[發明專利]豬背最長肌肌內脂肪生成相關的關鍵miRNA的篩選與注釋

在審

• 申請號: 201611098531.4
• 申請日: 2016-12-04
• 公開（公告）號: CN107016259A
• 公開（公告）日: 2017-08-04
• 發明（設計）人: 劉林清;王重龍;錢坤
• 申請（專利權）人: 安徽省農業科學院畜牧獸醫研究所
• 主分類號: G06F19/20
• 分類號: G06F19/20
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域：

本發明涉及生物養殖方法領域，特別涉及不同品種豬背最長肌肌內脂肪生成相關的關鍵miRNA的篩選與注釋。

背景技術：

隨著人們的生活水平的提高，消費者對豬肉品質的要求越來越高，如何在不降低生長速度的同時維持一個合適的肌內脂水平從而改良肉質已成為當前豬育種工作中的研究熱點和難點。肌內脂肪含量是評定肉質優劣的一項尤其重要的指標，肉的風味、多汁性及嫩度隨著肌內脂肪含量的增加而改善。中外豬種比較發現，國外豬種具有生長速度快、瘦肉率高和飼料轉化率高等優點，但往往存在肌內脂肪少、肉色灰白和系水力低等缺點，我國地方豬種具有肉色鮮紅、系水力強、肌內脂肪含量高和肌纖維直徑小等優點。本試驗選用肉質優良，但生長速度較慢的中國地方品種皖南花豬和生長速度快，但肉質較差的具有代表性的國外品種大約克豬作為研究對象，采用高通量miRNA-seq測序技術，對miRNA-seq數據進行差異表達分析；采用DAVID KEGG 分析在脂肪生成信號通路（Adipocytokine signaling pathway）中的差異表達miRNA及其預測的靶基因。

由于miRNA在眾多生物過程的調控，諸如生物發育、細胞增殖和凋亡以及近來被證明與腫瘤發生相關等領域發揮作用，因此miRNA的鑒定和定性研究成為迅速發展的一大研究領域。最典型的鑒定miRNAs的方法是檢測miRNA的表達譜，如果發現某一種miRNA在某種特定組織或細胞中特異性表達的話，此miRNA將被假定在此特定組織或細胞中發揮某種調控作用。同樣，如果某一種miRNA在生物特殊發育階段表達的話，則它有可能是調控發育進程一個主要分子。高通量測序技術既能捕捉真實存在的小RNA，同時也能對沒有注釋的小片段RNA進行預測，更重要的通量的增加甚至可以捕捉體內一些低表達的小RNA，在小RNA檢測方面確實具有極大的優勢，在人、鼠、牛、雞、豬等物種上的miRNA-Seq都已有報道。

例如：【英文作者】Cai Z¹, Zhang L², Jiang X³, Sheng Y³, Xu N⁴（1、College of Animal Science, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China; Laboratory Animal Research Center, Zhejiang Chinese Medical University, Hangzhou 310053, China；2、College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China；3、College of Animal Science, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China；4、College of Animal Science, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China.

【機構】1、浙江大學，動物科學院；浙江中醫藥大學，動物研究中心實驗室2、南京農業大學，動物科技技術院3、浙江大學，動物科學院4、浙江大學，動物科學院

【刊名】Res Vet Sci

【英文關鍵詞】Castration; Expression; MicroRNA; Pig; Skeletal muscle

【中文關鍵詞】閹割；表達；miRNA;豬；骨骼肌

【摘要】在大多數哺乳動物中miRNAs在骨骼肌發育過程中起到重要的調節的作用，但是其在閹割的公豬的骨骼肌中的作用還沒有研究。本試驗的目的為鑒定閹割豬的背最長肌中miRNAs的作用。結果表明，閹割引起顯著降低血清睪酮水平，但是會提高其脂肪含量。然而，在閹割后的骨骼肌中的miRNAs的表達譜的顯著性分析發現7個顯著性差異的miRNAs。更重要的，功能分析發現這些差異表達的miRNAs及其靶基因全都參與調節骨骼肌的收縮及脂肪代謝。總之，這些結果表明，閹割公豬的骨骼肌的改變的miRNA的表達，會是一個對閹割豬骨骼肌生長潛在的影響機制。

此論文研究了閹割公豬的骨骼肌的改變的miRNA的表達。

和：Siengdee P¹, Trakooljul N, Murani E, Schwerin M, Wimmers K, Ponsuksili S