[發明專利]快速提取線粒體DNA的方法及其應用與相關試劑盒在審
| 申請號: | 201610246606.2 | 申請日: | 2016-04-20 |
| 公開(公告)號: | CN105779440A | 公開(公告)日: | 2016-07-20 |
| 發明(設計)人: | 艾南平;魏彥剛 | 申請(專利權)人: | 北京伯一科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京三友知識產權代理有限公司 11127 | 代理人: | 韓蕾;姚亮 |
| 地址: | 102600 北京市大興區中關村科*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 快速 提取 線粒體 dna 方法 及其 應用 相關 試劑盒 | ||
1.提取線粒體DNA的方法,所述方法包括如下步驟:
(1)將組織樣品或去除紅細胞后的血液樣品進行分散;
(2)在分散后的細胞樣品中加入裂解緩沖液,所述裂解緩沖液為包含Tris-HCl及 TritonX-100的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為19~21mM,其pH為8.7~8.9;該TritonX- 100的體積濃度為0.09~0.11%;或
所述裂解緩沖液為包含Tris-HCl及SDS的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為19~21mM, 其pH為8.7~8.9;該SDS的質量濃度為0.09%~0.11%;
(3)分離步驟(2)上清液,提取得到所述樣品的線粒體DNA。
2.根據權利要求1所述的提取線粒體DNA的方法,其中,步驟(2)中所述裂解緩沖液為包 含Tris-HCl及TritonX-100的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為20mM,其pH為8.8;該 TritonX-100的體積濃度為0.1%;或
所述裂解緩沖液為包含Tris-HCl及SDS的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為20mM,其pH 為8.8;該SDS的質量濃度為0.1%。
3.根據權利要求1或2所述的提取線粒體DNA的方法,其中,步驟(2)中分散后的細胞樣 品的體積與所述裂解緩沖液的體積比為8~10:1,優選9:1。
4.根據權利要求3所述的提取線粒體DNA的方法,其中,所述加熱是在95~100℃加熱9 ~11min;優選在100℃加熱10min。
5.提取線粒體DNA的試劑盒,其中,所述試劑盒包括裂解緩沖液(10×),所述裂解緩沖 液(10×)為包含Tris-HCl及TritonX-100的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為190~210mM, 其pH為8.7~8.9;該TritonX-100的體積濃度為0.9~1.1%;或
所述裂解緩沖液(10×)為包含Tris-HCl及SDS的水溶液,該Tris-HCl的摩爾濃度為190 ~210mM,其pH為8.7~8.9;該SDS的質量濃度為0.9%~1.1%;
優選地,該試劑盒還包括紅細胞裂解液。
6.提取線粒體DNA并進行PCR擴增的方法,所述方法包括如下步驟:
(a)利用權利要求1~4中任一項所述的提取線粒體DNA的方法提取得到線粒體DNA;
(b)以步驟(a)得到的線粒體DNA為模板,利用引物對1、引物對2及引物對3進行PCR擴 增;選擇性地,將所述線粒體DNA稀釋5~10倍;
其中,所述引物對1包括SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示序列:
SEQIDNO:1:GCCTACGACAAACAGACCTAAA;
SEQIDNO:2:GGTTGAGGGATA;
所述引物對2包括SEQIDNO:3和SEQIDNO:4所示序列:
SEQIDNO:3:CAATAGGATCCTCCCGAATCAA;
SEQIDNO:4:GTGTGGTCGGGTGTGTTATTA;
所述引物對3包括SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示序列:
SEQIDNO:5:CCTACTCCTCATTGTACCCATTC;
SEQIDNO:6:TGATGTAGAGGGTGATGGTAGA。
7.根據權利要求6所述的提取線粒體DNA并進行PCR擴增的方法,其中,所述PCR擴增采 用20μlPCR體系,所述PCR體系包括:
1.9~2.1μl所述裂解緩沖液、0.3~0.5μldNTP混合物、0.1~0.3μlDNA聚合酶、0.4~ 0.6μl所述引物對1、0.4~0.6μl所述引物對2、0.4~0.6μl所述引物對3、0.9~1.1μl所述模 板及余量的DEPC水;
優選地,所述PCR體系為2.0μl所述裂解緩沖液、0.4μldNTP混合物、0.2μlDNA聚合酶、 0.5μl所述引物對1、0.5μl所述引物對2、0.5μl所述引物對3、1μl所述模板及余量的DEPC水。
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