[發(fā)明專利]利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201610248091.X | 申請(qǐng)日: | 2016-04-20 |
| 公開(公告)號(hào): | CN105734153A | 公開(公告)日: | 2016-07-06 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 孫子奎;王鋒;丁方美;李嫦娥;方婉 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 上海派森諾生物科技股份有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海伯瑞杰知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31227 | 代理人: | 吳澤群 |
| 地址: | 200231 上海市*** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 利用 基因 植物 進(jìn)行 種屬 鑒定 方法 | ||
1.一種利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,所述方法包括如下步驟:
S1、待測(cè)植物樣品基因組DNA提??;
S2、以待測(cè)植物樣品基因組DNA為模板,用針對(duì)rbcL基因序列設(shè)計(jì)的引物和/或針對(duì)matK基因序列設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
S3、回收PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,獲得目的DNA;
S4、利用基于Sanger雙脫氧鏈終止法對(duì)所述目的DNA進(jìn)行測(cè)序;將測(cè)序結(jié)果與公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì),根據(jù)同源性將待測(cè)植物鑒定到屬或種。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,步驟S2中,所述針對(duì)rbcL基因序列設(shè)計(jì)的引物包括如SEQIDNO.1所示的正向引物和如SEQIDNO.2所示的反向引物。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,步驟S2中,所述針對(duì)matK基因序列設(shè)計(jì)的引物包括如SEQIDNO.3所示的正向引物和如SEQIDNO.4所示的反向引物。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,步驟S2中,所述PCR擴(kuò)增中,每50.0ul擴(kuò)增反應(yīng)體系包括:基因組DNA1.0ul,含2.5mMMg2+的10×Buffer5.0ul,5u/μL的Taq聚合酶1.0ul,10mM的dNTP1.0ul,10uM的正向引物1.5ul,10uM的反向引物1.5ul,ddH2O39.0ul。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,步驟S2中,所述PCR擴(kuò)增中,PCR反應(yīng)參數(shù)為:預(yù)變性95℃,5min;變性95℃,30s;退火55℃,45s;延伸72℃,1min30s;終延伸72℃,7m;循環(huán)數(shù)45。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用基因?qū)χ参镞M(jìn)行種屬鑒定的方法,其特征在于,步驟S3中,所述回收是用AxyPrepDNA凝膠回收試劑盒進(jìn)行回收。
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