[發明專利]一種基于共線性基因開發標記鑒定大白菜-結球甘藍易位系的方法

有效

• 申請號: 201710004003.6
• 申請日: 2017-01-04
• 公開（公告）號: CN106701952B
• 公開（公告）日: 2020-11-03
• 發明（設計）人: 軒淑欣;蘇建輝;申書興;趙建軍;王彥華;馬聰
• 申請（專利權）人: 河北農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350
• 代理人: 湯東鳳

1.一種基于共線性基因開發標記鑒定大白菜-結球甘藍易位系的方法，其特征在于，包括：

a）確定大白菜-結球甘藍易位系中結球甘藍的基因片段區段；

獲得所述結球甘藍的基因片段區段及其側翼區域所有基因序列，以及大白菜中對應的共線性基因序列，并根據共線性基因序列的差異位點設計覆蓋差異位點區域的引物；

b）利用上述設計的引物分別對易位系親本大白菜和親本結球甘藍進行PCR擴增，根據擴增結果確定結球甘藍相對于大白菜特異的基因標記，所述基因標記滿足以下條件：結球甘藍有擴增產物但大白菜沒有擴增產物；或者二者均有擴增產物，但擴增條帶的位置不同；

c）利用上述基因標記，分別對易位系親本大白菜、親本結球甘藍和易位系自交后代進行PCR擴增，根據擴增結果獲得易位系的鑒定結果;

所述結球甘藍的基因片段區段及其側翼區域為結球甘藍C03染色體上游154444bp到1814490bp及其側翼20kb的區域；

所述基因標記選自以下基因序列中的一組或多組：SEQ ID No. 1+SEQ ID No. 2、SEQID No. 3+SEQ ID No. 4、SEQ ID No. 5+SEQ ID No. 6、SEQ ID No. 7+SEQ ID No. 8、SEQID No. 9+SEQ ID No. 10、SEQ ID No. 11+SEQ ID No. 12、SEQ ID No. 13+SEQ ID No.14、SEQ ID No. 15+SEQ ID No. 16、SEQ ID No. 17+SEQ ID No. 18、SEQ ID No. 19+SEQID No. 20、SEQ ID No. 21+SEQ ID No. 22、SEQ ID No. 23+SEQ ID No. 24、SEQ ID No.25+SEQ ID No. 26、SEQ ID No. 27+SEQ ID No. 28、SEQ ID No. 29+SEQ ID No. 30、SEQID No. 31+SEQ ID No. 32、SEQ ID No. 33+SEQ ID No. 34、SEQ ID No. 35+SEQ ID No.36、SEQ ID No. 37+SEQ ID No. 38、SEQ ID No. 39+SEQ ID No. 40、SEQ ID No. 41+SEQID No. 42、SEQ ID No. 43+SEQ ID No. 44、SEQ ID No. 45+SEQ ID No. 46、SEQ ID No.47+SEQ ID No. 48、SEQ ID No. 49+SEQ ID No. 50、SEQ ID No. 51+SEQ ID No. 52、SEQID No. 53+SEQ ID No. 54、SEQ ID No. 55+SEQ ID No. 56、SEQ ID No. 57+SEQ ID No.58、SEQ ID No. 59+SEQ ID No. 60、SEQ ID No. 61+SEQ ID No. 62、SEQ ID No. 63+SEQID No. 64、SEQ ID No. 65+SEQ ID No. 66、SEQ ID No. 67+SEQ ID No. 68、SEQ ID No.69+SEQ ID No. 70、SEQ ID No. 71+SEQ ID No. 72、SEQ ID No. 73+SEQ ID No. 74、SEQID No. 75+SEQ ID No. 76、SEQ ID No. 77+SEQ ID No. 78、SEQ ID No. 79+SEQ ID No.80、SEQ ID No. 81+SEQ ID No. 82、SEQ ID No. 83+SEQ ID No. 84、SEQ ID No. 85+SEQID No. 86、SEQ ID No. 87+SEQ ID No. 88、SEQ ID No. 89+SEQ ID No. 90、SEQ ID No.91+SEQ ID No. 92、SEQ ID No. 93+SEQ ID No. 94、SEQ ID No. 95+SEQ ID No. 96、SEQID No. 97+SEQ ID No. 98或SEQ ID No. 99+SEQ ID No. 100。

2.根據權利要求1所述的鑒定方法，其特征在于，所述步驟a）中，利用InDel標記法確定大白菜-結球甘藍易位系中結球甘藍的基因片段區段。