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[發明專利]一種尿蛋白制備方法及尿蛋白質組的檢測方法在審

專利信息
申請號: 201710048099.6 申請日: 2017-01-20
公開(公告)號: CN108333263A 公開(公告)日: 2018-07-27
發明(設計)人: 秦鈞;冷文川;倪曉天;路天元;甄蓓;王廣舜;孫長青;鐘博文 申請(專利權)人: 北京蛋白質組研究中心
主分類號: G01N30/02 分類號: G01N30/02;G01N30/06
代理公司: 北京驥馳知識產權代理有限公司 11422 代理人: 唐曉峰
地址: 102206 *** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 沉淀 尿蛋白 尿蛋白質 制備 檢測 重懸 蛋白 高通量定量 清洗緩沖液 消化緩沖液 超速離心 蛋白分離 高速離心 尿液樣品 一維電泳 制備過程 質譜鑒定 常溫下 二硫鍵 還原劑 緩沖液 上清液 重懸液 肽水平 保留 可用 酶解 加熱 溶解
【權利要求書】:

1.一種尿蛋白制備方法,包括下面步驟:

(1)將尿液樣品在常溫下超速離心一段時間,棄去上清液,保留沉淀;

(2)向步驟(1)所述的沉淀中加入適量的重懸緩沖液使沉淀重懸;

(3)向步驟(2)所得的重懸液中加入能打開二硫鍵的還原劑,于37-80℃溫度下加熱10-60分鐘;

(4)向步驟(3)所得的溶液中添加清洗緩沖液,然后高速離心一段時間,棄去上清,保留沉淀;

(5)用消化緩沖液重新溶解步驟(4)所得的沉淀,之后進行蛋白的溶液內酶解,或用一維電泳(SDS-PAGE)進行蛋白分離。

2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,

所述步驟(1)中,所述尿液樣品的量為100微升(ul)至50毫升(ml),優選地1ml-10ml;超速離心的離心力為100000-300000g,優選地200000g;所述的常溫為4-25℃,典型地20℃;和/或所述時間為20-120分鐘,更優選地60-80分鐘,最優選75分鐘;

所述步驟(2)中,所述重懸緩沖液為50mM Tris,250mM蔗糖,pH8.5;加入重懸緩沖液后在室溫靜置約5-60分鐘,然后充分吹打重懸沉淀;

所述步驟(3)中,所述還原劑為二硫蘇糖醇或β巰基乙醇;

所述步驟(4)中,所述清洗緩沖液為10mM三乙醇胺,100mM氯化鈉,pH7.4),超速離心的條件同上述步驟(1)中的條件;

和/或

所述步驟(5)中,所述消化緩沖液為50mM碳酸氫銨緩沖液(50mM NH4HCO3,pH8.5)。

3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,步驟(3)中所述溫度為60-70℃,優選65℃。

4.一種富集尿蛋白的方法,包括如下步驟:

(1)向尿液中加入適量硅藻土或含硅藻土成分的固體,搖勻;

(2)于37-100℃的溫度下加熱上述步驟(1)中得到的混合物,然后冷卻至常溫,例如4-25℃;

(3)常溫如4-25℃旋轉混合,離心,棄上清;

(4)加入消化緩沖液,進行富集尿蛋白的溶液內酶切;

優選地,

(1)向1毫升尿液中加入10毫克硅藻土或含硅藻土成分的固體,搖勻;

(2)37-100℃加熱5分鐘,冷卻至常溫;

(3)室溫旋轉混合30分鐘,12000rpm離心5分鐘,棄上清;

(4)加30-100微升的消化緩沖液,進行富集尿蛋白的溶液內酶切。

5.一種尿蛋白質組的檢測方法,包括尿蛋白的制備、在蛋白或肽水平的分離、質譜鑒定,其特征在于,所述尿蛋白按照權利要求1-4任一項所述的方法制備。

6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述分離為電泳分離;優選地,聚丙烯酰胺凝膠電泳分離。

7.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述分離為蛋白的溶液內酶解;優選地,酶解前用消化緩沖液重溶。

8.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述質譜鑒定為液相色譜-質譜聯用鑒定。

9.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述質譜鑒定為液相色譜二級質譜聯用鑒定。

10.根據權利要求1-9任一項所述的方法,其特征在于,所述緩沖液為:

重懸緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH7.0-8.5的任何緩沖鹽溶液(如Tris或磷酸鹽緩沖液等)以及50-500mM的蔗糖、葡聚糖或海藻糖等能提供合適滲透壓的物質;在典型應用中,重懸緩沖液的成分為50mM Tris,250mM蔗糖,pH8.5;

清洗緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH6.5-8.0的任何緩沖鹽溶液(如Tris或三乙醇胺緩沖液等)以及50-300mM的鹽溶液;在典型應用中,清洗緩沖液的成分為10mM三乙醇胺和100mM氯化鈉,pH8.5;

消化緩沖液:包括濃度在10-100mM能提供緩沖范圍在pH8.0-8.5的碳酸氫銨或Tris緩沖液,含或不含去污劑(如10-100mM的Tris或碳酸氫銨,含或不含0.1-2%的脫氧膽酸鈉)。

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