[發明專利]人類Y染色體29個STR基因座的熒光標記復合擴增試劑盒

在審

• 申請號: 201710004643.7
• 申請日: 2017-01-04
• 公開（公告）號: CN106755448A
• 公開（公告）日: 2017-05-31
• 發明（設計）人: 韋玉軍;吳遠航;李航;蘇軍
• 申請（專利權）人: 安徽安龍基因醫學檢驗所有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10
• 代理公司: 杭州君度專利代理事務所(特殊普通合伙)33240
• 代理人: 王桂名

技術領域

本發明涉及分子遺傳學領域，具體來說是一種人類Y染色體29個STR基因座的熒光標記復合擴增試劑盒。

背景技術

短串聯重復序列基因座(Short Tandem Repeat，STR) 遺傳標記又稱微衛星 DNA，其廣泛存在于原核及真核生物基因組中，是一類由2-6個核苷酸為重復單元組成的幾十至一百多個的核苷酸重復序列,不同數目的核心序列呈中聯重復排列,而長度呈現多態性,根據兩端保守性序列，設計引物，進行 PCR，然后通過聚丙烯酰胺、瓊脂糖凝膠電泳或毛細管電泳等檢測 STR遺傳標記的多態性 ,STR標記與其他遺傳標記物相比，STR基因座片段小、容易擴增,更適用于微量和降解檢材，各基因座的擴增條件相近而能夠復合擴增,因而具有快速、高效、準確、靈敏、信息量大等優點,尤其是在建立DNA數據庫方面，與以往RFLP等技術相比，STR復合擴増技術具有極大的優越性 。

Y染色體STR遺傳標記是指存在于人類Y染色體非重組區域的短串聯重復序列 ,目前，以各種形式確認并命名的Y-STR基因座己有220多個，將己發現的Y染色體STR遺傳標記與常染色體STR遺傳標記相比，大多數Y染色體STR遺傳標記具有復雜重復結構，含有兩種或兩種以上的不同重復單位，群體中個體的核心重復序列或重復次數不同，形成群體遺傳多態性,Y染色體STR遺傳標記具有男性特有、父系遺傳及單倍型造傳等三大特征，將其獨特性與STR位點分型檢測的優越性相結合，可進行法醫學個體識別、親子鑒定及DNA家譜構建等。

法醫上將突變率高于1 %的基因座稱為快速突變基因座(Rapidly Mutating Y- STR) ,快速突變基因座具有較高的相關男性區分能力，而且一般具有較高的多態性,但基因座突變率較高會干擾某些情況的Y-STR家系排査。

目前法醫上利用Y-STR進行建庫,主要功能是家系排査,縮小嫌疑人范圍，而非認定嫌疑人 ,在中國,特別是農村，主要是家族聚居的方式,在Y-STR建庫的實際操作過程中， 往往只對一個大家族中一個或者幾個成員進行采樣建庫,這樣在花費較小的情況下就能利用Y-STR快速縮小偵査范圍，然后通過比對常染色體STR,對嫌疑人進行認定,由于Y-STR建庫釆樣的一個或幾個人即代表了整個家系的Y-STR信息，這就存在一種不利的情況：嫌疑人屬于此家系一員，但與建庫對象Y-STR有3個或更多基因座分型不一致，此時容易將嫌疑人所屬的真實家系排除,如果建庫試劑盒中快速突變基因座較多，那么這種可能性會變得非常高 ,另一方面，由于Y-STR建庫主要目的不是認定嫌疑人，不需要區分相關男性，因而快速突變基因座的優勢在這里用處不大,所以，不建議在這種情況下使用快速突變率的基因座,然而，低突變率基因座往往多態性較低，不利于家系之間的區分 ,因此,需要基因座的數量要多，同時基因座的多態性要高，以保證Y-STR試劑金具有足夠高的整體多態性 。

目前市場上主流的商品化試劑盒通常采用的是五色熒光檢測技術,但隨著Y-STR建庫市場的擴大,現有的Y-STR試劑盒已無法滿足目前市場的需求，市場急需一個的個體別率更高，檢測基因座數更多的 Y-STR試劑盒,是STR熒光檢測試劑盒的必然趨勢。

市面上主流試劑盒有Yfiler、Yfiler Plus、PowerPlexY23、Goldeneye Y26、 STRtyper27Y、AGCU Database Y24等熒光檢測試劑盒,基因座數量分別為17個、27個、23個、26個、27個、24個,法醫學常用的 Yfiler的基因座數量較少，累積個體識別率較低，Yfiler已被確認在某些特定的人群中具有非常低的多態性, Yfiler P1us、STRtyper 27Y 、powerplex Y23、Goldeneye Y26分別含有7個、7個、2個和3個快速突變基因。

發明內容

本發明的目的是為了解決現有技術中的累積個體識別率較低、具有等位基因越界的風險的缺陷，提供一種人類Y染色體29個STR基因座的熒光標記復合擴增試劑盒來解決上述問題。