:

1.用于長鰭吻鮈親子鑒定的微衛(wèi)星熒光多重PCR引物組合,包括引物組合B、引物組合C、引物組合D,其特征在于:引物組合B包括RVE-23、RVE-24、REN16,引物組合C包括RV-9、RV-7、REN10,引物組合D包括RV-8、REN30、REN34,各引物的序列及退火溫度、每對引物的正向引物5′端標(biāo)記的熒光物質(zhì)如下所示:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于長鰭吻鮈親子鑒定的微衛(wèi)星熒光多重PCR引物組合,其特征在于,還包括引物組合A或/和引物組合E,所述的引物組合A包括REN17、REN32、RVE-09,所述的引物組合E包括RVE-13、RVE-01、REN02,各引物的序列及退火溫度、每對引物的正向引物5′端標(biāo)記的熒光物質(zhì)如下所示:

3.一種基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法,其步驟是:

A.提取待檢測樣本的基因組DNA;

B.利用權(quán)利要求1或2所述的引物組合進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增反應(yīng),通過測序儀進(jìn)行等位基因分型;

C.通過似然率檢測待測個體與親本基因型之間的相關(guān)性,確定親子關(guān)系。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的基于微衛(wèi)星熒光多重PCR的長鰭吻鮈親子鑒定方法,其特征在于,多重PCR的反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序如下:

多重PCR組合A的PCR體系為總體積25μL,包括基因組DNA150ng,10×PCR Buffer 3μL,Mg2+1.8mM,dNTPs 0.4mM,rTaq DNA聚合酶2U,REN17、REN32、RVE-09正反引物各0.2μM,補充滅菌雙蒸水至25μL;PCR擴(kuò)增程序為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性45s,53.8℃退火45s,72℃延伸1min,進(jìn)行33個循環(huán);最后72℃再延伸10min,4℃保存;

多重PCR組合B的PCR體系中RVE-23、RVE-24、REN16正反引物各0.2μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為59.2℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;

多重PCR組合C的PCR體系中RV-9、REN10正反引物各0.2μM,RV-7正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為56.1℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;

多重PCR組合D的PCR體系中RV-8、REN30正反引物各0.2μM,REN34正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為56.1℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同;

多重PCR組合E的PCR體系中RVE-13、REN02正反引物各0.2μM,RVE-01正反引物各0.28μM,PCR反應(yīng)條件中退火溫度為51.9℃,其他均與多重PCR組合A的反應(yīng)體系及條件相同。

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