[發明專利]一種煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物及其方法有效
申請號: | 201611174200.4 | 申請日: | 2016-12-19 |
公開(公告)號: | CN107058611B | 公開(公告)日: | 2020-02-04 |
發明(設計)人: | 李凡;李月月;譚冠林;肖龍;馬龑;熊鋒;蘭平秀;陳小姣;何英云;譚松濤 | 申請(專利權)人: | 云南農業大學 |
主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12R1/94 |
代理公司: | 11453 北京名華博信知識產權代理有限公司 | 代理人: | 李中強 |
地址: | 650201 云南*** | 國省代碼: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 煙草花葉病毒 通用檢測 引物 病毒 擴增效果 保守區序列 病毒基因組 分子生物學 反向引物 檢測引物 正向引物 對引物 靈敏度 檢測 驗證 | ||
1.一種煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物,其特征在于:所述的煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物為:
正向引物TobamodF:5’-TKGAYGGNGTBCCNGGNTGYGG-3’,
反向引物TobamodR:5’-ACNGAVTBNABCTGTAATTGCTAT-3’;
所述的檢測引物中N可以是A、C、G、T四種堿基中的任意一種,K為G和T中的一種,Y為C和T中的一種,B為C、G、T中的一種,V為A、C、G中的一種。
2.根據權利要求1所述的一種煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物,其特征在于:所述檢測引物對TMGMV擴增出871bp的產物,對PMMoV擴增出877bp的產物,對TMV、ToMV、ToMMV擴增出880bp的產物,對ORSV擴增出889bp的產物,對CGMMV擴增出874bp的產物。
3.一種煙草花葉病毒屬病毒通用檢測方法,其特征在于:利用權利要求1所述的煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物進行檢測,包括以下具體步驟:
RT反應體系:反轉錄試劑盒為PrimeScript 1st strand cDNA Synthesis Kit或 TaKaRa Reverse Transcriptase M-MLV RNase H- Kit,反應體系的總體積為10μL;PrimeScript 1st strand cDNA Synthesis Kit具體方法為,將含1-2μL的模板,0.5μL煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物反向引物,0.5μL 10mmol/L的dNTP mix,2-3μL ddH2O的混合液,混勻后65℃反應5min,反應結束迅速放冰上冷卻,之后加入含2μL的5×Primer Script Buffer,0.25μL 40U/μL的RNase Inhibitor,0.5μL 200U/μL的Primer Script RTase,2.25μL ddH2O的混合液,之后45℃反應1h,70℃反應15min終止反應;
TaKaRa Reverse Transcriptase M-MLV RNase H- Kit的具體方法為,將含2μL模板,1μL煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物反向引物,3μL ddH2O的混合樣混勻后,70℃下反應10min,迅速拿出放在冰上冷卻3min,之后加入含2μL 5×M-MLV Buffer,0.5μL 10mM的dNTPmix,0.5μL RTase M-MLV,1μL ddH2O的混合液,在42℃反應1h,70℃下15min反應結束;
PCR反應體系:PCR擴增試劑盒為2×Es Taq MasterMix,反應體系的總體積為10μL,含5μL 2×Es Taq MasterMix,1μL cDNA模板,0.2-0.4μL煙草花葉病毒屬病毒通用檢測引物正向引物,0.2-0.4μL煙草花葉病毒屬通用引物反向引物, 3.2-3.6μL ddH2O;
反應程序:94℃預變性2min;94℃變性30s,45-55℃退火30s,72℃延伸0.5-1min,循環30-35次;72℃延伸5-10min;4℃終止反應;
反應產物經1%瓊脂糖凝膠電泳后在紫外燈下觀察結果。
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