[發明專利]用于檢測耐碳青霉烯類抗生素的七種耐藥基因的LAMP引物組合及其應用在審
| 申請號: | 201710017455.8 | 申請日: | 2017-01-11 |
| 公開(公告)號: | CN106754906A | 公開(公告)日: | 2017-05-31 |
| 發明(設計)人: | 張巖;劉瑩瑩;王顥婷;邢婉麗;程京 | 申請(專利權)人: | 博奧生物集團有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司11245 | 代理人: | 關暢,何葉喧 |
| 地址: | 102206 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 檢測 青霉 抗生素 耐藥 基因 lamp 引物 組合 及其 應用 | ||
1.引物組合,為如下(a1)或(a2)或(a3):
(a1)由引物組Ⅰ、引物組Ⅱ、引物組Ⅲ、引物組Ⅳ、引物組Ⅴ、引物組Ⅵ和引物組Ⅶ組成;
(a2)由所述引物組Ⅰ、所述引物組Ⅱ、所述引物組Ⅲ、所述引物組Ⅳ、所述引物組Ⅴ、所述引物組Ⅵ和所述引物組Ⅶ中的任意兩個、任意三個、任意四個、任意五個或任意六個組成;
(a3)所述引物組Ⅰ、所述引物組Ⅱ、所述引物組Ⅲ、所述引物組Ⅳ、所述引物組Ⅴ、所述引物組Ⅵ或所述引物組Ⅶ;
所述引物組Ⅰ由引物Ⅰ-F3、引物Ⅰ-B3、引物Ⅰ-FIP、引物Ⅰ-BIP、引物Ⅰ-LF和引物Ⅰ-LB組成;
所述引物Ⅰ-F3為如下(b1)或(b2);
(b1)序列表的序列1所示的單鏈DNA分子;
(b2)將序列1經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列1具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅰ-B3為如下(b3)或(b4);
(b3)序列表的序列2所示的單鏈DNA分子;
(b4)將序列2經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列2具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅰ-FIP為如下(b5)或(b6);
(b5)序列表的序列3所示的單鏈DNA分子;
(b6)將序列3經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列3具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅰ-BIP為如下(b7)或(b8);
(b7)序列表的序列4所示的單鏈DNA分子;
(b8)將序列4經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列4具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅰ-LF為如下(b9)或(b10);
(b9)序列表的序列5所示的單鏈DNA分子;
(b10)將序列5經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列5具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅰ-LB為如下(b11)或(b12);
(b11)序列表的序列6所示的單鏈DNA分子;
(b12)將序列6經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列6具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅱ由引物Ⅱ-F3、引物Ⅱ-B3、引物Ⅱ-FIP、引物Ⅱ-BIP、引物Ⅱ-LF和引物Ⅱ-LB組成;
所述引物Ⅱ-F3為如下(c1)或(c2);
(c1)序列表的序列7所示的單鏈DNA分子;
(c2)將序列7經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列7具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅱ-B3為如下(c3)或(c4);
(c3)序列表的序列8所示的單鏈DNA分子;
(c4)將序列8經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列8具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅱ-FIP為如下(c5)或(c6);
(c5)序列表的序列9所示的單鏈DNA分子;
(c6)將序列9經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列9具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅱ-BIP為如下(c7)或(c8);
(c7)序列表的序列10所示的單鏈DNA分子;
(c8)將序列10經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列10具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅱ-LF為如下(c9)或(c 10);
(c9)序列表的序列11所示的單鏈DNA分子;
(c10)將序列11經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列11具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅱ-LB為如下(c11)或(c12);
(c11)序列表的序列12所示的單鏈DNA分子;
(c12)將序列12經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列12具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅲ由引物Ⅲ-F3、引物Ⅲ-B3、引物Ⅲ-FIP、引物Ⅲ-BIP、引物Ⅲ-LF和引物Ⅲ-LB組成;
所述引物Ⅲ-F3為如下(d1)或(d2);
(d1)序列表的序列13所示的單鏈DNA分子;
(d2)將序列13經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列13具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅲ-B3為如下(d3)或(d4);
(d3)序列表的序列14所示的單鏈DNA分子;
(d4)將序列14經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列14具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅲ-FIP為如下(d5)或(d6);
(d5)序列表的序列15所示的單鏈DNA分子;
(d6)將序列15經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列15具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅲ-BIP為如下(d7)或(d8);
(d7)序列表的序列16所示的單鏈DNA分子;
(d8)將序列16經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列16具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅲ-LF為如下(d9)或(d10);
(d9)序列表的序列17所示的單鏈DNA分子;
(d10)將序列17經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列17具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅲ-LB為如下(d11)或(d12);
(d11)序列表的序列18所示的單鏈DNA分子;
(d12)將序列18經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列18具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅳ由引物Ⅳ-F3、引物Ⅳ-B3、引物Ⅳ-FIP、引物Ⅳ-BIP、引物Ⅳ-LF和引物Ⅳ-LB組成;
所述引物Ⅳ-F3為如下(e1)或(e2);
(e1)序列表的序列19所示的單鏈DNA分子;
(e2)將序列19經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列19具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅳ-B3為如下(e3)或(e4);
