[發(fā)明專利]一種Ⅱ型糖尿病風(fēng)險評估模型的構(gòu)建方法和構(gòu)建系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610801091.8 | 申請日: | 2016-09-05 |
| 公開(公告)號: | CN107256323B | 公開(公告)日: | 2020-11-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 萬旗東;李慶輝;金剛 | 申請(專利權(quán))人: | 云健康基因科技(上海)有限公司 |
| 主分類號: | G16H50/30 | 分類號: | G16H50/30;G16B20/30;G16B50/00 |
| 代理公司: | 上海智信專利代理有限公司 31002 | 代理人: | 吳林松;孔翰 |
| 地址: | 201499 上海市奉*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 糖尿病 風(fēng)險 評估 模型 構(gòu)建 方法 系統(tǒng) | ||
一種Ⅱ型糖尿病風(fēng)險評估模型的構(gòu)建方法和構(gòu)建系統(tǒng),方法包括:(1)選取與Ⅱ型糖尿病相關(guān)聯(lián)的SNP位點;(2)計算SNP位點的風(fēng)險度即OR值;(3)計算SNP位點在東亞人群的頻率;(4)計算Ⅱ型糖尿病的流行病學(xué)患病率;(5)根據(jù)貝葉斯算法和哈迪?溫伯格平衡原理,構(gòu)建風(fēng)險評估模型。本發(fā)明的模型通過計算人群風(fēng)險等位基因數(shù)量的數(shù)學(xué)期望和OR值,結(jié)合Ⅱ型糖尿病的流行病學(xué)患病率,得到群體基于遺傳的平均患病率和置信區(qū)間,提供了一種新的Ⅱ型糖尿病風(fēng)險評估模型的構(gòu)建方法,使Ⅱ型糖尿病的患病風(fēng)險更接近于真實情況,結(jié)果更加科學(xué)、合理。本發(fā)明提高了高風(fēng)險人群篩查的準確性,有望降低Ⅱ型糖尿病的發(fā)病率,為國家和社會節(jié)約大筆開支,利國利民。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于多基因疾病的遺傳風(fēng)險評估領(lǐng)域,涉及一種Ⅱ型糖尿病風(fēng)險評估模型的構(gòu)建方法和構(gòu)建系統(tǒng),具體涉及一種基于貝葉斯算法和流行病學(xué)患病率構(gòu)建而成的多基因疾病的風(fēng)險評估模型的方法和系統(tǒng)。
背景技術(shù)
在我國糖尿病的患病人群中,Ⅱ型糖尿病占90.0%以上,1型糖尿病約占5.0%,城市妊娠糖尿病的患病率接近5.0%,其他類型糖尿病僅占約0.7%。表1顯示了Ⅱ型糖尿病特點、癥狀和并發(fā)癥:
表1Ⅱ型糖尿病特點、癥狀和并發(fā)癥
Ⅱ型糖尿病的主要癥狀有高血糖、不同程度的胰島素抵抗和胰島素分泌功能受損。Ⅱ型糖尿病會給患者帶來各種生活不便,例如口渴,無力,視力下降等。血液中過高的血糖濃度對血管和器官會造成傷害,引起各種并發(fā)癥,對患者造成較大痛苦。其發(fā)病原因除了環(huán)境因素、生活方式因素、年齡因素等之外,還有基因因素。
近年來,研究發(fā)現(xiàn)了多種基因與Ⅱ型糖尿病相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)為基于個人基因組測序預(yù)測疾病風(fēng)險提供了一種可能。目前,基于二代測序進行疾病風(fēng)險預(yù)測的大致流程如下:首先,針對特定疾病建立基因和疾病風(fēng)險的關(guān)系;其次,針對該疾病的風(fēng)險基因信息建立疾病風(fēng)險評估模型;最后,將個體基因序列信息輸入到疾病風(fēng)險評估模型中獲得疾病風(fēng)險。因此,疾病風(fēng)險預(yù)測中的兩個關(guān)鍵點是建立基因與疾病的關(guān)系和疾病風(fēng)險評估模型。
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