[發明專利]一種豬細環病毒1型環介導等溫擴增試劑盒及其應用在審
| 申請號: | 201610259272.2 | 申請日: | 2016-04-25 |
| 公開(公告)號: | CN105779655A | 公開(公告)日: | 2016-07-20 |
| 發明(設計)人: | 何穎;陳忠偉;趙武;秦毅斌;盧冰霞;李斌;段群棚;周英寧;梁家幸;楊思儀;蔣冬福;蘇乾蓮 | 申請(專利權)人: | 廣西壯族自治區獸醫研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣州市紅荔專利代理有限公司 44214 | 代理人: | 李彥孚;何承鑫 |
| 地址: | 530000 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 種豬 病毒 型環介導 等溫 擴增 試劑盒 及其 應用 | ||
技術領域
本發明涉及微生物檢測技術領域,具體說是涉及一種快速、可視化并且可實時定 量檢測豬細環病毒1型的環介導等溫擴增試劑盒及其應用。
背景技術
豬細環病毒(Torquetenosusvirus,TTSuV)是一種無囊膜,單股負鏈的環形 DNA病毒,根據其核苷酸序列差異可將TTSuV分為兩個亞型即TTSuV1和TTSuV2,都屬于指 環病毒科(Anelloviridae),壬型指環病毒屬(Iotatorquevirus),由日本學者 Nishizawa等于1997年在輸血后的肝炎患者的血清中發現。但TTV宿主范圍非常廣泛,除 了能感染常見的家禽家畜外,也能感染包括人和其他靈長類動物。不同年齡段的豬群均對 豬細環病毒(Torquetenosusvirus,TTSuV)易感,我國豬群感染率大致在24%~100%, 其中根據王礞礞等于2008~2009年間采集了來自中國6個省市的發病豬和健康豬樣本的 檢測結果顯示,TTSuV1感染率約為37.6%,TTSuV2感染率約為82.6%,二者混合感染率為 38.4%。到現今為止,人們仍不清楚TTSuV的致病性,目前研究只了解到TTSuV與豬繁殖呼 吸綜合征病毒(PRRSV)、豬圓環病毒(PCV)等病毒存在某種協同作用,當發生混合感染 時會加重斷奶仔豬多系統衰竭綜合征(PMWS)和豬皮炎腎病綜合癥的癥狀。
對豬細環病毒1型的密切監測和快速診斷,有利于該病及其他協同感染疾病的防 治。當前,可通過常規PCR、熒光定量PCR、和套式PCR等技術手段來檢測TTSuV1的存在,但 這些技術在運用上尚存在著一些不足,并且對硬件方面有較高要求,在結果判定上還需進 行瓊脂糖凝膠電泳,容易造成實驗室污染導致出現假陽性結果,用時也較長,不適合基層和 現場檢測。因此建立一種簡單且靈敏的TTSuV1檢測方法,具有一定的臨床意義。
發明內容
本發明的目的是提供一種為基層簡便、快捷準確地檢測豬細環病毒1型的方法,公 開一種快速、實時定量的檢測豬細環病毒1型環介導等溫擴增試劑盒。為實現本發明目的所 使用的技術方案為:一種豬細環病毒1型環介導等溫擴增試劑盒,該試劑盒包括TTSuV1- LAMP引物、2×反應緩沖液、BstDNA聚合酶、熒光目視檢測試劑、超純水和TTSuV1-DNA模板, 所述的TTSuV1-LAMP引物包括外引物F3(SEQIDNO:1)與B3(SEQIDNO:2)、內引物FIP(SEQ IDNO:3)與BIP(SEQIDNO:4)和環引物LF(SEQIDNO:5)與LB(SEQIDNO:6);
其中引物的序列分別為:
F3AAGACCCCGCCAAGGTAC
B3CACTGCTCGTGCTTGAGAT
FIPTGTGGGGAGTTCGAGCAGTCTTCAGTCCTCAACCCTTGGGA
BIPGGAGGAGACGGAGAAGGCGTGCTCTCTTCGTCGGAGTCT
LFGTTCTAACAATCCTGTCACAGTCAT
LBACCCACTCCTTGGACAAAAGA
所述的2×反應緩沖液包括Tris-HCL、KCL、MgSO4、(NH4)2SO4、Tween20、Betaine和 dNTPs。
所述的豬細環病毒1型DNA模板,是使用病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒提取的疑 似感染豬細環病毒1型的臨床病變組織中的基因組DNA。
所述的熒光目視檢測試劑采用鈣黃綠素熒光試劑,熒光試劑在反應前加入。
所述的2×反應緩沖液包括Tris-HCL35-55mM、KCL10-30mM、MgSO415-28mM、 (NH4)2SO418-28mM、Tween200.5-1.5℅、Betaine1.3-3.5M和dNTPs2.4-4.8mM,其配制 方法在pH為8.6左右條件下,將上述溶劑混合均勻獲得。
一種豬細環病毒1型環介導等溫擴增試劑盒的應用,獸醫臨床上用于檢測疑似豬 細環病毒1型病變組織或培養物中是否含有豬細環病毒1型,具體檢測步驟包括:
(1)LAMP引物的設計與合成
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