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[發明專利]基于代謝物及基因表達篩選三七皂苷合成關鍵基因的方法在審

專利信息
申請號: 201610114420.1 申請日: 2016-03-01
公開(公告)號: CN105671159A 公開(公告)日: 2016-06-15
發明(設計)人: 齊煉文;陸續;王寧;李萍 申請(專利權)人: 中國藥科大學
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;G01N30/02
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 211198 江蘇*** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 基于 代謝物 基因 表達 篩選 三七 皂苷 合成 關鍵 方法
【權利要求書】:

1.一種基于代謝物及基因表達篩選三七皂苷合成關鍵基因的方法,其特征在于包括如 下步驟:

(1)分析三七不同部位三萜皂苷類物質代謝輪廓;

(2)分析皂苷合成途徑關鍵基因在三七不同部位的表達譜;

(3)構建基因表達和皂苷的代謝相關圖,篩選出三七中皂苷合成關鍵基因。

2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于:所述代謝輪廓采用高效液相色譜-質譜聯 用系統進行,所述表達譜采用熒光定量PCR進行,所述相關圖采用典型關聯分析進行。

3.根據權利要求1所述的方法,所述不同部位包括:葉、葉柄及根。

4.根據權利要求1所述的方法,所述關鍵基因包括:法尼基焦磷酸合酶(FPS)、鯊烯合酶 (SQS)、鯊烯環氧酶(SE)、達瑪烷二醇合成酶(DS)、細胞色素P450氧化酶(CYP716A53)。

5.根據權利要求2所述的方法,其特征還在于采用高效液相色譜-質譜聯用系統對三七 樣品的甲醇提取物進行分析。

6.根據權利要求2所述的方法,所述定量分析具體是分別提取樣品RNA,再將RNA反轉錄 合成第一鏈cDNA,以cDNA為模板,進行實時熒光定量PCR。

7.根據權利要求1所述的方法,其特征在于步驟(3)中所述的基因表達量和皂苷代謝量 的相關關系網絡圖的構建,是通過典型關聯分析將三七皂苷含量與皂苷合成途徑關鍵基因 表達量相結合而分析得到的,具體是使用皮爾遜相關系數對皂苷含量及皂苷合成途徑關鍵 基因表達量進行典型相關分析,變量相關系數高于0.5作為篩選關鍵合成基因的標準。

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