[發明專利]一種用于鑒別豬種及其毛色的基因MC1R的SNP標記及方法和應用

在審

• 申請號: 201610105978.3
• 申請日: 2016-02-26
• 公開（公告）號: CN105648071A
• 公開（公告）日: 2016-06-08
• 發明（設計）人: 李晶;寧眺;陳善元;趙智勇
• 申請（專利權）人: 昆明學院;云南妙哉科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京國智京通知識產權代理有限公司 11501
• 代理人: 孫文彬

技術領域

本發明屬于動物基因工程與分子生物學技術領域，具體涉及一種用于鑒別豬種及其 毛色的基因MC1R的SNP標記，本發明還涉及一種用于鑒別豬種及其毛色的基因MC1R 的SNP標記引物，本發明還涉及一種用于鑒別豬種及其毛色的基因MC1R的SNP標記 方法，本發明還涉及一種用于鑒別豬種及其毛色的基因MC1R的SNP標記的應用。

背景技術

豬與人類的關系密不可分，并在人類進化的各個時期都扮演了重要角色。直到今天， 養豬仍是很多貧困地區致富的有效途徑。據聯合國糧農組織對世界糧食與農業動物遺傳 資源狀況的統計，全世界大約有十億頭家豬，每七個人一頭。亞洲家豬數量占世界的66％， 其中絕大多數在中國，而越南、印度和菲律賓也有相當數量的家豬分布。歐洲及高加索 擁有家豬數量占世界20％，美洲占15％。全世界家豬品種大約有541種，占所記錄世界 哺乳類品種數的12％。亞洲家豬品種最多占世界的41％，其次為歐洲與高加索地區，大 概占世界32％；其余地區占剩余的15％。(聯合國糧食與農業組織，2007)。

目前全世界分布最廣的五大品種全部來自歐洲和北美，依次為英國大白豬(117個 國家)、美國杜洛克(93個國家)、瑞典長白豬(91個國家)、美國漢普夏(54個國家) 和德國皮特蘭(35個國家)。東亞家豬的數量雖然龐大(超過世界總數的一半以上)，但 沒有一個品種分布排在前21位中。然而亞洲豬種對世界的貢獻巨大，許多歐洲豬品種都 含有中國家豬的血統。(聯合國糧食與農業組織，2007)。

中國是世界上家豬品種資源最豐富的國家之一，我國在20世紀80年代初完成的豬 種資源普查，被認可后公布的地方品種有118個，國家承認并載入《中國豬品種志》的 地方品種有48個，培育品種12個，引入品種6個，合計66個(張仲葛,1986)。地方 品種指原產于我國的土著品種，根據其來源、分布、體質、外形和生產性能分為六個類 型；培育品種是利用我國的地方品種與國外引進良種雜交選育而成的新品種。引進品種 則是由國外直接引入的品種。

毛色對野豬和家豬都具有重要意義。馴化使家豬的毛色表型與野豬相比發生了顯著 的改變(Andersson,2001；Diamond,2002)。對野豬來說，毛色具有非常重要的生態與行為 適應性，并至少提供了三大類的功能(隱蔽、交流、生理調控)(Stoneretal.,2003)。相 反，家豬的毛色若受到人工選擇作用，則主要代表人類的需求與文化偏好(InnanandKim, 2004)。馴化會在分子水平留下人工選擇或群體事件對馴化目標基因的印記。通過對比馴 化基因在家豬與野豬中的變異模式與遺傳多樣性，可以了解家豬毛色變異的分子遺傳基 礎。

動物的皮毛之所以有豐富多彩的顏色，是體內含有多種色素造成的。動物體內的色 素有多種，其中與毛色有關的主要是酪氨酸源性色素，并以黑色素及其衍生物最重要。 分布于毛囊內的黑色素細胞是黑色素的制造者。首先經過一系列的酶學反應生成黑色素 小體，并最終生成黑色素。黑色素又分為兩種：一種是褐黑色素(phaeomelanin)，為易 溶于堿性溶液的圓形紅色顆粒，產生黃色和紅色兩種毛色；另一種是真黑色素 (eumelanin)，由酪氨酸和苯丙氨酸經一系列氨化酶的作用形成，比褐黑色素難溶解，產 生黑色與褐色兩種顏色。真黑色素/褐黑色素的種類、含量與分布在動物皮毛中的多態性， 導致了動物不同的毛色類型。

目前對于豬的毛色類型還沒有標準的分類原則，有多種不同的分類方法。根據現有 資料整理，我們大致將豬的毛色分為以下十類。并且對國外家豬品種與中國家豬品種的 主要毛色類型進行了統計，結果顯示在統計的國外家豬54個品種中白色23個(占 42.59％)，黑白花9個(占16.7％)，白色黑斑7個(占12.96％)，其余為暗紅色或黑色。 中國家豬72個土著品種中純凈黑色45個(占62.5％)，黑白花色25個(占34.72％)， 白色僅2個(占2.7％)。