[發明專利]一種蜱蟲巢式PCR特異性引物及蜱蟲巢式PCR鑒定方法有效
| 申請號: | 201611138265.3 | 申請日: | 2016-12-12 |
| 公開(公告)號: | CN106755374B | 公開(公告)日: | 2017-12-12 |
| 發明(設計)人: | 王素華;閆寶龍;帥江冰;吳紹強 | 申請(專利權)人: | 溫州出入境檢驗檢疫局綜合技術服務中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 溫州金甌專利事務所(普通合伙)33237 | 代理人: | 王堅強 |
| 地址: | 325000 *** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 蜱蟲巢式 pcr 特異性 引物 鑒定 方法 | ||
1.一種蜱蟲巢式PCR特異性引物,其特征在于,包括設計的兩對特異性引物,具體為:
T18sF1:5`-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3`;
T18sR1:5`-TCCGCAGGTTCACCTACGGA-3`;
T18sF2:5`-CAARTGTCTGCCYTATCAACT-3`;
T18sR2:5`-CTTCCGTCAATTCCTTTAAG-3`。
2.一種采用權利要求1所述的特異性引物的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)將需要檢測的蜱蟲樣品進行形態學上初步分型;
(2)將經過形態學初步分型鑒定處理后的蜱蟲樣品,每種各取一只,進行基因組提取DNA,蜱蟲樣品無需RNA酶處理;
(3)以蜱蟲樣品基因組DNA為模板,以權利要求1中所述的T18sF1+T18sR1為第一套引物,加入LAtaq酶、dNTP、10×Loading buffer、雙蒸水,進行第一輪PCR;
(4)以第一輪PCR產物DNA為模板,分別以權利要求1中所述的T18sF1+T18sR2、T18sF2+T18sR1為第二套引物,加入LAtaq酶、dNTP、10×Loading buffer、雙蒸水,進行第二輪PCR;
(5)取第二輪PCR產物進行1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定;
(6)將第二輪PCR產物進行序列測定;
(7)根據NCBI數據庫中記載的蜱蟲18s rRNA基因序列,進行系統進化分析,最終得出蜱蟲樣品鑒定結果。
3.根據權利要求2所述的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,所述的步驟(3)中的第一輪PCR反應條件為:
95℃預熱5min;
94℃保持1min,60℃保持1min,72℃保持2min,該步驟進行共10個循環;
末次延伸至72℃,保持10min,4℃保存10min。
4.根據權利要求2所述的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,所述的步驟(4)中的第二輪PCR反應條件為:
95℃,預熱5min;
94℃保持1min,60℃保持1min,72℃保持2min,該步驟進行共25個循環;
末次延伸至72℃,保持10min,4℃保存10min。
5.根據權利要求2所述的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,所述的步驟(3)中蜱蟲樣品基因組DNA量為2μl,第一套引物中T18sF1+T18sR1各為1μl,LAtaq酶為0.25μl,dNTP為2μl,10×Loadingbuffer為2.5μl,雙蒸水16.25μl。
6.根據權利要求2所述的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,所述的步驟(4)中第一輪PCR產物DNA量為1μl,第二套引物T18sF1+T18sR2、T18sF2+T18sR1各為1μl,LAtaq酶為0.25μl,dNTP為2μl,10×Loading buffer為2.5μl,雙蒸水17.25μl。
7.根據權利要求2所述的蜱蟲巢式PCR鑒定方法,其特征在于,所述的步驟(5)中第二輪PCR產物量為2μl。
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