(e3)序列表的序列20所示的單鏈DNA分子;
(e4)將序列20經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列20具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅳ-FIP為如下(e5)或(e6);
(e5)序列表的序列21所示的單鏈DNA分子;
(e6)將序列21經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列21具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅳ-BIP為如下(e7)或(e8);
(e7)序列表的序列22所示的單鏈DNA分子;
(e8)將序列22經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列22具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅳ-LF為如下(e9)或(e10);
(e9)序列表的序列23所示的單鏈DNA分子;
(e10)將序列23經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列23具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅳ-LB為如下(e11)或(e12);
(e11)序列表的序列24所示的單鏈DNA分子;
(e12)將序列24經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列24具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅴ由引物Ⅴ-F3、引物Ⅴ-B3、引物Ⅴ-FIP、引物Ⅴ-BIP、引物Ⅴ-LF和引物Ⅴ-LB組成;
所述引物Ⅴ-F3為如下(f1)或(f2);
(f1)序列表的序列25所示的單鏈DNA分子;
(f2)將序列25經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列25具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅴ-B3為如下(f3)或(f4);
(f3)序列表的序列26所示的單鏈DNA分子;
(f4)將序列26經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列26具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅴ-FIP為如下(f5)或(f6);
(f5)序列表的序列27所示的單鏈DNA分子;
(f6)將序列27經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列27具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅴ-BIP為如下(f7)或(f8);
(f7)序列表的序列28所示的單鏈DNA分子;
(f8)將序列28經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列28具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅴ-LF為如下(f9)或(f10);
(f9)序列表的序列29所示的單鏈DNA分子;
(f10)將序列29經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列29具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅴ-LB為如下(f11)或(f12);
(f11)序列表的序列30所示的單鏈DNA分子;
(f12)將序列30經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列30具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅵ由引物Ⅵ-F3、引物Ⅵ-B3、引物Ⅵ-FIP、引物Ⅵ-BIP、引物Ⅵ-LF和引物Ⅵ-LB組成;
所述引物Ⅵ-F3為如下(g1)或(g2);
(g1)序列表的序列31所示的單鏈DNA分子;
(g2)將序列31經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列31具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅵ-B3為如下(g3)或(g4);
(g3)序列表的序列32所示的單鏈DNA分子;
(g4)將序列32經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列32具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅵ-FIP為如下(g5)或(g6);
(g5)序列表的序列33所示的單鏈DNA分子;
(g6)將序列33經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列33具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅵ-BIP為如下(g7)或(g8);
(g7)序列表的序列34所示的單鏈DNA分子;
(g8)將序列34經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列34具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅵ-LF為如下(g9)或(g10);
(g9)序列表的序列35所示的單鏈DNA分子;
(g10)將序列35經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列35具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅵ-LB為如下(g11)或(g12);
(g11)序列表的序列36所示的單鏈DNA分子;
(g12)將序列36經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列36具有相同功能的DNA分子;
所述引物組Ⅶ由引物Ⅶ-F3、引物Ⅶ-B3、引物Ⅶ-FIP、引物Ⅶ-BIP、引物Ⅶ-LF和引物Ⅶ-LB組成;
所述引物Ⅶ-F3為如下(h1)或(h2);
(h1)序列表的序列37所示的單鏈DNA分子;
(h2)將序列37經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列37具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅶ-B3為如下(h3)或(h4);
(h3)序列表的序列38所示的單鏈DNA分子;
(h4)將序列38經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列38具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅶ-FIP為如下(h5)或(h6);
(h5)序列表的序列39所示的單鏈DNA分子;
(h6)將序列39經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列39具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅶ-BIP為如下(h7)或(h8);
(h7)序列表的序列40所示的單鏈DNA分子;
(h8)將序列40經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列40具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅶ-LF為如下(h9)或(h10);
(h9)序列表的序列41所示的單鏈DNA分子;
(h10)將序列41經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列41具有相同功能的DNA分子;
所述引物Ⅶ-LB為如下(h11)或(h12);
(h11)序列表的序列42所示的單鏈DNA分子;
(h12)將序列42經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列42具有相同功能的DNA分子。
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