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[發(fā)明專利]用于測定大豆疫霉菌無毒基因Avr3a對鑒別寄主L83-570致病性的分子方法有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201610143784.2 申請日: 2016-03-14
公開(公告)號: CN105671173B 公開(公告)日: 2019-04-05
發(fā)明(設(shè)計)人: 崔林開;胡艷紅;周洲;李永麗;鄭偉 申請(專利權(quán))人: 河南科技大學(xué)
主分類號: C12Q1/6895 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 洛陽公信知識產(chǎn)權(quán)事務(wù)所(普通合伙) 41120 代理人: 張燕
地址: 471000 河*** 國省代碼: 河南;41
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 用于 測定 大豆 霉菌 無毒 基因 avr3a 鑒別 寄主 l83 570 致病性 分子 方法
【權(quán)利要求書】:

1.用于測定大豆疫霉菌無毒基因Avr3a對鑒別寄主L83-570致病性的分子方法,其特征在于:采用CTAB法提取待檢測大豆疫霉菌的基因組DNA;然后設(shè)計一對特異性引物AVR3A1F/AVR3A1R,所述的一對特異性引物AVR3A1F/AVR3A1R的堿基序列分別為:

AVR3A1F:5ˊ-ATCGAAGCCATATATCTACAGG-3ˊ;

AVR3A1R:5ˊ-CCTACTGTATGCAAAGTGATCG-3ˊ;

以提取的基因組DNA為模版進行PCR擴增,所述的一對特異性引物AVR3A1F/AVR3A1R分別結(jié)合在無毒基因Avr3a的上游和下游,從而使PCR擴增出的DNA片段包括完整的無毒基因Avr3a;用限制性內(nèi)切酶BmgBI酶切擴增出的DNA片段,得到酶切產(chǎn)物;對酶切產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,得到酶切產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖;觀察酶切產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖,如果在250bp-500bp范圍內(nèi)有2條DNA條帶,則對應(yīng)的待檢測大豆疫霉菌菌株對鑒別寄主L83-570表現(xiàn)為不致病;如果酶切后在750bp以下有1條DNA條帶,則對應(yīng)的待檢測大豆疫霉菌菌株對鑒別寄主L83-570表現(xiàn)為致病。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于測定大豆疫霉菌無毒基因Avr3a對鑒別寄主L83-570致病性的分子方法,其特征在于:所述CTAB法提取待檢測大豆疫霉菌基因組DNA的具體步驟為:

(1)從培養(yǎng)5-7天的待檢測大豆疫霉菌菌落邊緣切取10-20塊直徑2×2mm菌絲塊,移入裝有100mL澄清的10% V8液體培養(yǎng)基的三角瓶中,置于25℃黑暗條件下、120 r/min震蕩培養(yǎng)5-7天,培養(yǎng)好的菌絲體用滅菌雙層紗布過濾收集,蒸餾水沖洗1次,經(jīng)冷凍干燥后充分搗碎成菌絲粉;所述的10% V8液體培養(yǎng)基指用蒸餾水稀釋10倍的美國Campbell公司生產(chǎn)的V8蔬菜汁;

(2)取50mg的菌絲粉于1.5ml EP管中,加入900μL質(zhì)量濃度為2%的CTAB提取液和90μL質(zhì)量濃度為10%的SDS水溶液后漩渦混合器上充分混勻;

(3)55-60℃水浴1h,每15min振蕩混勻一次;

(4)12000 r/min離心10min,取上清液A,加入苯酚、氯仿和異戊醇三者的混合物抽提1次,所加入的苯酚、氯仿和異戊醇三者的混合物中苯酚、氯仿和異戊醇的重量比為25:24:1,苯酚、氯仿和異戊醇三者混合物的體積與上清液A的體積相等;

(5)12000 r/min離心10min,吸取上清液B,加入氯仿抽提1次,所加入氯仿的體積與上清液B的體積相等;

(6)12000 r/min離心10min,吸取上清液C,加入3mol/L的NaAc水溶液和冰無水乙醇過夜沉淀基因組DNA,所加入NaAc水溶液和冰無水乙醇與上清液C的體積比為0.1:2:1;

(7)用預(yù)冷的體積比為70%的乙醇水溶液洗滌兩次,然后置于37℃條件下干燥;

(8)干燥后的DNA用100μL含50μg/mL核糖核酸酶的ddH2O溶解,37℃靜置1h后,置于-20℃冰箱中備用。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于測定大豆疫霉菌無毒基因Avr3a對鑒別寄主L83-570致病性的分子方法,其特征在于:所述PCR擴增的擴增體系和擴增條件分別為:

擴增體系:稀釋10倍的PCR反應(yīng)緩沖液,2.5μL;2.5mmol/L的MgCl2,1.5μL;2.5mmol/L的dNTPs,0.5μL;5U/μL的Taq DNA聚合酶,0.2μL;10μmol/L的特異性引物AVR3A1F和AVR3A1R各0.5μL;模板DNA,0.5μL;加無菌超純水至25μL;

擴增條件:95℃變性30S,60℃退火30S,72℃延伸30S,30個循環(huán),72℃延伸5min。

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