[發明專利]用于測定非小細胞肺癌預后的診斷方法

在審

• 申請號: 201610160180.9
• 申請日: 2010-10-25
• 公開（公告）號: CN105586433A
• 公開（公告）日: 2016-05-18
• 發明（設計）人: D.塞米納羅夫;盧欣;K.張;R.R.列斯涅夫斯基;J.S.庫恩
• 申請（專利權）人: 雅培制藥有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 權陸軍;徐厚才

1.一種預測就肺癌治療的患者中的疾病后果的方法，所述方法包括步驟：

a)提供來自患者的測試樣品；

b)測定所述測試樣品中細胞周期蛋白E1基因的拷貝數；

c)針對基線拷貝數2比較所述測試樣品中所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數，從而測 定所述測試樣品中關于所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的存在或不存在；和

d)基于所述測試樣品中關于所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的存在或不存 在，當與在所述細胞周期蛋白E1基因中不具有拷貝數增益的患者中疾病后果的基線測量比 較時，將所述患者鑒定為具有不良疾病后果的增加危險，其中所述細胞周期蛋白E1基因中 的拷貝數增益的存在預測不良疾病后果。

2.權利要求1的方法，其中所述不良疾病后果是當與不具有關于所述細胞周期蛋白E1 基因的拷貝數增益的患者的總體存活時間比較時減少的總體存活時間、和當與不具有關于 所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的患者的總體存活時間比較時更短的復發時間中 的至少一個。

3.一種預測就肺癌治療的患者中的治療后果的方法，所述方法包括步驟：

a)提供來自患者的測試樣品；

b)測定關于細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的存在或不存在；和

c)基于關于所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的存在或不存在，當與不具有關 于所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數增益的患者的總體存活時間比較時，測定所述患者是 具有減少的總體存活時間還是更短的復發時間的更高危險。

4.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述細胞周期蛋白E1基因位于染色體19，34.7 Mb-35.6Mb。

5.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述測試樣品包含組織樣品。

6.權利要求5的方法，其中所述組織樣品包含血液樣品、腫瘤組織或可疑腫瘤組織、薄 層細胞學樣品、細針抽吸物樣品、肺洗滌樣品、胸腔積液樣品、新鮮冷凍組織樣品、石蠟包埋 的組織樣品或由外周血樣品中任何一種產生的提取物或加工的樣品。

7.權利要求5的方法，其中所述組織樣品包括肺組織樣品或包含循環腫瘤細胞的外周 血樣品。

8.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述測定步驟(b)通過原位雜交執行。

9.權利要求8的方法，其中所述原位雜交用熒光標記的核酸探針執行。

10.權利要求8的方法，其中所述原位雜交用至少2種核酸探針執行。

11.權利要求8的方法，其中所述原位雜交用肽核酸探針執行。

12.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述測定步驟(b)通過聚合酶鏈反應執行。

13.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述測定步驟(b)通過核酸測序測定執行。

14.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述測定步驟(b)通過核酸微陣列測定執行。

15.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述肺癌是非小細胞肺癌。

16.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述癌癥選自鱗狀細胞癌、大細胞癌和腺癌。

17.權利要求1-3中任一項的方法，其中所述患者用化學療法、放射、手術或其任何組合 進行治療。

18.一種選擇用于患有肺癌的患者的治療的方法，所述方法包括步驟：

a)提供來自患者的測試樣品，其中用化學治療劑的治療是用于所述患者的至少一個 治療選項；

b)測定所述測試樣品中關于細胞周期蛋白E1基因的拷貝數；

c)針對基線拷貝數2比較所述測試樣品中所述細胞周期蛋白E1基因的拷貝數，從而測 定所述測試樣品中關于細胞周期蛋白E1的拷貝數增益的存在或不存在；和

d)基于步驟c)中的比較，確定化學療法治療方案。