[發明專利]用于開發個性化藥物治療計劃和基于蛋白質組譜的靶向藥物開發的方法

在審

• 申請號: 201680048603.6
• 申請日: 2016-09-09
• 公開（公告）號: CN107923918A
• 公開（公告）日: 2018-04-17
• 發明（設計）人: 拉里·高德;羅伯特·柯克·德利勒;大衛·斯特林;瑞秋·奧斯多夫;敦·茲奇
• 申請（專利權）人: 私募蛋白質體公司
• 主分類號: G01N33/68
• 分類號: G01N33/68
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司11021
• 代理人: 單驍越

1.一種用于鑒定蛋白質靶標的方法，所述方法包括：

a)測定來自被診斷患有疾病的受試者的生物樣品以鑒定一種或多種蛋白質相對于參考樣品中所述蛋白質水平的改變的水平；以及

b)鑒定靶向所述表達改變的蛋白質中的一種或多種的一種或多種治療。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述蛋白質選自AGER、THBS2、CA3、MMP12、MMP-1、MMP-7、MMP-9、MMP-13、MMP-8、MMP-10、MMP-2、PIGR、DCN、PGAM1、CD36、FABP、ACP5、CCDC80、PPBP、LYVE1、STC1、SPON1、IL17RC、MMP1、CA1、SERPINC1、TPSB2、CKB/CKBM、NAMPT/PBEF、PPBP/CTAPIII、F9、DCTPP1、F5、SPOCK2、CAT、PF4、MDK、BGN、CKM、POSTN、PGLYRP1以及CXCL12。

3.如權利要求1或權利要求2所述的方法，其中所述參考樣品是來自所述受試者的正常組織的樣品，或正常組織的群體平均值。

4.如權利要求1至3中任一項所述的方法，其中所述蛋白質的所述水平相對于所述參考樣品中的所述水平改變至少4倍。

5.如權利要求4所述的方法，其中所述蛋白質的所述水平相對于所述參考樣品中的所述水平改變至少50倍。

6.如權利要求1至5中任一項所述的方法，其還包括向所述受試者施用所述一種或多種治療。

7.如權利要求1至6中任一項所述的方法，其還包括確定所述蛋白質中突變的存在的步驟。

8.如權利要求1至7中任一項所述的方法，其中所述疾病選自由以下各項組成的組：癌癥、代謝病癥、炎性疾病以及傳染性疾病。

9.如權利要求1至8中任一項所述的方法，其中所述生物樣品選自由以下各項組成的組：組織、全血、白細胞、外周血單核細胞、血沉棕黃層、血漿、血清、痰、眼淚、粘液、洗鼻液、鼻抽吸物、呼吸、尿、精液、唾液、腹膜沖洗物、腹水、囊液、腦膜液、羊水、腺液、胰液、淋巴液、胸膜液、細胞學液、乳頭抽吸液、支氣管抽吸物、支氣管刷檢物、滑液、關節抽吸液、器官分泌物、細胞、細胞提取物以及腦脊髓液。

10.如權利要求1至9中任一項所述的方法，其中所述測定包括使所述樣品與多種對所述蛋白質有特異性的適體接觸。

11.一種用于確定治療行動過程的方法，所述方法包括：

a)測定來自被診斷患有肺癌的受試者的組織樣品，以鑒定一種或多種選自以下各項的蛋白質相對于正常肺組織中所述蛋白質水平的改變的水平：AGER、THBS2、CA3、MMP12、MMP-1、MMP-7、MMP-9、MMP-13、MMP-8、MMP-10、MMP-2、PIGR、DCN、PGAM1、CD36、FABP、ACP5、CCDC80、PPBP、LYVE1、STC1、SPON1、IL17RC、MMP1、CA1、SERPINC1、TPSB2、CKB/CKBM、NAMPT/PBEF、PPBP/CTAPIII、F9、DCTPP1、F5、SPOCK2、CAT、PF4、MDK、BGN、CKM、POSTN、PGLYRP1以及CXCL12；以及

b)施用靶向所述表達改變的蛋白質中的一種或多種的一種或多種治療。

12.如權利要求11所述的方法，其中所述蛋白質的所述水平相對于正常肺組織中的所述水平改變至少4倍。

13.如權利要求11所述的方法，其中所述蛋白質的所述水平相對于正常肺組織中的所述水平改變至少50倍。

14.如權利要求11至13中任一項所述的方法，其還包括確定所述蛋白質中突變的存在的步驟。

15.如權利要求11至14中任一項所述的方法，其中所述測定包括使所述樣品與多種對所述蛋白質有特異性的適體接觸。

16.一種用于治療疾病的方法，所述方法包括：

a)測定來自被診斷患有疾病的受試者的生物樣品以鑒定一種或多種蛋白質相對于參考樣品中所述蛋白質水平的改變的水平；以及

b)向所述受試者施用靶向所述表達改變的蛋白質中的一種或多種的一種或多種治療。