[發明專利]與白葉枯病抗性基因Xa7緊密連鎖的SNP分子標記有效
| 申請號： | 201610990500.3 | 申請日： | 2016-11-10 |
| 公開（公告）號： | CN106636349B | 公開（公告）日： | 2020-08-25 |
| 發明（設計）人： | 鄭秀婷;彭佩;江南;李為國;熊艷文;李繼明 | 申請（專利權）人： | 華智水稻生物技術有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京路浩知識產權代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 410013 湖南省長沙*** | 國省代碼： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 白葉枯病 抗性 基因 xa7 緊密 連鎖 snp 分子 標記 | ||
1.SNP分子標記的檢測試劑在檢測水稻白葉枯病抗性基因Xa7中的應用，其特征在于，所述SNP分子標記的序列如SEQ ID No.1所示，第61bp位點處的堿基為C或G。
2.引物組合或含有所述引物組合的試劑或試劑盒在檢測與水稻白葉枯病抗性基因Xa7緊密連鎖的SNP分子標記中的應用；
所述引物組合包括：
(1)兩條特異性引物：
Primer X：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAC-3’；
Primer Y：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAG-3’；
其中，兩條特異性引物分別連接不同的熒光序列；
(2)一條通用引物：
Primer C：5’-GCTGACATGCATCTTCACAT-3’。
3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，包括如下步驟：
S1、提取水稻樣品基因組DNA；
S2、以水稻基因組DNA為模板，利用所述引物組合進行KASP反應檢測；
S3、若只檢測到引物Primer Y所連熒光序列對應的熒光信號，則判斷水稻樣品為攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的純和型；若只檢測到引物Primer X所連熒光序列對應的熒光信號，則判斷水稻樣品為不攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的純和型；若同時檢測到兩種熒光，則判斷水稻樣品為攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的雜合型。
4.與水稻白葉枯病抗性基因Xa7緊密連鎖的SNP分子標記的檢測試劑在水稻抗病性輔助育種中的應用，其特征在于，所述SNP分子標記的序列如SEQ ID No.1所示，第61bp位點處的堿基為C或G。
5.根據權利要求4所述的應用，其特征在于，包括如下步驟：
S1、提取水稻樣品基因組DNA；
S2、以水稻基因組DNA為模板，利用引物組合進行KASP反應檢測；其中，所述引物組合包括：
(1)兩條特異性引物：
Primer X：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAC-3’；
Primer Y：5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAG-3’；
兩條特異性引物分別連接不同的熒光序列；
(2)一條通用引物：
Primer C：5’-GCTGACATGCATCTTCACAT-3’；
S3、選擇檢測到引物Primer Y所連熒光序列對應的熒光信號的水稻樣品進行育種。
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