[發明專利]一種與水稻小種專化性抗稻瘟病基因緊密連鎖的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201610252190.5
• 申請日: 2016-04-21
• 公開（公告）號: CN105779622B
• 公開（公告）日: 2018-12-14
• 發明（設計）人: 鮑永美;張紅生;何彎彎;黃驥;王建飛;王州飛;程金平
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 徐冬濤;李曉峰

本發明屬于作物分子遺傳育種學領域，公開了一種與水稻小種專化性抗稻瘟病基因緊密連鎖的分子標記及其應用，包括如下步驟：(1)取水稻樣品，提取水稻樣品基因組DNA；(2)利用RM24019和RM24048中的任意一對分子標記的引物，對水稻樣品基因組DNA進行PCR擴增，PCR擴增產物進行電泳檢測，如果擴增出對應大小的分子標記DNA片段，標志著Pi?hk2(t)基因的存在。通過本發明提供的水稻小種專化性抗稻瘟病基因Pi?hk2的分子標記可以檢測水稻黑殼子粳及其雜交、回交和復交后代是否含有該基因，可預測其對稻瘟病的抗性水平，大大提高水稻抗稻瘟病材料的選擇效率，加快抗病育種進程。

技術領域

本發明屬于農作物分子遺傳育種學領域，涉及一種與水稻小種專化性抗稻瘟病基因緊密連鎖的分子標記及其應用。

背景技術

水稻是我國最重要的糧食作物之一，對保障我國糧食安全和國民經濟增長具有重要意義。稻瘟病是我國水稻生產上最嚴重的病害，具有傳播快、發生廣、危害重等特點(凌忠專等，1989，我國北方稻區稻瘟病菌生理小種研究.中國農業科學，22(3):7-13)。進一步發掘和利用我國抗稻瘟病基因資源，培育和種植抗病品種是控制稻瘟病發生和減少水稻產量損失最經濟有效的途徑。

迄今，各國科學家從水稻中鑒定了100多個抗稻瘟病基因，其中有24個抗病基因被成功克隆。這些抗病基因可以引入或聚合到現代品種，選育出高抗、廣譜的品種。但傳統育種方法費時、費力、表型鑒定困難、育種效率低，由于抗病基因多為顯性、基因間往往存在上位性互作，抗病基因聚合更為困難。通過分子標記輔助育種可以有效解決這一問題。

我國太湖流域稻作歷史悠久，被認為是粳稻起源地之一，蘊藏有豐富的稻種資源，李培富等(1999，兩個太湖流域粳稻地方品種抗稻瘟病的遺傳研究.中國水稻科學，13(1):11-14)報道我國太湖流域粳稻地方品種黑殼子粳對稻瘟病菌的抗性表現廣譜和高抗的特點。從我國特有的種質資源中鑒定和克隆抗稻瘟病基因，可以獲得具有自主知識產權的基因，對提高我國水稻抗稻瘟病育種水平，尤其是粳稻的抗稻瘟病育種有重大意義。

發明內容

本發明的目的在于提供一種一種用于檢測與水稻小種專化性抗稻瘟病基因緊密連鎖的分子標記的引物對或引物對組及其應用。

本發明的另一目的在于提供一種用于檢測或輔助檢測水稻小種專化性抗稻瘟病基因的試劑盒及其應用。

本發明的又一目的在于提供一種檢測水稻小種專化性抗稻瘟病基因或選擇水稻抗稻瘟病品種的分子標記方法及其應用。

本發明主要提供水稻品種黑殼子粳小種專化性抗稻瘟病基因Pi-hk2的分子標記方法。通過檢測與抗病基因Pi-hk2緊密連鎖的分子標記，可以確定有無抗病基因Pi-hk2，并預測水稻植株的稻瘟病抗性，加快抗稻瘟病水稻新品種的選育進度。

本發明的目的可通過如下技術方案實現：

一種用于檢測與水稻小種專化性抗稻瘟病基因緊密連鎖的分子標記的引物對或引物對組，所述的引物對為引物對A或引物對B；所述的引物對組由引物對A和引物對B組成；所述引物對A為由如SEQ ID NO.1所示的核苷酸片段和如SEQ ID NO.2所示的核苷酸片段組成的引物對；所述引物對B為由如SEQ ID NO.3所示的核苷酸片段和如SEQ ID NO.4所示的核苷酸片段組成的引物對。

表1為引物對及其所對應的分子標記

上述的引物對或引物對組在制備用于檢測或輔助檢測水稻小種專化性抗稻瘟病基因的試劑盒中的應用。

一種用于檢測或輔助檢測水稻小種專化性抗稻瘟病基因的試劑盒，該試劑盒包含有上述的引物對或引物對組。

上述的用于檢測或輔助檢測水稻小種專化性抗稻瘟病基因的試劑盒還包含有PCR技術常用的試劑。