[發(fā)明專利]一種分析處理農(nóng)作物熒光毛細(xì)管電泳圖譜的方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201611102078.X
• 申請(qǐng)日: 2016-12-05
• 公開（公告）號(hào): CN106591443B
• 公開（公告）日: 2017-11-28
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張憲晨;朱麗;劉越;閆珍臣
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 北京華生恒業(yè)科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;G06F19/26
• 代理公司: 北京精金石專利代理事務(wù)所(普通合伙)11470
• 代理人: 劉曄

1.一種分析處理農(nóng)作物熒光標(biāo)記檢測(cè)圖譜的裝置，所述裝置包括曲線處理、內(nèi)標(biāo)校準(zhǔn)以及片段分析和基因分型3個(gè)模塊，其特征在于，曲線處理模塊中包括拔起峰處理子模塊，所述拔起峰處理模塊包括以下單元：

重合峰定位單元，用于將A色帶與B色帶做對(duì)比，熒光標(biāo)記檢測(cè)圖譜上有兩種不同顏色的熒光波譜，其中信號(hào)較強(qiáng)的波譜為A色帶，信號(hào)較弱的波譜為B色帶，找到B色帶中位置與A色帶峰的位置重合的峰，將這些峰定為重合峰，其中A色與B色熒光光譜有重疊并且A色帶會(huì)造成B色帶拔起；

重合峰分組單元，用于對(duì)重合峰分組，具體為：

當(dāng)定位單元所定位的重合峰的位置與內(nèi)標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)峰位置重合時(shí)，本單元將這些重合峰定位拔起峰I，

當(dāng)重合峰的位置既不在連續(xù)多峰段又不與內(nèi)標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)峰重合時(shí)，本單元將這些重合峰定位拔起峰II，

當(dāng)重合峰位于連續(xù)多峰段時(shí)，本單元將這些位于連續(xù)多峰段的重合峰定為準(zhǔn)拔起峰；

重合峰處理單元，用于分別處理分組后的重合峰，具體為：

記錄各個(gè)拔起峰I的位置以供后續(xù)內(nèi)標(biāo)校準(zhǔn)模塊參考并消除拔起峰I，

消除拔起峰II，

記錄準(zhǔn)拔起峰的總個(gè)數(shù)N以及各個(gè)準(zhǔn)拔起峰的位置X_i^B，其中，i是不小于0且不大于N的整數(shù)，

當(dāng)N為0時(shí)，結(jié)束拔起峰處理；

準(zhǔn)拔起峰分組單元，用于對(duì)準(zhǔn)拔起峰進(jìn)行分組，具體為：將位置為X_i^B±32幀的所有B色帶內(nèi)的峰分為第i組；

準(zhǔn)拔起峰再分組單元，用于對(duì)準(zhǔn)拔起峰進(jìn)行進(jìn)一步分組，具體為：準(zhǔn)拔起峰分組單元處理后的N個(gè)組進(jìn)行再分組，即找到每組中的最高峰，將最高峰及其左右兩峰分為這個(gè)組的一個(gè)子組1i，組內(nèi)的其他峰分為另一子組2i；

拔起峰III判斷單元，用于對(duì)準(zhǔn)拔起峰的判斷，具體為：準(zhǔn)拔起峰再分組單元確定的每隔ai子組內(nèi)，

a）將子組位置范圍內(nèi)A色帶的峰的峰高排序并將這個(gè)范圍內(nèi)的最高峰的位置定位X_ai^A，另外將子組內(nèi)最高峰的位置定位X_ai^B，

b）將X_ai^A與X_ai^B對(duì)比，若X_ai^A≠B_ai^B，子組ai中的所有峰都被判斷為不是拔起峰III，反之則進(jìn)行下一步判斷，

c）當(dāng)位置為X_ai^B的峰的峰高H_ai^B與位置為X_ai^A的峰的峰高H_ai^A之間的比例大于c時(shí)，位置為X_ai^B的峰被判斷為拔起峰III，其中c的取值依據(jù)被測(cè)物種調(diào)整，

d）按照步驟a）b）c），根據(jù)峰的位置和峰的高度判斷子組ai中其他峰是否為拔起峰III，

e）當(dāng)子組ai中拔起峰III的個(gè)數(shù)與子組ai中的所有峰的個(gè)數(shù)的比例低于0.75時(shí)，子組ai中的所有峰都被判定為都不是拔起峰III，反之則都是拔起峰III，

其中a為子組峰，a取值為1或2；

拔起峰III處理單元，用于將拔起峰III消除，并在其后結(jié)束拔起峰處理。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置，其特征在于：所述曲線處理模塊還包括釘子峰處理子模塊，所述釘子峰處理子模塊用于將由于電泳時(shí)電流不穩(wěn)定而導(dǎo)致的釘子狀尖峰去除。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的裝置，其特征在于：所述曲線處理模塊還包括飽和峰處理子模塊，所述飽和峰處理子模塊用于將由于峰強(qiáng)度超過了測(cè)序儀的閾值而導(dǎo)致的平頭或凹頭型飽和峰以及在該飽和峰下對(duì)應(yīng)出現(xiàn)的拔起峰相疊加從而形成一個(gè)完整的峰。

4.一種電子終端，其特征在于，所述電子終端包括權(quán)利要求1所述的處理分析農(nóng)作物熒光標(biāo)記檢測(cè)圖譜的裝置。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的裝置組成的電子終端，其特征在于，所述電子終端還包括：

通信模塊，用于通過有線和/或無線的方式將所述分析處理農(nóng)作物的熒光標(biāo)記檢測(cè)圖譜的裝置處理后的圖譜或圖譜對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)傳輸?shù)酵獠康钠渌O(shè)備。