[發(fā)明專利]重組核酸片段RecCR010374及其檢測引物與應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610258497.6 | 申請日： | 2016-04-22 |
| 公開（公告）號： | CN107304446B | 公開（公告）日： | 2021-11-26 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 喻輝輝;周發(fā)松;張學(xué)堂;邱樹青;何宗順;雷昉;姚玥;潘麗;李旭;李菁;韋懿;陳光;何予卿;楊毅;張啟發(fā) | 申請（專利權(quán)）人： | 中國種子集團(tuán)有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/02;A01H1/04 |
| 代理公司： | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 100045 北京市西*** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 重組 核酸 片段 reccr010374 及其 檢測 引物 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明涉及分子生物學(xué)，具體公開了一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段RecCR010374及其檢測引物與應(yīng)用。本發(fā)明還提供一種基于全基因組選擇育種技術(shù)選育含有抗稻瘟病基因組重組核酸片段的水稻植株的方法，將目標(biāo)基因組片段導(dǎo)入受體材料，并同時實(shí)現(xiàn)背景的回復(fù)。本發(fā)明改良的受體材料為‘中種恢629’，是高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、強(qiáng)優(yōu)廣譜恢復(fù)系。利用上述方法，可以在保留‘中種恢629’原有優(yōu)點(diǎn)的情況下大幅度提高其稻瘟病抗性。進(jìn)一步的，通過配組實(shí)現(xiàn)雜交種稻瘟病抗性的大幅度提高。本發(fā)明提供的基因組重組核酸片段與稻瘟病抗性緊密相關(guān)，可作為抗性資源應(yīng)用于其他品種的培育。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及分子生物學(xué)，具體地說，涉及一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段。
背景技術(shù)
長期以來，傳統(tǒng)育種的選擇方法主要依賴于田間表現(xiàn)型的評價，根據(jù)育種家個人經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行取舍，其最大的缺點(diǎn)在于耗時長，效率較低。要提高選擇的效率，最理想的方法應(yīng)是能夠直接對基因型進(jìn)行選擇。隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展，分子標(biāo)記為實(shí)現(xiàn)對基因型的直接選擇提供了可能。近年來，已開始應(yīng)用分子標(biāo)記輔助選擇方法來改良個別目標(biāo)性狀，能夠顯著的縮短育種年限。
稻瘟病是水稻最嚴(yán)重的病害之一，全球每年由稻瘟病引起的水稻產(chǎn)量損失占11％～30％，因此稻瘟病及其抗性的研究顯得尤為重要。隨著對稻瘟病研究的逐步深入，許多水稻抗稻瘟病基因DNA片段相繼被定位和克隆。其中，Pi1及Pik簇等位基因定位于水稻第11染色體長臂近末端區(qū)域(Hua等，Theoretical and Applied Genetics.2012,125:1047-1055；Li等，Molecular Breeding.2007,20:179-188；Alok等，F(xiàn)unctionalIntegrativeGenomics.2012,12:215-228；Yuan等，Theoretical and Applied Genetics.2011,122:1017-1028)。
為了提高育種的穩(wěn)定性、縮短育種過程和時間、有效利用水稻抗性資源，有必要對水稻在雜交育種中產(chǎn)生的稻瘟病抗性基因重組片段進(jìn)行研究，為能夠高效穩(wěn)定的實(shí)現(xiàn)水稻抗性育種提供有效手段。
發(fā)明內(nèi)容
為了解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的問題，本發(fā)明的目的是提供一種水稻抗稻瘟病重組核酸片段RecCR010374及其檢測引物與應(yīng)用。
為了實(shí)現(xiàn)本發(fā)明目的，本發(fā)明的技術(shù)方案如下：
第一方面，本發(fā)明提供一種重組核酸片段，其特征在于，其核苷酸序列包含SEQ IDNO.1所示450-614bp的序列或其片段、或其變體、或其互補(bǔ)序列。
作為優(yōu)選，其核苷酸序列包含SEQ ID NO.1所示的序列或其片段、或其變體、或其互補(bǔ)序列。SEQ ID NO.1所示的序列來自于‘中種恢629’和‘華130B’基因組區(qū)域交換產(chǎn)生的重組植株。
一般來講，特定核苷酸序列的變體將與該特定核苷酸序列具有至少約70％、75％、80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％或更高的序列同一性，或以上的互補(bǔ)序列。這樣的變體序列包括一個或多個核酸殘基的添加、缺失或替換，從而可以導(dǎo)致相應(yīng)的氨基酸殘基的添加、移除或替換。通過本領(lǐng)域內(nèi)已知的序列比對程序包括雜交技術(shù)確定序列同一性。實(shí)施方案的核苷酸序列變體與本發(fā)明的序列的差異可以少至1-15個核苷酸、少至1-10個(例如6-10個)，少至5個，少至4、3、2或甚至1個核苷酸。
第二方面，本發(fā)明提供了用于擴(kuò)增所述重組核酸片段的引物。
所述引物包括本領(lǐng)域技術(shù)人員針對該擴(kuò)增目標(biāo)可設(shè)計得到的所有引物。
當(dāng)擴(kuò)增目標(biāo)為SEQ ID NO.1所示序列時，所述引物可選自：
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