[發明專利]刺參ITGB基因、編碼蛋白及其克隆方法和重組刺參ITGB基因工程菌構建方法有效
| 申請號: | 201610118991.2 | 申請日: | 2016-03-02 |
| 公開(公告)號: | CN105713907B | 公開(公告)日: | 2019-05-28 |
| 發明(設計)人: | 李成華;王振輝;張衛衛;邵銥娜;李曄;呂志猛 | 申請(專利權)人: | 寧波大學 |
| 主分類號: | C12N15/12 | 分類號: | C12N15/12;C12N15/10;C07K14/705;C12N15/70 |
| 代理公司: | 寧波奧圣專利代理事務所(普通合伙) 33226 | 代理人: | 何仲 |
| 地址: | 315211 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 刺參 itgb 基因 編碼 蛋白 及其 克隆 方法 重組 基因工程 構建 | ||
1.一種刺參ITGB基因,其特征在于該基因為SEQIDNO.1所示的cDNA序列。
2.一種權利要求1所述的刺參ITGB基因的克隆方法,其特征在于:根據與ITGB基因同源的表達序列標簽EST序列設計基因特異性引物,采用RACE技術擴增基因全長,具體的步驟如下:
(1)通過對燦爛弧菌誘導刺參血細胞cDNA文庫的表達序列標簽分析,發現了多條編碼ITGB基因的表達序列標簽序列,選取編碼刺參ITGB部分片段的表達序列標簽克隆;
(2)RACE引物設計:根據編碼刺參ITGB部分片段的表達序列標簽克隆設計RACE的巢式引物:3’上游特異性引物1:GGTTCATTGTCAAATCGGAG,3’上游特異性引物2:GATTACGTCGCTCTGGTCCA,5’下游特異性引物1:CCAACAATTCTGCAACCTCCG,
5’下游特異性引物2:TGCAACAAGGGGCACTTGGAG,擴增3’接頭引物Adaptor3:TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT,擴增5’接頭引物Adaptor5:CATGGCTACATGCTGACAGCCTA;
(3)RACE擴增獲取ITGB基因全長序列,具體步驟如下:
a.總RNA提取:取刺參體腔液制備得到RNA提取液;
b.3’-RACE擴增:將RNA提取液用3’-Full RACE Core Set with PrimeScriptTMRTase試劑盒逆轉錄合成擴增3’的模板,以此為模板,使用3’上游特異性引物1和擴增3’接頭引物進行PCR擴增,取PCR稀釋后的產物1ul作為模板,再用3’上游特異性引物2和擴增3’接頭引物進行PCR擴增得到3’端目的條帶;
c.5’-RACE擴增:將上述RNA提取液用5’-Full RACE Kit試劑盒逆轉錄合成擴增5’的模板,具體合成方法依試劑盒說明書操作,以此為模板,使用5’下游特異性引物1和Adaptor5進行PCR擴增,取PCR產物稀釋后1ul作為模板,再用5’下游特異性引物2和Adaptor5進行PCR得到5’端目的條帶;
d.將上述擴增產物的目的條帶用膠回收試劑盒回收,回收產物與載體pMD18-T連接,轉化至大腸桿菌Escherichia coli DH5α后,在含有氨芐濃度為50μg/mL的LB平板培養基中培養8-12h,挑取陽性克隆菌落,進行RCR驗證并送至上海生物工程有限公司測序,所得結果經DNAMAN軟件分析拼接得刺參ITGB基因全長序列,其基因序列如SEQIDNO.1所示,其中LB平板培養基配方為胰蛋白胨10g/L、酵母提取物5g/L、NaCl 10g/L。
3.根據權利要求2所述的一種刺參ITGB基因的克隆方法,其特征在于RACE擴增反應體系:模板1.0μL,10×PCR緩沖液2.5μL,濃度25mM的MgCl2 2.0μL,濃度10mM的dNTP 2.0μL,濃度10μM的特異性引物1.0μL,濃度10μM的接頭引物1.0μL,濃度5U/μL的DNA聚合酶0.2μL,超純水:15.3μL;擴增條件:94℃3min、94℃30s、60℃30s、72℃1min,共35個循環,最后72℃延伸10min。
4.一種權利要求1所述的刺參ITGB基因的編碼蛋白,其特征在于:該編碼蛋白為SEQIDNO.2所示的氨基酸序列。
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