[發明專利]一種尿蛋白制備方法及尿蛋白質組的檢測方法在審
| 申請號: | 201710048099.6 | 申請日: | 2017-01-20 |
| 公開(公告)號: | CN108333263A | 公開(公告)日: | 2018-07-27 |
| 發明(設計)人: | 秦鈞;冷文川;倪曉天;路天元;甄蓓;王廣舜;孫長青;鐘博文 | 申請(專利權)人: | 北京蛋白質組研究中心 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02;G01N30/06 |
| 代理公司: | 北京驥馳知識產權代理有限公司 11422 | 代理人: | 唐曉峰 |
| 地址: | 102206 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 沉淀 尿蛋白 尿蛋白質 制備 檢測 重懸 蛋白 高通量定量 清洗緩沖液 消化緩沖液 超速離心 蛋白分離 高速離心 尿液樣品 一維電泳 制備過程 質譜鑒定 常溫下 二硫鍵 還原劑 緩沖液 上清液 重懸液 肽水平 保留 可用 酶解 加熱 溶解 | ||
1.一種尿蛋白制備方法,包括下面步驟:
(1)將尿液樣品在常溫下超速離心一段時間,棄去上清液,保留沉淀;
(2)向步驟(1)所述的沉淀中加入適量的重懸緩沖液使沉淀重懸;
(3)向步驟(2)所得的重懸液中加入能打開二硫鍵的還原劑,于37-80℃溫度下加熱10-60分鐘;
(4)向步驟(3)所得的溶液中添加清洗緩沖液,然后高速離心一段時間,棄去上清,保留沉淀;
(5)用消化緩沖液重新溶解步驟(4)所得的沉淀,之后進行蛋白的溶液內酶解,或用一維電泳(SDS-PAGE)進行蛋白分離。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,
所述步驟(1)中,所述尿液樣品的量為100微升(ul)至50毫升(ml),優選地1ml-10ml;超速離心的離心力為100000-300000g,優選地200000g;所述的常溫為4-25℃,典型地20℃;和/或所述時間為20-120分鐘,更優選地60-80分鐘,最優選75分鐘;
所述步驟(2)中,所述重懸緩沖液為50mM Tris,250mM蔗糖,pH8.5;加入重懸緩沖液后在室溫靜置約5-60分鐘,然后充分吹打重懸沉淀;
所述步驟(3)中,所述還原劑為二硫蘇糖醇或β巰基乙醇;
所述步驟(4)中,所述清洗緩沖液為10mM三乙醇胺,100mM氯化鈉,pH7.4),超速離心的條件同上述步驟(1)中的條件;
和/或
所述步驟(5)中,所述消化緩沖液為50mM碳酸氫銨緩沖液(50mM NH4HCO3,pH8.5)。
3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,步驟(3)中所述溫度為60-70℃,優選65℃。
4.一種富集尿蛋白的方法,包括如下步驟:
(1)向尿液中加入適量硅藻土或含硅藻土成分的固體,搖勻;
(2)于37-100℃的溫度下加熱上述步驟(1)中得到的混合物,然后冷卻至常溫,例如4-25℃;
(3)常溫如4-25℃旋轉混合,離心,棄上清;
(4)加入消化緩沖液,進行富集尿蛋白的溶液內酶切;
優選地,
(1)向1毫升尿液中加入10毫克硅藻土或含硅藻土成分的固體,搖勻;
(2)37-100℃加熱5分鐘,冷卻至常溫;
(3)室溫旋轉混合30分鐘,12000rpm離心5分鐘,棄上清;
(4)加30-100微升的消化緩沖液,進行富集尿蛋白的溶液內酶切。
5.一種尿蛋白質組的檢測方法,包括尿蛋白的制備、在蛋白或肽水平的分離、質譜鑒定,其特征在于,所述尿蛋白按照權利要求1-4任一項所述的方法制備。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述分離為電泳分離;優選地,聚丙烯酰胺凝膠電泳分離。
7.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述分離為蛋白的溶液內酶解;優選地,酶解前用消化緩沖液重溶。
8.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述質譜鑒定為液相色譜-質譜聯用鑒定。
9.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述質譜鑒定為液相色譜二級質譜聯用鑒定。
10.根據權利要求1-9任一項所述的方法,其特征在于,所述緩沖液為:
重懸緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH7.0-8.5的任何緩沖鹽溶液(如Tris或磷酸鹽緩沖液等)以及50-500mM的蔗糖、葡聚糖或海藻糖等能提供合適滲透壓的物質;在典型應用中,重懸緩沖液的成分為50mM Tris,250mM蔗糖,pH8.5;
清洗緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH6.5-8.0的任何緩沖鹽溶液(如Tris或三乙醇胺緩沖液等)以及50-300mM的鹽溶液;在典型應用中,清洗緩沖液的成分為10mM三乙醇胺和100mM氯化鈉,pH8.5;
消化緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH8.0-8.5的碳酸氫銨或Tris緩沖液,含或不含去污劑(如10-100mM的Tris或碳酸氫銨,含或不含0.1-2%的脫氧膽酸鈉)。
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