[發明專利]與南瓜皮色基因連鎖的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201611178535.3
• 申請日: 2016-12-19
• 公開（公告）號: CN106636393B
• 公開（公告）日: 2017-12-19
• 發明（設計）人: 鐘玉娟;黃河勛;羅少波;吳廷全;李俊星
• 申請（專利權）人: 廣東省農業科學院蔬菜研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司44205
• 代理人: 鄭瑩

1.與南瓜皮色基因緊密連鎖的SNP分子標記，其為分子標記63809或分子標記30774，其特征在于，所述分子標記定位于中國南瓜8號連鎖群上，分別位于皮色基因兩側；

所述分子標記63809的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第195位堿基是SNP位點，其堿基為C或T；

所述分子標記30774的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第32位堿基是SNP位點，其堿基為A或T。

2.用于擴增權利要求1所述的SNP分子標記的引物對。

3.根據權利要求2所述的引物對，其特征在于，所述引物對為dCAPS引物對。

4.根據權利要求3所述的dCAPS引物對，其特征在于，用于檢測分子標記63809的dCAPS引物對的核苷酸序列如下所示：

F1：5’-TTCCAACAATTTCCCTCTACTGCGG-3’(SEQ ID NO.3),

R1：5’-TTGCTATTTTCTTGCATTCGATATCCAT-3’(SEQ ID NO.4)，

其對應的限制性核酸內切酶為NlaIII。

5.根據權利要求3所述的dCAPS引物對，其特征在于，用于檢測分子標記30774的dCAPS引物對的核苷酸序列如下所示：

F2：5’-CTTGATGAAATTTCCAGAGCCAAAAAGTCAG-3’(SEQ ID NO.5)，

R2：5’-TGCAAAAGATGGAGCGGCGTGTC-3’(SEQ ID NO.6)，

其對應的限制性核酸內切酶為Hpy188I。

6.權利要求1所述的SNP分子標記、權利要求2-5任一項所述的引物對在南瓜果皮顏色輔助育種中的應用。

7.一種用于南瓜果皮顏色輔助育種的試劑盒，其包括權利要求2-5任一項所述的引物對。

8.一種南瓜果皮顏色輔助育種的方法，包括如下步驟：

(1)提取待測南瓜基因組DNA；

(2)利用權利要求2-5任一項所述的引物對進行PCR擴增；

(3)對PCR產物進行測序，確定SNP位點堿基，從而判斷果皮顏色；或者使用對應的限制性核酸內切酶對PCR產物進行酶切，根據酶切結果判斷果皮顏色。