[發明專利]一種BRCA2基因突變體及其應用

在審

• 申請號: 201610685379.3
• 申請日: 2016-08-18
• 公開（公告）號: CN107760688A
• 公開（公告）日: 2018-03-06
• 發明（設計）人: 劉夢;王曉宏;邵康;曹博洋;李貴波;侯勇;朱師達
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因研究院
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C12Q1/6886;C07K14/47;G01N33/68;C12M1/34
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種分離的編碼BRCA2突變體核酸，其特征在于，所述核酸序列如SEQ ID NO：3所示，與SEQ ID NO：1相比，具有c.3467delC突變，

任選地，所述核酸為DNA。

2.根據如權利要求1所述編碼BRCA2突變體核酸在制備用于檢測生物樣品是否存在BRCA2基因突變的試劑盒的應用。

3.根據如權利要求2所述的試劑盒，其特征在于，含有：

適于檢測BRCA2基因突變的試劑，

任選地，所述試劑為該核酸探針或引物，

任選地，所述核酸探針或引物具有如SEQ ID NO：5-6所示的核苷酸序列。

4.一種由權利要求1所述的核酸編碼的多肽，其特征在于，所述多肽序列如SEQ ID NO：4所示，與SEQ ID NO：2相比，具有p.S1156fs的突變。

5.如權利要求4所述編碼BRCA2突變體多肽在制備用于檢測生物樣品是否存在BRCA2基因突變體的試劑盒的應用。

6.一種檢測權利要求1所述的BRCA2基因突變位點的方法，其特征在于，包括以下步驟：

從所述生物樣品提取核酸樣本；

確定所述核酸樣本的核酸序列；

所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，具有c.3467delC突變是所述生物樣品易患遺傳性乳腺癌的標記，

任選地，所述生物樣本為選自人體血液、皮膚、皮下組織的至少一種，

任選地，所述核酸樣本為選自外顯子組DNA、全基因組DNA的至少一種。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，從所述生物樣品提取核酸樣本進一步包括：

從所述生物樣品提取RNA樣本，優選所述RNA樣本為mRNA；以及

基于所述RNA樣本，通過逆轉錄反應，獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

8.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，確定所述核酸樣本的核酸序列進一步包括：

針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，任選地，采用選自Complete Genomics、Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種對所述核酸測序文庫進行測序，

任選地，針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫進一步包括：

利用BRCA2基因外顯子特異性引物對，對所述核酸樣本進行PCR擴增；以及

針對所得到的擴增產物，構建所述核酸測序文庫，

任選地，所述特異性引物具有如SEQ ID NO：5-6所示的核苷酸序列。

9.一種檢測如權利要求1所述的BRCA2基因突變位點的系統，其特征在于，包括：

核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；

核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；

判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，判斷所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，是否具有c.3467delC突變，

任選地，所述核酸提取裝置進一步包括：

RNA提取單元，所述RNA提取單元用于從所述生物樣品提取RNA樣本；以及

逆轉錄單元，所述逆轉錄單元與所述RNA提取單元相連，用于對所述RNA樣本進行逆轉錄反映，以便獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

10.根據權利要求9所述的系統，其特征在于，所述核酸序列確定裝置進一步包括：

文庫構建單元，所述文庫構建單元用于針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

測序單元，所述測序單元與所述文庫構建單元相連，用于對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，

任選地，所述文庫構建單元進一步包括：

PCR擴增模塊，所述PCR擴增模塊中設置有BRCA2基因外顯子特異性引物，以便利用所述特異性引物，對所述核酸樣本進行PCR擴增，

任選地，所述特異性引物具有如SEQ ID NO：5-6所示的核苷酸序列，

任選地，所述測序單元包括選自Complete Genomics、Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種。