[發明專利]CLCA2蛋白在人宮頸癌siha細胞中表達的檢測方法及應用在審
| 申請號: | 201610117463.5 | 申請日: | 2016-02-24 |
| 公開(公告)號: | CN105648083A | 公開(公告)日: | 2016-06-08 |
| 發明(設計)人: | 王芳 | 申請(專利權)人: | 蘭州大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/17;A61P35/00 |
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| 地址: | 730030 甘*** | 國省代碼: | 甘肅;62 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | clca2 蛋白 宮頸癌 siha 細胞 表達 檢測 方法 應用 | ||
1.CLCA2蛋白在人宮頸癌siha細胞中表達的檢測方法,其特征在于,包括以下的具體步 驟:
(1)利用基因芯片實驗檢測不同濃度的異喹啉類生物堿異紫堇堿對HPV16Siha細胞處 理后差異基因表達譜的改變;以干燥禿瘡花為原料,利用乙醇提取法和硅膠柱色譜分離法 進行異喹啉類生物堿的提取和異紫堇堿的分離,得到異紫堇堿,SiHa細胞株生長到對數生 長期,密度達80%時用濃度為800μmol/L的異紫堇堿處理,將樣本分為四組,分別是:①未經 異紫堇堿處理的SiHa細胞,②經異紫堇堿處理12小時后的SiHa細胞,③經異紫堇堿處理24 小時后的SiHa細胞,④經異紫堇堿處理48小時后的SiHa細胞,分別以Trizol法裂解后收集 樣品,采用HumanTranscriptomeArray2.0表達譜芯片篩選表達差異的 mRNA;
(2)利用RT-PCR法檢測藥物干預前后細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直 接克隆及特定基因的cDNA序列;以5000個/孔將細胞種進96孔板中,培養24h后,棄去舊培養 液,加入濃度為800μmol/L的異紫堇定堿干預,分別培養12h,24h,48h,用BioTeke的RNA提取 試劑盒抽提總RNA,首先,用槍頭吸盡培養基,向各孔中加入125μl*2的Buffer,再用槍頭吸 盡CellAmpTMWashingBuffer,后向各孔中加50μl的Processing溶液,反復吹打 Processing液后,移至微量離心管中,75℃水浴5min,分裝得到的細胞裂解液,以便后續反 轉錄實驗,同時每組均設定復孔;5μgRNA被反轉錄成cDNA10μl體系,其反轉錄體系包括:5 ×PrimeScriptTMBuffer2μl,PrimeScriptTMRTEnzymeMixI0.5μl,50μMOligodT Primer0.5μl,Random6mers0.5μl,RNaseFreedH2O4.5μl,cDNA2μl,反轉錄條件37 ℃、15min,85℃、5秒,再以cDNA為模板進行特異性擴增,其擴增反應20μl體系由:Tap酶10μ l,Forwardprimer0.4μl,Reverseprimer0.4μl,Rox0.4μl,ddH2O6.8μl,and2μlcDNA 模板組成,需要擴增目的基因的引物序列和退火溫度由Tablel給出,β-actin被擴增作為對 照,熒光實時PCR反應結束后,由系統分析軟件確定閾值,進而確定各反應樣本的CT值,采用 相對定量的2-ΔΔCT法分析PCR結果,確定各樣本之間基因的表達差異;
公式:ΔCT=(CTTarget-CTActin)
ΔΔCT=(CTTarget-CTActin)Timex-(CTTarget-CTActin)TimeO
2-ΔΔCT表示的是實驗組目的基因的表達相對于對照組的變化倍數。
表1引物及擴增產物的大小
(3)通過WesternBlot法觀察HPV病毒致瘤基因E6蛋白表達的變化;細胞總蛋白以RIPA 裂解液提取,蛋白定量依據Bradfordsmethod以BSA作為標準對照,在570nm波長處測其吸 光度值,計算樣品中的蛋白含量后將每個樣本以RIPA液稀釋為5μg/μl,每個樣本80μl的總 蛋白與20μl蛋白上樣緩沖液混勻后置于100℃沸水煮10min進行變性,蛋白電泳用80V跑濃 縮膠,120V跑分離膠,每個泳道上樣量為40μg/20μl,轉膜采用0.45μmPVDF膜,100V恒壓,4 ℃,1.5h,轉完膜后用TBST將膜浸洗一次,放入5%脫脂奶粉-TBST緩沖液中25℃搖床封閉 1h,封閉完全后,按1∶500稀釋比加入兔抗人CLCA2一抗,4℃搖床慢速震蕩孵育12h,以TBST 緩沖液漂洗后將膜放入按1∶10000稀釋好的山羊抗兔二抗雜交液體中25℃搖床孵育2h,蛋 白條帶用ECL發光液進行顯像,最后用X線暗盒曝光成像,蛋白條帶判定由預染分子量的 Marker提供參考,利用Image-proplus6.0軟件來分析各條帶的OD值。
2.CLCA2蛋白在制備預防和治療宮頸癌的藥物組合物中的應用。
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