[發明專利]病理學明場像中的自動化染色查找

有效

• 申請號: 201680053670.7
• 申請日: 2016-09-16
• 公開（公告）號: CN108140104B
• 公開（公告）日: 2022-11-01
• 發明（設計）人: 華特.喬治斯庫;伯爾特.安娜達斯;艾倫.歐森;卡倫.薩利格瑪
• 申請（專利權）人: 徠卡生物系統公司
• 主分類號: G06V20/69
• 分類號: G06V20/69;G06T7/00;G01N21/64;G01N1/30
• 代理公司: 北京弘權知識產權代理有限公司 11363
• 代理人: 逯長明;許偉群

自動化染色查找。在一個實施方案中，接收包括一種或多種染色的樣本的圖像。針對所述圖像中的多個像素中的每一個，確定所述像素的光密度矢量。所述光密度矢量包括所述一種或多種染色中的每一種的值，并且表示光密度空間中的點，所述光密度空間具有等于所述一種或多種染色的數目的維數。將所述光密度矢量從所述光密度空間變換成更低維空間中的表示。所述更低維空間具有等于所述光密度空間的所述維數減一的維數。基于所述表示來識別與所述一種或多種染色中的每一種相對應的光密度矢量。

相關申請的交叉引用

本申請要求于2015年9月16日提交并且標題為“Automated Stain Finding inPathology Bright-Field Images”的美國臨時專利申請號62/219,526的優先權，其全部內容特此以引用方式并入本文。

發明背景

發明領域

本文描述的實施方案總體涉及自動化染色查找，并且更具體地，涉及病理學明場像中的染色查找。

相關技術描述

為了產生準確的結果，量化圖像中染色的量的數字病理學算法需要每種染色的光密度值。傳統上，光密度值是從用單染色著色的載片獲得，由用戶通過顏色挑選工具手動選擇多染色圖像中的每種染色的最純像素來獲得，或者從參考數據庫選擇每種染色的光密度值來獲得。這些方法中的每一種都具有顯著的缺點。

例如，單染色法要求分離地對來自同一組織的另外的樣本進行著色(例如，針對三種分離的染色具有三個另外的樣本)。這大大增加了所要求的勞動和時間的量。

使用顏色挑選工具(例如，新墨西哥州Corrales的Indica實驗室的ImageScopeEyedropper Tool^TM)手動選擇單獨的染色像素要求用戶手動選擇混合染色圖像中的每種染色的最純像素。這種方法存在準確性和再現性問題。例如，對于用戶來說難以通過肉眼定位圖像中的最純像素，從而導致準確性問題。另外，不同的用戶將可能選擇不同的像素來表示每種染色的最純像素，從而導致再現性問題。

使用參考數據庫來確定光密度值具有類似的缺點。例如，來自參考數據庫的光密度值與通過特定成像系統成像的特定組織上的特定染色的實際光密度值匹配的可能性非常低。這個結果導致準確性和再現性問題。另外，圖像可能包括在參考數據庫中不可獲得的染色，由此需要使用不同的方法來獲得光密度值。

所需要的是一種不存在常規方法的缺點的用于自動識別染色的方法。

發明內容

在一個實施方案中，公開一種方法。所述方法包括使用至少一個硬件處理器來：接收包括一種或多種染色的樣本的圖像；針對所述圖像中的多個像素中的每一個，確定所述像素的光密度矢量，其中所述光密度矢量包括所述一種或多種染色中的每一種的值，并且其中所述光密度矢量表示光密度空間中的點，所述光密度空間具有等于所述一種或多種染色的數目的維數；將所述光密度矢量從所述光密度空間變換成更低維空間中的表示，其中所述更低維空間具有等于所述光密度空間的所述維數減一的維數；并且基于所述表示來識別與所述一種或多種染色中的每一種相對應的光密度矢量。

在另外的實施方案中，公開一種系統。所述系統包括至少一個硬件處理器；以及一個或多個可執行軟件模塊，其在由所述至少一個硬件處理器執行時，接收包括一種或多種染色的樣本的圖像；針對所述圖像中的多個像素中的每一個，確定所述像素的光密度矢量，其中所述光密度矢量包括所述一種或多種染色中的每一種的值，并且其中所述光密度矢量表示光密度空間中的點，所述光密度空間具有等于所述一種或多種染色的數目的維數；將所述光密度矢量從所述光密度空間變換成更低維空間中的表示，其中所述更低維空間具有等于所述光密度空間的所述維數減一的維數；并且基于所述表示來識別與所述一種或多種染色中的每一種相對應的光密度矢量。