[發(fā)明專利]專門用于快速大量提取口腔上皮細(xì)胞DNA的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610769029.5 | 申請日: | 2016-08-30 |
| 公開(公告)號: | CN107794255A | 公開(公告)日: | 2018-03-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 孫麟;馬潔;張同 | 申請(專利權(quán))人: | 天津市康婷生物工程有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 天津盛理知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司12209 | 代理人: | 趙瑤瑤 |
| 地址: | 300200 天津市西青經(jīng)濟(jì)*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 專門 用于 快速 大量 提取 口腔 上皮細(xì)胞 dna 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域,尤其是一種專門用于快速大量提取口腔上皮細(xì)胞DNA的方法。
背景技術(shù)
基因檢測是通過提取被測者的血液、其他液體或者組織細(xì)胞對DNA進(jìn)行檢測的技術(shù)。目前,隨著生物技術(shù)的發(fā)展,基因檢測已經(jīng)逐步成為繼傳統(tǒng)體檢以外的新興的疾病健康檢測手段。
脫氧核糖核酸(DNA)提取是基因檢測的一個基本步驟,也是整個基因檢測的基礎(chǔ),核酸的濃度和純度的質(zhì)量直接關(guān)系到后續(xù)的檢測能否成功。相較于傳統(tǒng)體檢,基因檢測可以直接提取被測者的口腔上皮細(xì)胞的DNA,具有無痛無創(chuàng)口的優(yōu)勢。因此,口腔上皮細(xì)胞DNA的提取,成為基因檢測的主流DNA提取方法。
目前,市場上,用于口腔上皮細(xì)胞DNA提取的方法主要分為離心柱法和磁珠法。離心柱法的主要原理是:離心柱中的膜可以對細(xì)胞破碎后的DNA的進(jìn)行特異性的吸附,其余的細(xì)胞裂解物由于不能吸附在離心柱上,而被巨大的離心力甩出離心柱,最后對膜進(jìn)行洗脫而得到所需的DNA。離心柱法的主要缺陷是特異性吸附柱對DNA的吸附效率不高,從而導(dǎo)致得到的DNA的量相對較少。磁珠法的主要原理大體與柱提法相似,即通過可對DNA特細(xì)異性吸附的磁珠,使用清洗液對其它的細(xì)胞裂解物進(jìn)行去除。最后由于磁珠具有磁性,可以吸附在磁力架上,所以特異性吸附的DNA不會被清洗,從而達(dá)到分離純化DNA的目的。由于特異性吸附DNA的磁珠不可重復(fù)使用,而且其造價較貴,所以導(dǎo)致磁珠法成本較高。而且這2種方法的操作步驟較為繁瑣,需要花費(fèi)較長的時間。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足之處,提供一種提取口腔上皮細(xì)胞基因組的DNA方法,能夠穩(wěn)定高效的提取口腔上皮細(xì)胞基因組DNA。
本發(fā)明實(shí)現(xiàn)目的的技術(shù)方案如下:
一種專門用于快速大量提取口腔上皮細(xì)胞DNA的方法,步驟如下:
⑴收集樣品細(xì)胞
用2個口腔拭子分別刮取口腔左右兩側(cè)的口腔上皮細(xì)胞,并把拭子頭轉(zhuǎn)移到2個含1ml去離子水的1.5ml的離心管中;震動離心管,使細(xì)胞從拭子上盡可能多的脫落,然后將2個含有口腔上皮細(xì)胞的1.5ml管離心,轉(zhuǎn)速:800×g,時間:2分鐘;吸棄上清液,每個EP管加入500μl的無菌水,將其中一個EP管的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個EP管中,離心,轉(zhuǎn)速:800×g,時間:2分鐘;
⑵裂解細(xì)胞
吸棄上清液,向每管中加入500μl的溶液A,溶液A含9.5mmol/L的Tris-Cl,2mmol/L的EDTA,1%的SDS,3%的Triton-100,pH=8.5,加后加入50μl濃度為1mg/ml的蛋白酶K溶液,渦旋振蕩10秒鐘,放入55℃水浴內(nèi)15分鐘;每5分鐘振蕩一次;
⑶去除蛋白
短暫離心,將管壁上的殘留液體離至管底;加入200μl的醋酸鈉-冰醋酸溶液,劇烈振蕩20秒鐘,管中出現(xiàn)白色絮狀物;12000×g離心3分鐘,使白色物質(zhì)沉淀到離心管底部;
⑷沉淀DNA
吸取400-500μl的上清液到新的EP管中,加入800μl溶液B,溶液B組成為無水乙醇:異丙醇=1:3,振蕩10秒鐘,使上清液與異丙醇充分混合;12000×g離心3分鐘;
⑸乙醇洗滌
吸棄上清,加入800μl的75%乙醇,振蕩5秒鐘,12000×g離心2分鐘;吸棄上清,重復(fù)上述步驟一次;
⑹溶解DNA
小心吸棄上清,室溫下敞口干燥10分鐘;將DNA溶解到100μl的無菌水中;
⑺保存DNA
將DNA樣品做好標(biāo)記,放于指定位置-20℃或-80℃中保存。
而且,所述醋酸鈉-冰醋酸溶液為3M的Na+,5M的Ac-。
本發(fā)明的有益效果為:
本發(fā)明提供的方法相較于離心柱法和磁珠法,大大降低實(shí)驗(yàn)成本,相較于離心柱法和磁珠法,大大縮短DNA提取時間,相較于磁珠法,大大提高DNA提取的量。DNA純度在合理的區(qū)間范圍之內(nèi)。提取得到的基因組DNA不影響下游的分子實(shí)驗(yàn)。
附圖說明
圖1為口腔上皮細(xì)胞基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果圖;
圖2為qPCR的擴(kuò)增曲線;
表1為不同樣本口腔上皮細(xì)胞基因組DNA濃度、純度的檢測結(jié)果。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖并通過具體實(shí)施例對本發(fā)明作進(jìn)一步詳述,以下實(shí)施例只是描述性的,不是限定性的,不能以此限定本發(fā)明的保護(hù)范圍。
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